83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_1506 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_1506  phage terminase GpA  100 
 
 
711 aa  1464    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.397253  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4146  terminase GpA  54.28 
 
 
692 aa  678    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.195337  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2463  terminase GpA  51.58 
 
 
690 aa  612  9.999999999999999e-175  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6527  terminase GpA  50.55 
 
 
697 aa  588  1e-166  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289331  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2050  phage terminase GpA  28.41 
 
 
618 aa  203  8e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0184089 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2748  phage terminase GpA  28.14 
 
 
618 aa  199  1.0000000000000001e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00692747 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2514  terminase GpA  28.15 
 
 
604 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2820  phage terminase GpA  28.18 
 
 
618 aa  198  3e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2579  phage terminase GpA  27.99 
 
 
618 aa  197  6e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.20081 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1322  phage terminase GpA  27.52 
 
 
618 aa  192  2e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0526731 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0731  putative phage terminase large subunit  26.69 
 
 
626 aa  184  6e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0597  prophage LambdaW4, terminase large subunit, putative  27.27 
 
 
607 aa  171  4e-41  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.201542  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1257  phage terminase GpA  27.8 
 
 
618 aa  170  9e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.268782 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2899  phage terminase GpA  27.64 
 
 
618 aa  168  2.9999999999999998e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.481651 
 
 
-
 
NC_002978  WD0265  prophage LambdaW1, terminase large subunit, putative  27.61 
 
 
608 aa  168  4e-40  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3176  phage terminase GpA  24.67 
 
 
693 aa  159  1e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4922  terminase GpA  24.96 
 
 
616 aa  159  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0380287 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1140  phage terminase large subunit  25.25 
 
 
713 aa  158  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1405  phage terminase large subunit  25.11 
 
 
713 aa  157  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000837607 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1068  phage terminase large subunit  25.11 
 
 
713 aa  157  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000112902 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1203  phage terminase GpA  25.51 
 
 
614 aa  153  8.999999999999999e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2658  prophage LambdaMc01, terminase, large subunit  26 
 
 
656 aa  152  2e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1861  phage terminase large subunit  27.02 
 
 
707 aa  149  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000286067 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3136  phage terminase large subunit  27.02 
 
 
707 aa  149  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000155862 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3205  phage terminase large subunit  27.02 
 
 
707 aa  149  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00573168 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0896  phage terminase large subunit  26.51 
 
 
700 aa  148  3e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3209  terminase GpA  25.45 
 
 
651 aa  147  5e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2257  phage terminase GpA  26.1 
 
 
725 aa  147  9e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.305557  normal  0.307973 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1302  phage terminase GpA  24.39 
 
 
650 aa  146  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.656027 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6601  putative phage terminase large subunit  25.69 
 
 
677 aa  141  3.9999999999999997e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3042  terminase, large subunit, putative  25.86 
 
 
678 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.32998  normal  0.381128 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1108  terminase GpA  24.44 
 
 
639 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0853  bacteriophage-like protein  25.04 
 
 
660 aa  138  4e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0455431 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0692  phage terminase large subunit  26.65 
 
 
709 aa  134  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000410433 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1877  phage terminase GpA  24.19 
 
 
662 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0810  phage terminase GpA  25.95 
 
 
614 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00486859 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1195  terminase GpA  25.51 
 
 
680 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.992301  normal  0.0460399 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1779  phage terminase GpA  25.17 
 
 
593 aa  127  7e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0453691  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3412  terminase, large subunit  24.31 
 
 
674 aa  125  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0672  Phage terminase GpA  24.11 
 
 
725 aa  124  6e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1170  terminase GpA  22.93 
 
 
684 aa  122  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3066  putative phage terminase GpA  25.69 
 
 
700 aa  117  7.999999999999999e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.267291  hitchhiker  0.000127261 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1173  terminase GpA  23.04 
 
 
650 aa  117  1.0000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1153  phage-related terminase large subunit  22.83 
 
 
650 aa  114  5e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0414  phage-related terminase large subunit  22.83 
 
 
650 aa  114  5e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2815  phage terminase large subunit  23.44 
 
 
643 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.326238 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1042  Phage terminase GpA  23.36 
 
 
665 aa  108  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0571086  normal  0.208633 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2309  phage terminase GpA  24.85 
 
 
605 aa  102  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3781  putative phage terminase large subunit  23.21 
 
 
720 aa  101  4e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3357  phage terminase GpA  23.21 
 
 
720 aa  101  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.27922 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1454  phage terminase large subunit (GpA)  23.4 
 
 
642 aa  100  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0279  terminase GpA  23.63 
 
 
692 aa  98.2  5e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1286  phage terminase large subunit (GpA)  23.19 
 
 
642 aa  98.2  5e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0598  terminase GpA  23.89 
 
 
720 aa  97.4  7e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2392  phage terminase GpA  25.54 
 
 
587 aa  97.4  8e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1056  phage terminase GpA  23.57 
 
 
641 aa  96.7  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.172605  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1783  phage terminase large subunit  24.76 
 
 
641 aa  95.9  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0374719 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1675  phage terminase GpA  20.88 
 
 
660 aa  96.3  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0780  terminase GpA  21.14 
 
 
665 aa  95.9  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.366774 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0784  phage terminase GpA  21.19 
 
 
665 aa  95.9  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0205779 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2094  Phage terminase large subunit (GpA)  24.33 
 
 
708 aa  95.9  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0401019  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3601  phage terminase GpA  21.22 
 
 
665 aa  94.4  7e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2091  terminase GpA  24.92 
 
 
641 aa  93.2  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.11571  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0753  phage terminase GpA  20.92 
 
 
665 aa  93.2  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3858  terminase GpA  22.71 
 
 
692 aa  93.2  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5775  terminase GpA  22.59 
 
 
689 aa  92.4  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00731  hypothetical protein  24.92 
 
 
641 aa  93.2  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.634997  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10036  DNA packaging protein  24.92 
 
 
641 aa  93.2  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.722543  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1620  phage terminase large subunit  24.76 
 
 
641 aa  92  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0047658 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3337  phage terminase GpA  23.49 
 
 
1179 aa  89.7  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.27063  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0131  phage terminase GpA  23.79 
 
 
592 aa  85.9  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1889  terminase GpA  23.88 
 
 
675 aa  85.5  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0378909  hitchhiker  0.0000599128 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1660  phage terminase GpA  22.74 
 
 
680 aa  84.7  0.000000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.284129 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3252  phage terminase GpA  21.32 
 
 
634 aa  83.6  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3430  terminase GpA  23.39 
 
 
748 aa  80.9  0.00000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0832  phage terminase large subunit (GpA)  25 
 
 
529 aa  78.2  0.0000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.325192  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2230  phage terminase large subunit (GpA)  25.05 
 
 
654 aa  77.8  0.0000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2042  terminase GpA  22.04 
 
 
641 aa  76.3  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.324943  normal  0.0895639 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4687  terminase GpA  23.72 
 
 
698 aa  73.9  0.000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1688  terminase GpA  24.25 
 
 
699 aa  72.8  0.00000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2193  phage terminase GpA  22.2 
 
 
685 aa  68.6  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.457009  hitchhiker  0.0000566612 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2311  Phage terminase large subunit (gp15)  23.71 
 
 
671 aa  67  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01978  hypothetical protein  21.98 
 
 
635 aa  55.1  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>