86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0810 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2658  prophage LambdaMc01, terminase, large subunit  55.95 
 
 		 656 aa  652    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0853  bacteriophage-like protein  54.33 
 
 		 660 aa  639    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0455431 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3209  terminase GpA  55.47 
 
 		 651 aa  647    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0810  phage terminase GpA  100 
 
 		 614 aa  1249    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00486859 
 
 
-
 
NC_002978  WD0265  prophage LambdaW1, terminase large subunit, putative  47.15 
 
 		 608 aa  556  1e-157  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0597  prophage LambdaW4, terminase large subunit, putative  47.56 
 
 		 607 aa  551  1e-155  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.201542  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0731  putative phage terminase large subunit  47.73 
 
 		 626 aa  525  1e-148  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2899  phage terminase GpA  47.62 
 
 		 618 aa  474  1e-132  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.481651 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1257  phage terminase GpA  47.09 
 
 		 618 aa  469  1.0000000000000001e-131  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.268782 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2050  phage terminase GpA  44.98 
 
 		 618 aa  465  9.999999999999999e-131  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0184089 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2579  phage terminase GpA  47.27 
 
 		 618 aa  465  1e-129  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20081 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2748  phage terminase GpA  45.14 
 
 		 618 aa  464  1e-129  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00692747 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1322  phage terminase GpA  47.09 
 
 		 618 aa  459  9.999999999999999e-129  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0526731 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2820  phage terminase GpA  44.66 
 
 		 618 aa  462  9.999999999999999e-129  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3042  terminase, large subunit, putative  37.64 
 
 		 678 aa  362  1e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.32998  normal  0.381128 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1195  terminase GpA  36.64 
 
 		 680 aa  349  1e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.992301  normal  0.0460399 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0279  terminase GpA  35.83 
 
 		 692 aa  342  1e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5775  terminase GpA  34.64 
 
 		 689 aa  331  3e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3858  terminase GpA  34.36 
 
 		 692 aa  328  3e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1170  terminase GpA  33.33 
 
 		 684 aa  319  9e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3412  terminase, large subunit  35.91 
 
 		 674 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2514  terminase GpA  33.8 
 
 		 604 aa  306  7e-82  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4922  terminase GpA  33.01 
 
 		 616 aa  302  1e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0380287 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1042  Phage terminase GpA  34.96 
 
 		 665 aa  286  8e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0571086  normal  0.208633 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1203  phage terminase GpA  36.6 
 
 		 614 aa  271  2e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0598  terminase GpA  36.03 
 
 		 720 aa  267  5e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3176  phage terminase GpA  32.66 
 
 		 693 aa  256  7e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1779  phage terminase GpA  30.36 
 
 		 593 aa  244  5e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0453691  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1302  phage terminase GpA  33.39 
 
 		 650 aa  243  1e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.656027 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0672  Phage terminase GpA  31.13 
 
 		 725 aa  237  4e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1688  terminase GpA  32.51 
 
 		 699 aa  236  1.0000000000000001e-60  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2309  phage terminase GpA  30 
 
 		 605 aa  235  2.0000000000000002e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6601  putative phage terminase large subunit  31.94 
 
 		 677 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2392  phage terminase GpA  30.48 
 
 		 587 aa  234  4.0000000000000004e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2094  Phage terminase large subunit (GpA)  31.62 
 
 		 708 aa  231  2e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0401019  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1173  terminase GpA  32.01 
 
 		 650 aa  227  4e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1153  phage-related terminase large subunit  31.25 
 
 		 650 aa  226  7e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0414  phage-related terminase large subunit  31.25 
 
 		 650 aa  226  7e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1877  phage terminase GpA  29.98 
 
 		 662 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1889  terminase GpA  30.11 
 
 		 675 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0378909  hitchhiker  0.0000599128 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0131  phage terminase GpA  30.09 
 
 		 592 aa  213  9e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1454  phage terminase large subunit (GpA)  30.51 
 
 		 642 aa  212  1e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1108  terminase GpA  29.71 
 
