83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A2094 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_1889  terminase GpA  69.83 
 
 		 675 aa  942    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0378909  hitchhiker  0.0000599128 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2094  Phage terminase large subunit (GpA)  100 
 
 		 708 aa  1469    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0401019  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1042  Phage terminase GpA  43.45 
 
 		 665 aa  509  1e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0571086  normal  0.208633 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3858  terminase GpA  40.59 
 
 		 692 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5775  terminase GpA  39.97 
 
 		 689 aa  444  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0279  terminase GpA  41.43 
 
 		 692 aa  433  1e-120  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2820  phage terminase GpA  36.36 
 
 		 618 aa  373  1e-102  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2748  phage terminase GpA  36.21 
 
 		 618 aa  370  1e-101  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00692747 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2050  phage terminase GpA  36.36 
 
 		 618 aa  372  1e-101  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0184089 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2899  phage terminase GpA  36.88 
 
 		 618 aa  368  1e-100  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.481651 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1322  phage terminase GpA  36.57 
 
 		 618 aa  366  1e-100  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0526731 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1257  phage terminase GpA  36.4 
 
 		 618 aa  367  1e-100  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.268782 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2579  phage terminase GpA  36.57 
 
 		 618 aa  365  2e-99  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20081 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4922  terminase GpA  35.14 
 
 		 616 aa  338  2.9999999999999997e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0380287 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1203  phage terminase GpA  35.2 
 
 		 614 aa  333  5e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2514  terminase GpA  30.35 
 
 		 604 aa  299  1e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0414  phage-related terminase large subunit  31.18 
 
 		 650 aa  287  5.999999999999999e-76  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1153  phage-related terminase large subunit  31.18 
 
 		 650 aa  287  5.999999999999999e-76  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1173  terminase GpA  31 
 
 		 650 aa  286  1.0000000000000001e-75  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1302  phage terminase GpA  31.3 
 
 		 650 aa  284  4.0000000000000003e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.656027 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0731  putative phage terminase large subunit  33.28 
 
 		 626 aa  265  2e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3412  terminase, large subunit  32.86 
 
 		 674 aa  256  9e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2309  phage terminase GpA  30.8 
 
 		 605 aa  255  2.0000000000000002e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1779  phage terminase GpA  31.83 
 
 		 593 aa  249  1e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0453691  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2658  prophage LambdaMc01, terminase, large subunit  32.33 
 
 		 656 aa  246  8e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1195  terminase GpA  30.72 
 
 		 680 aa  244  3e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.992301  normal  0.0460399 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3042  terminase, large subunit, putative  31.07 
 
 		 678 aa  243  1e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.32998  normal  0.381128 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0853  bacteriophage-like protein  31.16 
 
 		 660 aa  239  2e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0455431 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2392  phage terminase GpA  30.19 
 
 		 587 aa  234  5e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0265  prophage LambdaW1, terminase large subunit, putative  30.74 
 
 		 608 aa  232  1e-59  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3209  terminase GpA  31.47 
 
 		 651 aa  233  1e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0810  phage terminase GpA  31.62 
 
 		 614 aa  231  3e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00486859 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2230  phage terminase large subunit (GpA)  28.55 
 
 		 654 aa  222  9.999999999999999e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0597  prophage LambdaW4, terminase large subunit, putative  28.22 
 
 		 607 aa  218  2e-55  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.201542  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0131  phage terminase GpA  28.78 
 
 		 592 aa  215  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2815  phage terminase large subunit  28.05 
 
 		 643 aa  211  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.326238 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3337  phage terminase GpA  27.96 
 
 		 1179 aa  209  2e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.27063  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1877  phage terminase GpA  28.75 
 
 		 662 aa  203  7e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3176  phage terminase GpA  29.28 
 
 		 693 aa  201  3e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1454  phage terminase large subunit (GpA)  27.8 
 
 		 642 aa  200  6e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1286  phage terminase large subunit (GpA)  26.73 
 
 		 642 aa  194  4e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1170  terminase GpA  27.71 
 
 		 684 aa  194  5e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1675  phage terminase GpA  25.58 
 
 		 660 aa  192  2e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1108  terminase GpA  28.55 
 
 		 639 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2042  terminase GpA  28 
 
 		 641 aa  191  4e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.324943  normal  0.0895639 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2257  phage terminase GpA  28.66 
 
 		 725 aa  189  2e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.305557  normal  0.307973 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2091  terminase GpA  27.97 
 
 		 641 aa  183  9.000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.11571  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10036  DNA packaging protein  27.97 
 
 		 641 aa  183  1e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.722543  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00731  hypothetical protein  27.97 
 
 		 641 aa  183  1e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.634997  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1783  phage terminase large subunit  28.08 
 
 		 641 aa  182  1e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0374719 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1620  phage terminase large subunit  27.82 
 
 		 641 aa  183  1e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0047658 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0780  terminase GpA  25.75 
 
 		 665 aa  179  1e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.366774 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0784  phage terminase GpA  25.6 
 
 		 665 aa  178  3e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0205779 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3601  phage terminase GpA  25.6 
 
 		 665 aa  177  4e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0753  phage terminase GpA  25.78 
 
 		 665 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3252  phage terminase GpA  24.84 
 
 		 634 aa  169  1e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0598  terminase GpA  26.94 
 
 		 720 aa  159  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0672  Phage terminase GpA  25.15 
 
 		 725 aa  154  7e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0832  phage terminase large subunit (GpA)  26.85 
 
 		 529 aa  153  8e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.325192  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01978  hypothetical protein  24.3 
 
 		 635 aa  151  3e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1688  terminase GpA  26.09 
 
 		 699 aa  145  3e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1056  phage terminase GpA  24.09 
 
 		 641 aa  138  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.172605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1660  phage terminase GpA  23.31 
 
 		 680 aa  116  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.284129 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4687  terminase GpA  24.56 
 
 		 698 aa  114  6e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0896  phage terminase large subunit  24.86 
 
 		 700 aa  107  9e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6601  putative phage terminase large subunit  23.56 
 
 		 677 aa  107  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3205  phage terminase large subunit  24.67 
 
 		 707 aa  103  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00573168 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3136  phage terminase large subunit  24.67 
 
 		 707 aa  103  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000155862 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1861  phage terminase large subunit  24.67 
 
 		 707 aa  103  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000286067 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0692  phage terminase large subunit  24.74 
 
 		 709 aa  100  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000410433 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1506  phage terminase GpA  24.33 
 
 		 711 aa  95.1  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.397253  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2193  phage terminase GpA  21.77 
 
 		 685 aa  92.4  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.457009  hitchhiker  0.0000566612 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2311  Phage terminase large subunit (gp15)  25.04 
 
 		 671 aa  89  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3066  putative phage terminase GpA  26.64 
 
 		 700 aa  73.2  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.267291  hitchhiker  0.000127261 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1140  phage terminase large subunit  30.17 
 
 		 713 aa  70.5  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1405  phage terminase large subunit  22.18 
 
 		 713 aa  69.7  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000837607 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1068  phage terminase large subunit  22.18 
 
 		 713 aa  69.7  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000112902 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2463  terminase GpA  23.61 
 
 		 690 aa  67.4  0.0000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4146  terminase GpA  22.46 
 
 		 692 aa  66.6  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.195337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6527  terminase GpA  26.55 
 
 		 697 aa  65.9  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289331  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3357  phage terminase GpA  19.91 
 
 		 720 aa  64.7  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.27922 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3781  putative phage terminase large subunit  19.7 
 
 		 720 aa  63.5  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6670  hypothetical protein  29.03 
 
 		 330 aa  55.8  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>