85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4922 on replicon NC_009829
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009829  Spro_4922  terminase GpA  100 
 
 		 616 aa  1277    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0380287 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1203  phage terminase GpA  44.07 
 
 		 614 aa  472  1e-132  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2579  phage terminase GpA  41.54 
 
 		 618 aa  445  1e-123  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20081 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1322  phage terminase GpA  41.47 
 
 		 618 aa  444  1e-123  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0526731 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2050  phage terminase GpA  41.3 
 
 		 618 aa  440  9.999999999999999e-123  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0184089 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2820  phage terminase GpA  41.06 
 
 		 618 aa  440  9.999999999999999e-123  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2899  phage terminase GpA  41.47 
 
 		 618 aa  439  9.999999999999999e-123  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.481651 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2748  phage terminase GpA  41.13 
 
 		 618 aa  438  1e-121  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00692747 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1257  phage terminase GpA  41.81 
 
 		 618 aa  438  1e-121  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.268782 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2514  terminase GpA  38.03 
 
 		 604 aa  422  1e-117  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0265  prophage LambdaW1, terminase large subunit, putative  38.8 
 
 		 608 aa  385  1e-105  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1042  Phage terminase GpA  39.52 
 
 		 665 aa  382  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0571086  normal  0.208633 
 
 
-
 
NC_002978  WD0597  prophage LambdaW4, terminase large subunit, putative  38.14 
 
 		 607 aa  374  1e-102  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.201542  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0731  putative phage terminase large subunit  36.15 
 
 		 626 aa  362  1e-98  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1302  phage terminase GpA  34.69 
 
 		 650 aa  342  2e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.656027 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2094  Phage terminase large subunit (GpA)  35.14 
 
 		 708 aa  338  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0401019  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1153  phage-related terminase large subunit  35.08 
 
 		 650 aa  337  5e-91  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0414  phage-related terminase large subunit  35.08 
 
 		 650 aa  337  5e-91  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1173  terminase GpA  35.08 
 
 		 650 aa  335  1e-90  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2658  prophage LambdaMc01, terminase, large subunit  34.7 
 
 		 656 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1889  terminase GpA  34.44 
 
 		 675 aa  327  3e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0378909  hitchhiker  0.0000599128 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0853  bacteriophage-like protein  34.7 
 
 		 660 aa  328  3e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0455431 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3209  terminase GpA  34.43 
 
 		 651 aa  322  9.000000000000001e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1195  terminase GpA  33.02 
 
 		 680 aa  317  5e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.992301  normal  0.0460399 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3042  terminase, large subunit, putative  34.54 
 
 		 678 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.32998  normal  0.381128 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3176  phage terminase GpA  35.24 
 
 		 693 aa  303  4.0000000000000003e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0810  phage terminase GpA  33.01 
 
 		 614 aa  302  1e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00486859 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3412  terminase, large subunit  34.16 
 
 		 674 aa  301  3e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2309  phage terminase GpA  32.14 
 
 		 605 aa  293  8e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0131  phage terminase GpA  32.59 
 
 		 592 aa  290  6e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1779  phage terminase GpA  32.33 
 
 		 593 aa  290  7e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0453691  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3858  terminase GpA  30.47 
 
 		 692 aa  289  9e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1170  terminase GpA  32.8 
 
 		 684 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5775  terminase GpA  29.9 
 
 		 689 aa  283  5.000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0279  terminase GpA  30.07 
 
 		 692 aa  267  5e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2392  phage terminase GpA  31.16 
 
 		 587 aa  262  1e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3337  phage terminase GpA  31.3 
 
 		 1179 aa  251  2e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.27063  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1286  phage terminase large subunit (GpA)  29.5 
 
 		 642 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1454  phage terminase large subunit (GpA)  29.66 
 
 		 642 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0780  terminase GpA  28.68 
 
 		 665 aa  228  3e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.366774 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0784  phage terminase GpA  28.5 
 
 		 665 aa  228  4e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0205779 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3252  phage terminase GpA  28.94 
 
