85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0731 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0731  putative phage terminase large subunit  100 
 
 
626 aa  1281    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0265  prophage LambdaW1, terminase large subunit, putative  52.4 
 
 
608 aa  642    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0597  prophage LambdaW4, terminase large subunit, putative  52.54 
 
 
607 aa  637    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.201542  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2658  prophage LambdaMc01, terminase, large subunit  51.09 
 
 
656 aa  581  1e-164  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3209  terminase GpA  50.42 
 
 
651 aa  575  1.0000000000000001e-162  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0853  bacteriophage-like protein  49.83 
 
 
660 aa  564  1.0000000000000001e-159  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0455431 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0810  phage terminase GpA  47.73 
 
 
614 aa  524  1e-147  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00486859 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2899  phage terminase GpA  48.57 
 
 
618 aa  504  1e-141  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.481651 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1257  phage terminase GpA  46.6 
 
 
618 aa  501  1e-140  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.268782 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2820  phage terminase GpA  47.39 
 
 
618 aa  492  9.999999999999999e-139  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2748  phage terminase GpA  45.45 
 
 
618 aa  487  1e-136  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00692747 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2579  phage terminase GpA  45.58 
 
 
618 aa  486  1e-136  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.20081 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2050  phage terminase GpA  46.87 
 
 
618 aa  486  1e-136  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0184089 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1322  phage terminase GpA  45.74 
 
 
618 aa  488  1e-136  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0526731 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1195  terminase GpA  38.38 
 
 
680 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.992301  normal  0.0460399 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3042  terminase, large subunit, putative  38.75 
 
 
678 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.32998  normal  0.381128 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2514  terminase GpA  37.76 
 
 
604 aa  372  1e-102  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1170  terminase GpA  37.56 
 
 
684 aa  372  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3412  terminase, large subunit  38.54 
 
 
674 aa  364  2e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4922  terminase GpA  36.15 
 
 
616 aa  362  1e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0380287 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1203  phage terminase GpA  39.97 
 
 
614 aa  358  1.9999999999999998e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5775  terminase GpA  34.65 
 
 
689 aa  327  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0279  terminase GpA  35.5 
 
 
692 aa  325  1e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1042  Phage terminase GpA  37.6 
 
 
665 aa  325  2e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0571086  normal  0.208633 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3858  terminase GpA  34.82 
 
 
692 aa  323  4e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0672  Phage terminase GpA  32.28 
 
 
725 aa  318  2e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3176  phage terminase GpA  34.85 
 
 
693 aa  308  3e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6601  putative phage terminase large subunit  34.46 
 
 
677 aa  300  4e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0598  terminase GpA  32.94 
 
 
720 aa  297  3e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1302  phage terminase GpA  33.62 
 
 
650 aa  272  2e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.656027 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2094  Phage terminase large subunit (GpA)  33.44 
 
 
708 aa  268  2e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0401019  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1173  terminase GpA  32.27 
 
 
650 aa  261  2e-68  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0131  phage terminase GpA  32.76 
 
 
592 aa  259  9e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1153  phage-related terminase large subunit  31.93 
 
 
650 aa  259  2e-67  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0414  phage-related terminase large subunit  31.93 
 
 
650 aa  259  2e-67  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1877  phage terminase GpA  33.33 
 
 
662 aa  258  2e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2309  phage terminase GpA  31.14 
 
 
605 aa  256  7e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1779  phage terminase GpA  31.42 
 
 
593 aa  253  9.000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0453691  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1688  terminase GpA  31.85 
 
 
699 aa  252  2e-65  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1889  terminase GpA  32.34 
 
 
675 aa  251  3e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0378909  hitchhiker  0.0000599128 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2392  phage terminase GpA  32.09 
 
 
587 aa  249  1e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1108  terminase GpA  32.64 
 
 
639 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1620  phage terminase large subunit  31.36 
 
 
641 aa  237  6e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0047658 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00731  hypothetical protein  31.53 
 
 
641 aa  236  8e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.634997  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10036  DNA packaging protein  31.53 
 
 
641 aa  236  8e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.722543  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2091  terminase GpA  31.53 
 
 
641 aa  236  9e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.11571  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2311  Phage terminase large subunit (gp15)  30.08 
 
 
671 aa  234  2.0000000000000002e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1783  phage terminase large subunit  31.29 
 
 
641 aa  232  1e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0374719 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1660  phage terminase GpA  28.68 
 
 
680 aa  227  6e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.284129 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4687  terminase GpA  29.89 
 
 
698 aa  224  4e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1286  phage terminase large subunit (GpA)  28.31 
 
 
642 aa  220  5e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3337  phage terminase GpA  31.3 
 
 
1179 aa  220  7e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.27063  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3252  phage terminase GpA  29.22 
 
 
634 aa  220  7e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2257  phage terminase GpA  29.4 
 
 
725 aa  219  1e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.305557  normal  0.307973 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1454  phage terminase large subunit (GpA)  28.5 
 
 
642 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01978  hypothetical protein  30.73 
 
 
635 aa  211  3e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0780  terminase GpA  29.77 
 
 
665 aa  211  3e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.366774 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3601  phage terminase GpA  29.61 
 
 
665 aa  210  6e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0784  phage terminase GpA  28.55 
 
 
665 aa  210  8e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0205779 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0753  phage terminase GpA  29.44 
 
 
665 aa  209  2e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2042  terminase GpA  29.75 
 
 
641 aa  208  2e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.324943  normal  0.0895639 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1675  phage terminase GpA  28.92 
 
 
660 aa  203  6e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2815  phage terminase large subunit  27.98 
 
 
643 aa  202  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.326238 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0832  phage terminase large subunit (GpA)  29.89 
 
 
529 aa  192  2e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.325192  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2230  phage terminase large subunit (GpA)  28.34 
 
 
654 aa  186  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1506  phage terminase GpA  26.65 
 
 
711 aa  184  4.0000000000000006e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.397253  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1140  phage terminase large subunit  27.68 
 
 
713 aa  160  9e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1068  phage terminase large subunit  27.53 
 
 
713 aa  157  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000112902 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1405  phage terminase large subunit  27.53 
 
 
713 aa  157  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000837607 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1861  phage terminase large subunit  28.03 
 
 
707 aa  150  8e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000286067 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3205  phage terminase large subunit  28.03 
 
 
707 aa  150  8e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00573168 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3136  phage terminase large subunit  28.03 
 
 
707 aa  150  9e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000155862 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2193  phage terminase GpA  26.72 
 
 
685 aa  150  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.457009  hitchhiker  0.0000566612 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1056  phage terminase GpA  26.21 
 
 
641 aa  148  3e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.172605  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4146  terminase GpA  27.63 
 
 
692 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.195337  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2463  terminase GpA  28.39 
 
 
690 aa  147  5e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0692  phage terminase large subunit  27.36 
 
 
709 aa  138  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000410433 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3066  putative phage terminase GpA  28.11 
 
 
700 aa  135  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.267291  hitchhiker  0.000127261 
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6527  terminase GpA  25.65 
 
 
697 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289331  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0896  phage terminase large subunit  25.49 
 
 
700 aa  125  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6670  hypothetical protein  29.38 
 
 
330 aa  87  8e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3781  putative phage terminase large subunit  24.58 
 
 
720 aa  82  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3357  phage terminase GpA  24.34 
 
 
720 aa  81.3  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.27922 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3430  terminase GpA  26.07 
 
 
748 aa  80.5  0.00000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03899  product of A truncated bacteriophage gene protein  69.23 
 
 
97 aa  55.8  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.670346  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>