84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1056 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1056  phage terminase GpA  100 
 
 		 641 aa  1333    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.172605  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0265  prophage LambdaW1, terminase large subunit, putative  27.7 
 
 		 608 aa  170  6e-41  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0597  prophage LambdaW4, terminase large subunit, putative  27.47 
 
 		 607 aa  169  2e-40  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.201542  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2579  phage terminase GpA  28.87 
 
 		 618 aa  163  9e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20081 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1322  phage terminase GpA  29.3 
 
 		 618 aa  162  1e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0526731 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4922  terminase GpA  27.03 
 
 		 616 aa  161  4e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0380287 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1203  phage terminase GpA  26.25 
 
 		 614 aa  158  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2050  phage terminase GpA  28.03 
 
 		 618 aa  158  4e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0184089 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2820  phage terminase GpA  28.51 
 
 		 618 aa  157  5.0000000000000005e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2748  phage terminase GpA  28.09 
 
 		 618 aa  157  8e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00692747 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2658  prophage LambdaMc01, terminase, large subunit  27.18 
 
 		 656 aa  154  5.9999999999999996e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3209  terminase GpA  26.68 
 
 		 651 aa  151  5e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0853  bacteriophage-like protein  27.07 
 
 		 660 aa  149  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0455431 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0731  putative phage terminase large subunit  26.21 
 
 		 626 aa  148  3e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3858  terminase GpA  27.05 
 
 		 692 aa  146  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5775  terminase GpA  27 
 
 		 689 aa  145  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1302  phage terminase GpA  28.19 
 
 		 650 aa  144  4e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.656027 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2899  phage terminase GpA  26.96 
 
 		 618 aa  143  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.481651 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1257  phage terminase GpA  28.18 
 
 		 618 aa  142  1.9999999999999998e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.268782 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1170  terminase GpA  26.2 
 
 		 684 aa  140  7.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1042  Phage terminase GpA  24.34 
 
 		 665 aa  139  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0571086  normal  0.208633 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1889  terminase GpA  24.69 
 
 		 675 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0378909  hitchhiker  0.0000599128 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2094  Phage terminase large subunit (GpA)  24.09 
 
 		 708 aa  138  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0401019  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2514  terminase GpA  24.4 
 
 		 604 aa  136  9.999999999999999e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1195  terminase GpA  24.76 
 
 		 680 aa  134  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.992301  normal  0.0460399 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1173  terminase GpA  25.08 
 
 		 650 aa  130  7.000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0414  phage-related terminase large subunit  24.67 
 
 		 650 aa  129  2.0000000000000002e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1153  phage-related terminase large subunit  24.67 
 
 		 650 aa  129  2.0000000000000002e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0810  phage terminase GpA  28.26 
 
 		 614 aa  123  9.999999999999999e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00486859 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0279  terminase GpA  24.42 
 
 		 692 aa  122  3e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3042  terminase, large subunit, putative  25.32 
 
 		 678 aa  120  6e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.32998  normal  0.381128 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3176  phage terminase GpA  26.43 
 
 		 693 aa  119  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1779  phage terminase GpA  25.1 
 
 		 593 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0453691  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3412  terminase, large subunit  25.91 
 
 		 674 aa  111  5e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2309  phage terminase GpA  24.74 
 
 		 605 aa  109  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3337  phage terminase GpA  26.07 
 
 		 1179 aa  106  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.27063  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1454  phage terminase large subunit (GpA)  22.22 
 
 		 642 aa  102  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0672  Phage terminase GpA  24.74 
 
 		 725 aa  102  3e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1620  phage terminase large subunit  24.06 
 
 		 641 aa  102  3e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0047658 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10036  DNA packaging protein  23.87 
 
 		 641 aa  101  4e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.722543  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00731  hypothetical protein  23.87 
 
 		 641 aa  101  4e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.634997  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2091  terminase GpA  23.87 
 
