83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4687 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4687  terminase GpA  100 
 
 		 698 aa  1435    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1620  phage terminase large subunit  35.2 
 
 		 641 aa  334  4e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0047658 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2091  terminase GpA  35.2 
 
 		 641 aa  333  6e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.11571  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10036  DNA packaging protein  35.2 
 
 		 641 aa  333  7.000000000000001e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.722543  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00731  hypothetical protein  35.2 
 
 		 641 aa  333  7.000000000000001e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.634997  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1783  phage terminase large subunit  34.83 
 
 		 641 aa  330  5.0000000000000004e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0374719 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2042  terminase GpA  34.61 
 
 		 641 aa  326  7e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.324943  normal  0.0895639 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3601  phage terminase GpA  31.6 
 
 		 665 aa  312  1e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0784  phage terminase GpA  31.6 
 
 		 665 aa  310  4e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0205779 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0753  phage terminase GpA  31.31 
 
 		 665 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0780  terminase GpA  32.13 
 
 		 665 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.366774 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3252  phage terminase GpA  32.51 
 
 		 634 aa  302  1e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1454  phage terminase large subunit (GpA)  31.83 
 
 		 642 aa  299  1e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1675  phage terminase GpA  31.36 
 
 		 660 aa  299  1e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1286  phage terminase large subunit (GpA)  30.97 
 
 		 642 aa  294  3e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0832  phage terminase large subunit (GpA)  34.8 
 
 		 529 aa  290  6e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.325192  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2815  phage terminase large subunit  31.35 
 
 		 643 aa  287  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.326238 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2230  phage terminase large subunit (GpA)  30.7 
 
 		 654 aa  260  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3209  terminase GpA  29.89 
 
 		 651 aa  232  2e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0853  bacteriophage-like protein  30.53 
 
 		 660 aa  232  2e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0455431 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1042  Phage terminase GpA  29.95 
 
 		 665 aa  232  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0571086  normal  0.208633 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3042  terminase, large subunit, putative  34.35 
 
 		 678 aa  230  8e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.32998  normal  0.381128 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01978  hypothetical protein  30.53 
 
 		 635 aa  229  1e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1195  terminase GpA  32.05 
 
 		 680 aa  229  2e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.992301  normal  0.0460399 
 
 
-
 
NC_002978  WD0597  prophage LambdaW4, terminase large subunit, putative  29.6 
 
 		 607 aa  228  3e-58  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.201542  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0265  prophage LambdaW1, terminase large subunit, putative  30.03 
 
 		 608 aa  226  2e-57  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0731  putative phage terminase large subunit  29.74 
 
 		 626 aa  224  4e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1779  phage terminase GpA  30.41 
 
 		 593 aa  224  4e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0453691  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1108  terminase GpA  35.41 
 
 		 639 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2658  prophage LambdaMc01, terminase, large subunit  29.37 
 
 		 656 aa  221  3e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3412  terminase, large subunit  33.85 
 
 		 674 aa  221  5e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2514  terminase GpA  28.31 
 
 		 604 aa  217  4e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1170  terminase GpA  28.51 
 
 		 684 aa  211  3e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1877  phage terminase GpA  34.08 
 
 		 662 aa  209  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2820  phage terminase GpA  29.35 
 
 		 618 aa  208  3e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0131  phage terminase GpA  30.29 
 
 		 592 aa  206  1e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2748  phage terminase GpA  29.03 
 
 		 618 aa  203  9e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00692747 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2050  phage terminase GpA  28.87 
 
 		 618 aa  203  9.999999999999999e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0184089 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2579  phage terminase GpA  28.87 
 
 		 618 aa  200  6e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20081 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1322  phage terminase GpA  29.03 
 
 		 618 aa  199  1.0000000000000001e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0526731 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1257  phage terminase GpA  27.72 
 
 		 618 aa  191  2.9999999999999997e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.268782 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1203  phage terminase GpA  29.26 
 
 		 614 aa  191  4e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2899  phage terminase GpA  27.88 
 
 		 618 aa  189  2e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.481651 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4922  terminase GpA  26.96 
 
 		 616 aa  187  4e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0380287 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2309  phage terminase GpA  26.49 
 
 		 605 aa  180  8e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0810  phage terminase GpA  26.69 
 
 		 614 aa  176  9.999999999999999e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00486859 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2257  phage terminase GpA  25.78 
 
 		 725 aa  172  1e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.305557  normal  0.307973 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1302  phage terminase GpA  27.64 
 
 		 650 aa  171  4e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.656027 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2392  phage terminase GpA  26.41 
 
 		 587 aa  167  8e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6601  putative phage terminase large subunit  26.8 
 
 		 677 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0279  terminase GpA  25.59 
 
 		 692 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0414  phage-related terminase large subunit  26.64 
 
 		 650 aa  165  2.0000000000000002e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1153  phage-related terminase large subunit  26.64 
 
 		 650 aa  165  2.0000000000000002e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3858  terminase GpA  27.54 
 
 		 692 aa  164  6e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1173  terminase GpA  26.87 
 
 		 650 aa  164  7e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5775  terminase GpA  27.54 
 
 		 689 aa  162  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3337  phage terminase GpA  25.96 
 
 		 1179 aa  159  2e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.27063  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2311  Phage terminase large subunit (gp15)  25.08 
 
 		 671 aa  145  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0598  terminase GpA  25.96 
 
 		 720 aa  136  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1688  terminase GpA  23.9 
 
 		 699 aa  133  1.0000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3176  phage terminase GpA  24.79 
 
 		 693 aa  120  9e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2094  Phage terminase large subunit (GpA)  24.86 
 
 		 708 aa  117  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0401019  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1889  terminase GpA  25 
 
 		 675 aa  114  8.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0378909  hitchhiker  0.0000599128 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1660  phage terminase GpA  23.18 
 
 		 680 aa  106  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.284129 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0672  Phage terminase GpA  22.83 
 
 		 725 aa  100  8e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2193  phage terminase GpA  23.92 
 
 		 685 aa  95.5  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.457009  hitchhiker  0.0000566612 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2463  terminase GpA  23.2 
 
 		 690 aa  84.7  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3066  putative phage terminase GpA  24.39 
 
 		 700 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.267291  hitchhiker  0.000127261 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3068  tail assembly chaperone gp38  38.61 
 
 		 247 aa  77.4  0.0000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.577916  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1861  phage terminase large subunit  25.85 
 
 		 707 aa  76.6  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000286067 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3136  phage terminase large subunit  25.85 
 
 		 707 aa  76.6  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000155862 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3205  phage terminase large subunit  25.85 
 
 		 707 aa  76.6  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00573168 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1506  phage terminase GpA  23.72 
 
 		 711 aa  74.3  0.000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.397253  n/a   
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6527  terminase GpA  25.94 
 
 		 697 aa  69.3  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289331  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0896  phage terminase large subunit  24.47 
 
 		 700 aa  67.8  0.0000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1056  phage terminase GpA  20.55 
 
 		 641 aa  66.2  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.172605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1140  phage terminase large subunit  22.08 
 
 		 713 aa  65.1  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4146  terminase GpA  24.4 
 
 		 692 aa  63.5  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.195337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1068  phage terminase large subunit  21.64 
 
 		 713 aa  60.8  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000112902 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1405  phage terminase large subunit  21.64 
 
 		 713 aa  60.8  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000837607 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0647  phage-related terminase large subunit  25.79 
 
 		 237 aa  53.1  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6670  hypothetical protein  27.01 
 
 		 330 aa  48.1  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0692  phage terminase large subunit  23.67 
 
 		 709 aa  47  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000410433 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>