 		 634 aa  227  4e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0753  phage terminase GpA  28.82 
 
 		 665 aa  227  5.0000000000000005e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3601  phage terminase GpA  28.66 
 
 		 665 aa  227  6e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2815  phage terminase large subunit  29.61 
 
 		 643 aa  225  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.326238 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1675  phage terminase GpA  29.67 
 
 		 660 aa  218  2e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1620  phage terminase large subunit  29.05 
 
 		 641 aa  217  5e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0047658 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00731  hypothetical protein  29.22 
 
 		 641 aa  217  5e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.634997  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2091  terminase GpA  29.22 
 
 		 641 aa  217  5e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.11571  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10036  DNA packaging protein  29.22 
 
 		 641 aa  217  5e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.722543  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1108  terminase GpA  30.23 
 
 		 639 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1783  phage terminase large subunit  28.74 
 
 		 641 aa  216  9.999999999999999e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0374719 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1877  phage terminase GpA  27.74 
 
 		 662 aa  211  4e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2042  terminase GpA  28.03 
 
 		 641 aa  201  1.9999999999999998e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.324943  normal  0.0895639 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01978  hypothetical protein  27.29 
 
 		 635 aa  201  3e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0672  Phage terminase GpA  26.57 
 
 		 725 aa  195  2e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2230  phage terminase large subunit (GpA)  25.78 
 
 		 654 aa  195  2e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2257  phage terminase GpA  28.48 
 
 		 725 aa  193  8e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.305557  normal  0.307973 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6601  putative phage terminase large subunit  29.01 
 
 		 677 aa  189  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4687  terminase GpA  26.96 
 
 		 698 aa  188  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0598  terminase GpA  27.32 
 
 		 720 aa  187  3e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0832  phage terminase large subunit (GpA)  28.19 
 
 		 529 aa  171  3e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.325192  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1688  terminase GpA  29.1 
 
 		 699 aa  161  3e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1056  phage terminase GpA  27.03 
 
 		 641 aa  161  4e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.172605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1506  phage terminase GpA  24.96 
 
 		 711 aa  159  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.397253  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2311  Phage terminase large subunit (gp15)  26.93 
 
 		 671 aa  155  2.9999999999999998e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1660  phage terminase GpA  26.01 
 
 		 680 aa  153  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.284129 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1861  phage terminase large subunit  24.84 
 
 		 707 aa  137  4e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000286067 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3136  phage terminase large subunit  24.84 
 
 		 707 aa  138  4e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000155862 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3205  phage terminase large subunit  24.84 
 
 		 707 aa  137  4e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00573168 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0896  phage terminase large subunit  24.96 
 
 		 700 aa  134  6e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0692  phage terminase large subunit  25.19 
 
 		 709 aa  126  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000410433 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4146  terminase GpA  25.93 
 
 		 692 aa  126  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.195337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1140  phage terminase large subunit  23.89 
 
 		 713 aa  124  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2463  terminase GpA  25.41 
 
 		 690 aa  123  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1405  phage terminase large subunit  23.94 
 
 		 713 aa  121  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000837607 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1068  phage terminase large subunit  23.94 
 
 		 713 aa  121  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000112902 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2193  phage terminase GpA  23.05 
 
 		 685 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.457009  hitchhiker  0.0000566612 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3781  putative phage terminase large subunit  22.61 
 
 		 720 aa  111  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3357  phage terminase GpA  22.46 
 
 		 720 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.27922 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3066  putative phage terminase GpA  23.46 
 
 		 700 aa  108  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.267291  hitchhiker  0.000127261 
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6527  terminase GpA  24.76 
 
 		 697 aa  98.6  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289331  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3430  terminase GpA  23.17 
 
 		 748 aa  87.8  6e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1355  Bacteriophage tail assembly protein-like protein  24.78 
 
 		 565 aa  81.3  0.00000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00357201  hitchhiker  0.000000000207538 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6670  hypothetical protein  22.84 
 
 		 330 aa  53.9  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>