71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_01978 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_01978  hypothetical protein  100 
 
 		 635 aa  1326    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2230  phage terminase large subunit (GpA)  43.35 
 
 		 654 aa  499  1e-140  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3252  phage terminase GpA  41.35 
 
 		 634 aa  452  1e-125  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0753  phage terminase GpA  39.14 
 
 		 665 aa  433  1e-120  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3601  phage terminase GpA  39.14 
 
 		 665 aa  434  1e-120  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0784  phage terminase GpA  39.14 
 
 		 665 aa  433  1e-120  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0205779 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0780  terminase GpA  40.03 
 
 		 665 aa  432  1e-120  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.366774 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1675  phage terminase GpA  39.67 
 
 		 660 aa  431  1e-119  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10036  DNA packaging protein  37.71 
 
 		 641 aa  385  1e-105  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.722543  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2091  terminase GpA  37.71 
 
 		 641 aa  385  1e-105  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.11571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1783  phage terminase large subunit  36.78 
 
 		 641 aa  385  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0374719 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00731  hypothetical protein  37.71 
 
 		 641 aa  385  1e-105  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.634997  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1620  phage terminase large subunit  36.78 
 
 		 641 aa  383  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0047658 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1454  phage terminase large subunit (GpA)  35.39 
 
 		 642 aa  381  1e-104  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1286  phage terminase large subunit (GpA)  35.02 
 
 		 642 aa  375  1e-102  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2815  phage terminase large subunit  33.33 
 
 		 643 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.326238 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2042  terminase GpA  35.78 
 
 		 641 aa  365  1e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.324943  normal  0.0895639 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0832  phage terminase large subunit (GpA)  37.04 
 
 		 529 aa  332  9e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.325192  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1042  Phage terminase GpA  31.57 
 
 		 665 aa  269  1e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0571086  normal  0.208633 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4687  terminase GpA  30.51 
 
 		 698 aa  229  9e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2899  phage terminase GpA  30.92 
 
 		 618 aa  225  2e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.481651 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1257  phage terminase GpA  31.21 
 
 		 618 aa  224  4.9999999999999996e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.268782 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0731  putative phage terminase large subunit  30.73 
 
 		 626 aa  211  3e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2050  phage terminase GpA  28.96 
 
 		 618 aa  202  9.999999999999999e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0184089 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2820  phage terminase GpA  29.12 
 
 		 618 aa  201  3e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4922  terminase GpA  27.29 
 
 		 616 aa  201  3.9999999999999996e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0380287 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2748  phage terminase GpA  29.62 
 
 		 618 aa  199  1.0000000000000001e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00692747 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2579  phage terminase GpA  29.43 
 
 		 618 aa  197  4.0000000000000005e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20081 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3209  terminase GpA  28.77 
 
 		 651 aa  196  9e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1322  phage terminase GpA  29.95 
 
 		 618 aa  196  2e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0526731 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2658  prophage LambdaMc01, terminase, large subunit  28.64 
 
 		 656 aa  194  4e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2514  terminase GpA  27.12 
 
 		 604 aa  192  2e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0853  bacteriophage-like protein  27.85 
 
 		 660 aa  184  6e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0455431 
 
 
-
 
NC_002978  WD0265  prophage LambdaW1, terminase large subunit, putative  27.71 
 
 		 608 aa  182  1e-44  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1779  phage terminase GpA  26.79 
 
 		 593 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0453691  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0597  prophage LambdaW4, terminase large subunit, putative  27.21 
 
 		 607 aa  179  1e-43  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.201542  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1203  phage terminase GpA  26.34 
 
 		 614 aa  179  2e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1173  terminase GpA  27.11 
 
 		 650 aa  177  5e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1195  terminase GpA  27.61 
 
 		 680 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.992301  normal  0.0460399 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1153  phage-related terminase large subunit  27.12 
 
 		 650 aa  174  3.9999999999999995e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0414  phage-related terminase large subunit  27.12 
 
 		 650 aa  174  3.9999999999999995e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3042  terminase, large subunit, putative  27.13 
 
 		 678 aa  172  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.32998  normal  0.381128 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1302  phage terminase GpA  27.77 
 
 		 650 aa  167  5e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.656027 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0810  phage terminase GpA  27.56 
 
 		 614 aa  165  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00486859 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2392  phage terminase GpA  26.17 
 
 		 587 aa  163  9e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2309  phage terminase GpA  25 
 
 		 605 aa  162  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0131  phage terminase GpA  26.25 
 
 		 592 aa  160  6e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2094  Phage terminase large subunit (GpA)  24.3 
 
 		 708 aa  151  3e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0401019  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3412  terminase, large subunit  26.25 
 
 		 674 aa  150  5e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3858  terminase GpA  25.42 
 
 		 692 aa  144  4e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5775  terminase GpA  25 
 
 		 689 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0279  terminase GpA  25.9 
 
 		 692 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1889  terminase GpA  25.69 
 
 		 675 aa  137  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0378909  hitchhiker  0.0000599128 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3337  phage terminase GpA  25.3 
 
 		 1179 aa  137  7.000000000000001e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.27063  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1170  terminase GpA  24.92 
 
 		 684 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3176  phage terminase GpA  24.84 
 
 		 693 aa  136  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0672  Phage terminase GpA  26.4 
 
 		 725 aa  130  7.000000000000001e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0598  terminase GpA  24.64 
 
 		 720 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1108  terminase GpA  24.75 
 
 		 639 aa  102  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1660  phage terminase GpA  23.31 
 
 		 680 aa  102  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.284129 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1688  terminase GpA  24.01 
 
 		 699 aa  100  7e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2257  phage terminase GpA  22.87 
 
 		 725 aa  94  7e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.305557  normal  0.307973 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6601  putative phage terminase large subunit  22.59 
 
 		 677 aa  90.1  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1877  phage terminase GpA  23.21 
 
 		 662 aa  89  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1056  phage terminase GpA  21.31 
 
 		 641 aa  83.2  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.172605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6527  terminase GpA  21.96 
 
 		 697 aa  58.5  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289331  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3068  tail assembly chaperone gp38  37.84 
 
 		 247 aa  57  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.577916  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1506  phage terminase GpA  21.98 
 
 		 711 aa  55.1  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.397253  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0692  phage terminase large subunit  21.43 
 
 		 709 aa  52.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000410433 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2311  Phage terminase large subunit (gp15)  21.03 
 
 		 671 aa  50.1  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4146  terminase GpA  22.67 
 
 		 692 aa  48.1  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.195337  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>