 		 639 aa  211  3e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3337  phage terminase GpA  29.44 
 
 		 1179 aa  210  6e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.27063  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1286  phage terminase large subunit (GpA)  30.2 
 
 		 642 aa  207  4e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2042  terminase GpA  29.02 
 
 		 641 aa  200  5e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.324943  normal  0.0895639 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00731  hypothetical protein  29.4 
 
 		 641 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.634997  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10036  DNA packaging protein  29.4 
 
 		 641 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.722543  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2091  terminase GpA  29.4 
 
 		 641 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.11571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1620  phage terminase large subunit  29.23 
 
 		 641 aa  197  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0047658 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1783  phage terminase large subunit  29.18 
 
 		 641 aa  196  7e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0374719 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1660  phage terminase GpA  26.63 
 
 		 680 aa  189  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.284129 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2815  phage terminase large subunit  29.23 
 
 		 643 aa  188  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.326238 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2257  phage terminase GpA  32.01 
 
 		 725 aa  182  1e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.305557  normal  0.307973 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3252  phage terminase GpA  27.53 
 
 		 634 aa  179  2e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0832  phage terminase large subunit (GpA)  30.49 
 
 		 529 aa  177  4e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.325192  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1675  phage terminase GpA  26.95 
 
 		 660 aa  177  7e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4687  terminase GpA  26.69 
 
 		 698 aa  177  7e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2311  Phage terminase large subunit (gp15)  27.18 
 
 		 671 aa  175  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0780  terminase GpA  27.09 
 
 		 665 aa  172  2e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.366774 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0784  phage terminase GpA  27.17 
 
 		 665 aa  171  5e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0205779 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3601  phage terminase GpA  27.17 
 
 		 665 aa  170  9e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0753  phage terminase GpA  27 
 
 		 665 aa  168  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01978  hypothetical protein  27.56 
 
 		 635 aa  165  3e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2230  phage terminase large subunit (GpA)  26.07 
 
 		 654 aa  160  9e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1506  phage terminase GpA  26.27 
 
 		 711 aa  131  3e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.397253  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1056  phage terminase GpA  28.61 
 
 		 641 aa  123  8e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.172605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2193  phage terminase GpA  24.13 
 
 		 685 aa  113  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.457009  hitchhiker  0.0000566612 
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6527  terminase GpA  28.24 
 
 		 697 aa  108  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289331  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1861  phage terminase large subunit  25 
 
 		 707 aa  103  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000286067 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3136  phage terminase large subunit  25 
 
 		 707 aa  103  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000155862 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3205  phage terminase large subunit  25 
 
 		 707 aa  103  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00573168 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4146  terminase GpA  28.82 
 
 		 692 aa  101  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.195337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3066  putative phage terminase GpA  29.66 
 
 		 700 aa  90.1  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.267291  hitchhiker  0.000127261 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1140  phage terminase large subunit  26.34 
 
 		 713 aa  89.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1405  phage terminase large subunit  26.08 
 
 		 713 aa  88.6  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000837607 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1068  phage terminase large subunit  26.08 
 
 		 713 aa  88.6  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000112902 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0896  phage terminase large subunit  23.15 
 
 		 700 aa  86.7  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0692  phage terminase large subunit  28.08 
 
 		 709 aa  81.3  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000410433 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2463  terminase GpA  26.65 
 
 		 690 aa  78.6  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6670  hypothetical protein  31.43 
 
 		 330 aa  77  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3357  phage terminase GpA  24.63 
 
 		 720 aa  71.2  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.27922 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3781  putative phage terminase large subunit  23.9 
 
 		 720 aa  68.2  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3430  terminase GpA  25.49 
 
 		 748 aa  65.1  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03899  product of A truncated bacteriophage gene protein  58.18 
 
 		 97 aa  63.9  0.000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.670346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1355  Bacteriophage tail assembly protein-like protein  22.62 
 
 		 565 aa  48.5  0.0004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00357201  hitchhiker  0.000000000207538 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>