 		 641 aa  101  4e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.11571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1783  phage terminase large subunit  24.26 
 
 		 641 aa  101  5e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0374719 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0832  phage terminase large subunit (GpA)  23.87 
 
 		 529 aa  100  7e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.325192  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3601  phage terminase GpA  22.64 
 
 		 665 aa  99.8  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0780  terminase GpA  22.46 
 
 		 665 aa  99.4  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.366774 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0784  phage terminase GpA  22.46 
 
 		 665 aa  98.6  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0205779 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0753  phage terminase GpA  22.46 
 
 		 665 aa  98.2  4e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1506  phage terminase GpA  23.57 
 
 		 711 aa  97.4  7e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.397253  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3066  putative phage terminase GpA  23.93 
 
 		 700 aa  96.3  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.267291  hitchhiker  0.000127261 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2311  Phage terminase large subunit (gp15)  22.42 
 
 		 671 aa  95.9  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0131  phage terminase GpA  24.05 
 
 		 592 aa  94.7  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2815  phage terminase large subunit  21.36 
 
 		 643 aa  95.1  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.326238 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1877  phage terminase GpA  22.5 
 
 		 662 aa  94.4  6e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1675  phage terminase GpA  22.55 
 
 		 660 aa  92  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2230  phage terminase large subunit (GpA)  22.61 
 
 		 654 aa  92  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2042  terminase GpA  23.2 
 
 		 641 aa  89.4  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.324943  normal  0.0895639 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1140  phage terminase large subunit  23.02 
 
 		 713 aa  87.4  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4146  terminase GpA  23.65 
 
 		 692 aa  86.7  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.195337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1108  terminase GpA  21.98 
 
 		 639 aa  86.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2392  phage terminase GpA  23.75 
 
 		 587 aa  86.3  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1068  phage terminase large subunit  22.86 
 
 		 713 aa  84.7  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000112902 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1405  phage terminase large subunit  22.86 
 
 		 713 aa  84.7  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000837607 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0598  terminase GpA  23.57 
 
 		 720 aa  84.7  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1286  phage terminase large subunit (GpA)  20.75 
 
 		 642 aa  84.7  0.000000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01978  hypothetical protein  21.31 
 
 		 635 aa  83.2  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6601  putative phage terminase large subunit  22.35 
 
 		 677 aa  82.4  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3252  phage terminase GpA  21.19 
 
 		 634 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0896  phage terminase large subunit  22.99 
 
 		 700 aa  81.3  0.00000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1861  phage terminase large subunit  22.61 
 
 		 707 aa  79.3  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000286067 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3136  phage terminase large subunit  22.76 
 
 		 707 aa  79.3  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000155862 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3205  phage terminase large subunit  22.61 
 
 		 707 aa  79.3  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00573168 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2193  phage terminase GpA  24.56 
 
 		 685 aa  77  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.457009  hitchhiker  0.0000566612 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1688  terminase GpA  23.69 
 
 		 699 aa  76.3  0.000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0692  phage terminase large subunit  22.7 
 
 		 709 aa  75.1  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000410433 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3357  phage terminase GpA  25.61 
 
 		 720 aa  75.5  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.27922 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3781  putative phage terminase large subunit  25.69 
 
 		 720 aa  74.7  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2463  terminase GpA  22.2 
 
 		 690 aa  73.6  0.000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2257  phage terminase GpA  21.24 
 
 		 725 aa  68.9  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.305557  normal  0.307973 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3430  terminase GpA  29.13 
 
 		 748 aa  67.8  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6527  terminase GpA  23.1 
 
 		 697 aa  67.8  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289331  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4687  terminase GpA  20.55 
 
 		 698 aa  67  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1355  Bacteriophage tail assembly protein-like protein  21.57 
 
 		 565 aa  63.2  0.00000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00357201  hitchhiker  0.000000000207538 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1660  phage terminase GpA  20.58 
 
 		 680 aa  57.8  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.284129 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>