83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_0832 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_10036  DNA packaging protein  99.04 
 
 		 641 aa  1082    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.722543  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00731  hypothetical protein  99.04 
 
 		 641 aa  1082    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.634997  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1783  phage terminase large subunit  97.5 
 
 		 641 aa  1062    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0374719 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1620  phage terminase large subunit  99.04 
 
 		 641 aa  1080    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0047658 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2815  phage terminase large subunit  67.95 
 
 		 643 aa  775    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.326238 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1454  phage terminase large subunit (GpA)  68.84 
 
 		 642 aa  766    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1286  phage terminase large subunit (GpA)  68.13 
 
 		 642 aa  783    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2091  terminase GpA  99.04 
 
 		 641 aa  1083    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.11571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0832  phage terminase large subunit (GpA)  100 
 
 		 529 aa  1106    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.325192  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2042  terminase GpA  77.48 
 
 		 641 aa  880    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.324943  normal  0.0895639 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3601  phage terminase GpA  52.42 
 
 		 665 aa  568  1e-160  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0753  phage terminase GpA  52.23 
 
 		 665 aa  566  1e-160  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0784  phage terminase GpA  52.23 
 
 		 665 aa  565  1e-160  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0205779 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0780  terminase GpA  52.04 
 
 		 665 aa  561  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.366774 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1675  phage terminase GpA  50.66 
 
 		 660 aa  561  1e-158  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3252  phage terminase GpA  52.87 
 
 		 634 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2230  phage terminase large subunit (GpA)  41.81 
 
 		 654 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01978  hypothetical protein  37.04 
 
 		 635 aa  332  7.000000000000001e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4687  terminase GpA  35.59 
 
 		 698 aa  288  2e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1042  Phage terminase GpA  34.57 
 
 		 665 aa  274  3e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0571086  normal  0.208633 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2514  terminase GpA  29.68 
 
 		 604 aa  217  5e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3068  tail assembly chaperone gp38  100 
 
 		 247 aa  217  5e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.577916  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1203  phage terminase GpA  31.36 
 
 		 614 aa  215  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0731  putative phage terminase large subunit  29.89 
 
 		 626 aa  192  1e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1302  phage terminase GpA  28.71 
 
 		 650 aa  187  4e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.656027 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2658  prophage LambdaMc01, terminase, large subunit  28.93 
 
 		 656 aa  186  8e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0853  bacteriophage-like protein  30.12 
 
 		 660 aa  184  4.0000000000000006e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0455431 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1257  phage terminase GpA  29.11 
 
 		 618 aa  181  2.9999999999999997e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.268782 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2899  phage terminase GpA  29.39 
 
 		 618 aa  179  8e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.481651 
 
 
-
 
NC_002978  WD0265  prophage LambdaW1, terminase large subunit, putative  29.38 
 
 		 608 aa  177  3e-43  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0810  phage terminase GpA  30.49 
 
 		 614 aa  177  4e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00486859 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0131  phage terminase GpA  27.79 
 
 		 592 aa  177  4e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3209  terminase GpA  28.41 
 
 		 651 aa  174  2.9999999999999996e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4922  terminase GpA  28.19 
 
 		 616 aa  171  3e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0380287 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2748  phage terminase GpA  28.46 
 
 		 618 aa  169  9e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00692747 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1322  phage terminase GpA  28.54 
 
 		 618 aa  169  2e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0526731 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2579  phage terminase GpA  27.89 
 
 		 618 aa  168  2e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20081 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2820  phage terminase GpA  28.16 
 
 		 618 aa  168  2.9999999999999998e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2050  phage terminase GpA  27.7 
 
 		 618 aa  167  4e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0184089 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1779  phage terminase GpA  27.39 
 
 		 593 aa  167  4e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0453691  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2309  phage terminase GpA  26.22 
 
 		 605 aa  163  6e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0597  prophage LambdaW4, terminase large subunit, putative  27.27 
 
 		 607 aa  156  7e-37  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.201542  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2094  Phage terminase large subunit (GpA)  26.85 
 
 		 708 aa  153  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0401019  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2392  phage terminase GpA  25.29 
 
 		 587 aa  153  7e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3337  phage terminase GpA  25.83 
 
 		 1179 aa  148  3e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.27063  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1195  terminase GpA  27.22 
 
 		 680 aa  147  5e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.992301  normal  0.0460399 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0598  terminase GpA  27.76 
 
 		 720 aa  146  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3042  terminase, large subunit, putative  26.82 
 
 		 678 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.32998  normal  0.381128 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1173  terminase GpA  26.28 
 
 		 650 aa  142  1.9999999999999998e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1170  terminase GpA  25.42 
 
 		 684 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3412  terminase, large subunit  27.51 
 
 		 674 aa  137  4e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1153  phage-related terminase large subunit  25.37 
 
 		 650 aa  137  4e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0414  phage-related terminase large subunit  25.37 
 
 		 650 aa  137  4e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1889  terminase GpA  26.46 
 
 		 675 aa  136  8e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0378909  hitchhiker  0.0000599128 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3176  phage terminase GpA  26.42 
 
 		 693 aa  132  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3858  terminase GpA  26.46 
 
 		 692 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6601  putative phage terminase large subunit  25.16 
 
 		 677 aa  128  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5775  terminase GpA  25.73 
 
 		 689 aa  124  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1688  terminase GpA  24.09 
 
 		 699 aa  123  9.999999999999999e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1660  phage terminase GpA  23.7 
 
 		 680 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.284129 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2257  phage terminase GpA  24.78 
 
 		 725 aa  109  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.305557  normal  0.307973 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0279  terminase GpA  24.79 
 
 		 692 aa  104  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1108  terminase GpA  24.38 
 
 		 639 aa  101  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0672  Phage terminase GpA  25.78 
 
 		 725 aa  100  5e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1056  phage terminase GpA  23.87 
 
 		 641 aa  100  5e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.172605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1877  phage terminase GpA  24.09 
 
 		 662 aa  97.1  8e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3066  putative phage terminase GpA  25.82 
 
 		 700 aa  89.4  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.267291  hitchhiker  0.000127261 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2193  phage terminase GpA  24.33 
 
 		 685 aa  82  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.457009  hitchhiker  0.0000566612 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1506  phage terminase GpA  25 
 
 		 711 aa  78.6  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.397253  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1140  phage terminase large subunit  23.54 
 
 		 713 aa  72  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2463  terminase GpA  24.16 
 
 		 690 aa  70.9  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1861  phage terminase large subunit  24 
 
 		 707 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000286067 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3136  phage terminase large subunit  24 
 
 		 707 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000155862 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3205  phage terminase large subunit  24 
 
 		 707 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00573168 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1405  phage terminase large subunit  23.18 
 
 		 713 aa  65.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000837607 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1068  phage terminase large subunit  23.18 
 
 		 713 aa  65.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000112902 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0896  phage terminase large subunit  24.71 
 
 		 700 aa  65.1  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0692  phage terminase large subunit  22.22 
 
 		 709 aa  62.4  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000410433 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4146  terminase GpA  22.92 
 
 		 692 aa  62.8  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.195337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6527  terminase GpA  22.33 
 
 		 697 aa  52  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289331  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3781  putative phage terminase large subunit  21.2 
 
 		 720 aa  47.4  0.0007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3357  phage terminase GpA  21.58 
 
 		 720 aa  45.8  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.27922 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1355  Bacteriophage tail assembly protein-like protein  20.52 
 
 		 565 aa  45.1  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00357201  hitchhiker  0.000000000207538 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>