48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1355 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_1355  Bacteriophage tail assembly protein-like protein  100 
 
 
565 aa  1184    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00357201  hitchhiker  0.000000000207538 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6601  putative phage terminase large subunit  22.68 
 
 
677 aa  81.6  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4922  terminase GpA  24.78 
 
 
616 aa  81.3  0.00000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0380287 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3337  phage terminase GpA  25.45 
 
 
1179 aa  76.6  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.27063  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1203  phage terminase GpA  23.43 
 
 
614 aa  72.8  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1779  phage terminase GpA  22.42 
 
 
593 aa  70.5  0.00000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0453691  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0131  phage terminase GpA  24.49 
 
 
592 aa  65.1  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1286  phage terminase large subunit (GpA)  21.69 
 
 
642 aa  64.3  0.000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1056  phage terminase GpA  21.57 
 
 
641 aa  63.2  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.172605  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2748  phage terminase GpA  21.59 
 
 
618 aa  62  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00692747 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2309  phage terminase GpA  25.76 
 
 
605 aa  61.6  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2050  phage terminase GpA  21.27 
 
 
618 aa  61.2  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0184089 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2820  phage terminase GpA  21.27 
 
 
618 aa  60.1  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1322  phage terminase GpA  21.9 
 
 
618 aa  59.3  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0526731 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2579  phage terminase GpA  21.57 
 
 
618 aa  59.3  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.20081 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2899  phage terminase GpA  21.98 
 
 
618 aa  58.9  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.481651 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0853  bacteriophage-like protein  22.44 
 
 
660 aa  58.9  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0455431 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3209  terminase GpA  22.59 
 
 
651 aa  58.5  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1257  phage terminase GpA  22.22 
 
 
618 aa  55.8  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.268782 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3042  terminase, large subunit, putative  26 
 
 
678 aa  55.5  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.32998  normal  0.381128 
 
 
-
 
NC_002978  WD0597  prophage LambdaW4, terminase large subunit, putative  22.91 
 
 
607 aa  55.1  0.000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.201542  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2815  phage terminase large subunit  22.45 
 
 
643 aa  54.3  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.326238 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0692  phage terminase large subunit  21.73 
 
 
709 aa  54.3  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000410433 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1302  phage terminase GpA  21.19 
 
 
650 aa  53.9  0.000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.656027 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2658  prophage LambdaMc01, terminase, large subunit  21.33 
 
 
656 aa  53.1  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3066  putative phage terminase GpA  20.68 
 
 
700 aa  53.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.267291  hitchhiker  0.000127261 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1195  terminase GpA  24.5 
 
 
680 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.992301  normal  0.0460399 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2463  terminase GpA  21.32 
 
 
690 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1454  phage terminase large subunit (GpA)  21.83 
 
 
642 aa  52.8  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3412  terminase, large subunit  25.47 
 
 
674 aa  51.2  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2392  phage terminase GpA  22.66 
 
 
587 aa  50.4  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0265  prophage LambdaW1, terminase large subunit, putative  20.63 
 
 
608 aa  48.5  0.0003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0810  phage terminase GpA  22.62 
 
 
614 aa  48.5  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00486859 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2193  phage terminase GpA  22.47 
 
 
685 aa  47  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.457009  hitchhiker  0.0000566612 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1170  terminase GpA  23.08 
 
 
684 aa  46.2  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2042  terminase GpA  20.2 
 
 
641 aa  45.8  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.324943  normal  0.0895639 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1620  phage terminase large subunit  21.04 
 
 
641 aa  45.4  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0047658 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2091  terminase GpA  20.52 
 
 
641 aa  45.1  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.11571  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0832  phage terminase large subunit (GpA)  20.52 
 
 
529 aa  45.1  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.325192  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10036  DNA packaging protein  20.52 
 
 
641 aa  45.1  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.722543  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00731  hypothetical protein  20.52 
 
 
641 aa  45.1  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.634997  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0414  phage-related terminase large subunit  19.91 
 
 
650 aa  44.7  0.005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1153  phage-related terminase large subunit  19.91 
 
 
650 aa  44.7  0.005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1173  terminase GpA  19.91 
 
 
650 aa  44.7  0.005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4146  terminase GpA  24.22 
 
 
692 aa  44.7  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.195337  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1108  terminase GpA  22.64 
 
 
639 aa  44.7  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1042  Phage terminase GpA  19.58 
 
 
665 aa  44.7  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0571086  normal  0.208633 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1783  phage terminase large subunit  20.77 
 
 
641 aa  43.9  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0374719 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>