55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3430 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3430  terminase GpA  100 
 
 		 748 aa  1551    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1068  phage terminase large subunit  39.68 
 
 		 713 aa  489  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000112902 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1140  phage terminase large subunit  39.81 
 
 		 713 aa  489  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1405  phage terminase large subunit  39.68 
 
 		 713 aa  489  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000837607 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3205  phage terminase large subunit  41.42 
 
 		 707 aa  486  1e-136  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00573168 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1861  phage terminase large subunit  41.42 
 
 		 707 aa  486  1e-136  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000286067 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3136  phage terminase large subunit  41.42 
 
 		 707 aa  485  1e-135  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000155862 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0896  phage terminase large subunit  40.52 
 
 		 700 aa  484  1e-135  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0692  phage terminase large subunit  39.53 
 
 		 709 aa  461  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000410433 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3357  phage terminase GpA  29.85 
 
 		 720 aa  243  1e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.27922 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3781  putative phage terminase large subunit  29.71 
 
 		 720 aa  239  2e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3066  putative phage terminase GpA  25.58 
 
 		 700 aa  188  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.267291  hitchhiker  0.000127261 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2193  phage terminase GpA  24.81 
 
 		 685 aa  116  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.457009  hitchhiker  0.0000566612 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1322  phage terminase GpA  25.14 
 
 		 618 aa  108  5e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0526731 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2050  phage terminase GpA  25.14 
 
 		 618 aa  107  6e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0184089 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2748  phage terminase GpA  24.96 
 
 		 618 aa  106  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00692747 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1257  phage terminase GpA  25.48 
 
 		 618 aa  104  6e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.268782 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2579  phage terminase GpA  24.86 
 
 		 618 aa  104  6e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20081 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2820  phage terminase GpA  24.67 
 
 		 618 aa  104  8e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2899  phage terminase GpA  25 
 
 		 618 aa  102  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.481651 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4922  terminase GpA  23.17 
 
 		 616 aa  87.4  8e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0380287 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2514  terminase GpA  23.15 
 
 		 604 aa  83.6  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1170  terminase GpA  21.38 
 
 		 684 aa  82.4  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2463  terminase GpA  21.96 
 
 		 690 aa  82  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0731  putative phage terminase large subunit  26.07 
 
 		 626 aa  80.5  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1506  phage terminase GpA  23.79 
 
 		 711 aa  80.5  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.397253  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1779  phage terminase GpA  26.14 
 
 		 593 aa  79  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0453691  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0265  prophage LambdaW1, terminase large subunit, putative  24.57 
 
 		 608 aa  77.4  0.0000000000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0597  prophage LambdaW4, terminase large subunit, putative  23.59 
 
 		 607 aa  72.8  0.00000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.201542  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3337  phage terminase GpA  26.14 
 
 		 1179 aa  72.4  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.27063  n/a   
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6527  terminase GpA  24.62 
 
 		 697 aa  71.6  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289331  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0131  phage terminase GpA  26.9 
 
 		 592 aa  70.5  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4146  terminase GpA  24.17 
 
 		 692 aa  70.5  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.195337  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2658  prophage LambdaMc01, terminase, large subunit  23.17 
 
 		 656 aa  70.1  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1195  terminase GpA  23.22 
 
 		 680 aa  69.3  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.992301  normal  0.0460399 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2392  phage terminase GpA  23.79 
 
 		 587 aa  68.2  0.0000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3042  terminase, large subunit, putative  24.13 
 
 		 678 aa  68.2  0.0000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.32998  normal  0.381128 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1056  phage terminase GpA  29.13 
 
 		 641 aa  67.8  0.0000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.172605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0598  terminase GpA  24.01 
 
 		 720 aa  67  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0853  bacteriophage-like protein  23.71 
 
 		 660 aa  66.2  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0455431 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0810  phage terminase GpA  25.49 
 
 		 614 aa  65.5  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00486859 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2309  phage terminase GpA  24.23 
 
 		 605 aa  63.9  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3412  terminase, large subunit  22.67 
 
 		 674 aa  62.4  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3209  terminase GpA  22.27 
 
 		 651 aa  60.1  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1203  phage terminase GpA  22.26 
 
 		 614 aa  59.7  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1042  Phage terminase GpA  22.5 
 
 		 665 aa  58.9  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0571086  normal  0.208633 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3176  phage terminase GpA  21.28 
 
 		 693 aa  58.2  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6601  putative phage terminase large subunit  22.37 
 
 		 677 aa  57  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1173  terminase GpA  22.69 
 
 		 650 aa  53.9  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1153  phage-related terminase large subunit  22.22 
 
 		 650 aa  51.2  0.00007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0414  phage-related terminase large subunit  22.22 
 
 		 650 aa  51.2  0.00007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1302  phage terminase GpA  21.12 
 
 		 650 aa  50.8  0.00009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.656027 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1877  phage terminase GpA  20.89 
 
 		 662 aa  50.1  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1108  terminase GpA  20.65 
 
 		 639 aa  45.4  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2815  phage terminase large subunit  22.43 
 
 		 643 aa  44.7  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.326238 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>