35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6670 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_6670  hypothetical protein  100 
 
 		 330 aa  650    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3858  terminase GpA  98.11 
 
 		 692 aa  323  2e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5775  terminase GpA  98.11 
 
 		 689 aa  323  2e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0279  terminase GpA  77.5 
 
 		 692 aa  258  9e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5774  hypothetical protein  94.05 
 
 		 84 aa  159  7e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3859  hypothetical protein  85.88 
 
 		 85 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0280  hypothetical protein  63.1 
 
 		 84 aa  102  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.280925  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0853  bacteriophage-like protein  39.66 
 
 		 660 aa  95.9  7e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0455431 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3209  terminase GpA  38.51 
 
 		 651 aa  95.9  9e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2658  prophage LambdaMc01, terminase, large subunit  36.78 
 
 		 656 aa  94.7  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0731  putative phage terminase large subunit  29.38 
 
 		 626 aa  87  3e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0597  prophage LambdaW4, terminase large subunit, putative  33.75 
 
 		 607 aa  84.7  0.000000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.201542  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0810  phage terminase GpA  31.43 
 
 		 614 aa  77.4  0.0000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00486859 
 
 
-
 
NC_002978  WD0265  prophage LambdaW1, terminase large subunit, putative  32.5 
 
 		 608 aa  77  0.0000000000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2899  phage terminase GpA  29.81 
 
 		 618 aa  64.7  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.481651 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1257  phage terminase GpA  29.19 
 
 		 618 aa  63.2  0.000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.268782 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1322  phage terminase GpA  29.19 
 
 		 618 aa  62.4  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0526731 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2820  phage terminase GpA  29.19 
 
 		 618 aa  62.4  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2579  phage terminase GpA  29.19 
 
 		 618 aa  60.8  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20081 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2050  phage terminase GpA  29.19 
 
 		 618 aa  60.5  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0184089 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2748  phage terminase GpA  28.57 
 
 		 618 aa  59.3  0.00000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00692747 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1889  terminase GpA  28.75 
 
 		 675 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0378909  hitchhiker  0.0000599128 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2094  Phage terminase large subunit (GpA)  29.03 
 
 		 708 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0401019  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1042  Phage terminase GpA  27.85 
 
 		 665 aa  53.9  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0571086  normal  0.208633 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1302  phage terminase GpA  29.56 
 
 		 650 aa  53.1  0.000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.656027 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3042  terminase, large subunit, putative  26.09 
 
 		 678 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.32998  normal  0.381128 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1153  phage-related terminase large subunit  27.85 
 
 		 650 aa  52.8  0.000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0414  phage-related terminase large subunit  27.85 
 
 		 650 aa  52.8  0.000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4922  terminase GpA  22.84 
 
 		 616 aa  52.8  0.000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0380287 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1173  terminase GpA  27.85 
 
 		 650 aa  52  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1195  terminase GpA  25.47 
 
 		 680 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.992301  normal  0.0460399 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3412  terminase, large subunit  26.09 
 
 		 674 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1170  terminase GpA  26.35 
 
 		 684 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4687  terminase GpA  27.01 
 
 		 698 aa  47.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2514  terminase GpA  22.22 
 
 		 604 aa  43.5  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>