82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_3601 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_10036  DNA packaging protein  52.85 
 
 		 641 aa  647    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.722543  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3601  phage terminase GpA  100 
 
 		 665 aa  1391    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0753  phage terminase GpA  99.55 
 
 		 665 aa  1385    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1675  phage terminase GpA  79.61 
 
 		 660 aa  1131    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3252  phage terminase GpA  88.89 
 
 		 634 aa  1164    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2042  terminase GpA  50.76 
 
 		 641 aa  651    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.324943  normal  0.0895639 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0784  phage terminase GpA  99.4 
 
 		 665 aa  1386    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0205779 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2091  terminase GpA  52.85 
 
 		 641 aa  647    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.11571  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00731  hypothetical protein  52.85 
 
 		 641 aa  647    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.634997  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0780  terminase GpA  98.2 
 
 		 665 aa  1369    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.366774 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1783  phage terminase large subunit  52.68 
 
 		 641 aa  644    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0374719 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1620  phage terminase large subunit  52.85 
 
 		 641 aa  648    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0047658 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1286  phage terminase large subunit (GpA)  46.68 
 
 		 642 aa  611  1e-173  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1454  phage terminase large subunit (GpA)  47.52 
 
 		 642 aa  600  1e-170  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2815  phage terminase large subunit  46.55 
 
 		 643 aa  591  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.326238 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0832  phage terminase large subunit (GpA)  52.42 
 
 		 529 aa  568  1e-160  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.325192  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2230  phage terminase large subunit (GpA)  40.16 
 
 		 654 aa  443  1e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01978  hypothetical protein  39 
 
 		 635 aa  435  1e-120  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1042  Phage terminase GpA  32.73 
 
 		 665 aa  311  2e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0571086  normal  0.208633 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4687  terminase GpA  32.1 
 
 		 698 aa  305  1.0000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1257  phage terminase GpA  31.07 
 
 		 618 aa  237  5.0000000000000005e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.268782 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2899  phage terminase GpA  31.5 
 
 		 618 aa  233  1e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.481651 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2050  phage terminase GpA  30.49 
 
 		 618 aa  228  2e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0184089 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4922  terminase GpA  28.66 
 
 		 616 aa  228  4e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0380287 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2579  phage terminase GpA  30.8 
 
 		 618 aa  226  1e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20081 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2748  phage terminase GpA  30.49 
 
 		 618 aa  226  1e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00692747 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1322  phage terminase GpA  31.16 
 
 		 618 aa  225  2e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0526731 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2820  phage terminase GpA  31 
 
 		 618 aa  225  2e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1203  phage terminase GpA  31.21 
 
 		 614 aa  225  2e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2514  terminase GpA  29.78 
 
 		 604 aa  224  4e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0853  bacteriophage-like protein  30.17 
 
 		 660 aa  223  9e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0455431 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3209  terminase GpA  28.33 
 
 		 651 aa  217  4e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0265  prophage LambdaW1, terminase large subunit, putative  28.93 
 
 		 608 aa  211  5e-53  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0731  putative phage terminase large subunit  29.61 
 
 		 626 aa  210  6e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1302  phage terminase GpA  28.11 
 
 		 650 aa  210  8e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.656027 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2658  prophage LambdaMc01, terminase, large subunit  28.14 
 
 		 656 aa  209  1e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0597  prophage LambdaW4, terminase large subunit, putative  26.81 
 
 		 607 aa  200  7e-50  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.201542  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1779  phage terminase GpA  27.53 
 
 		 593 aa  183  9.000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0453691  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1889  terminase GpA  27.18 
 
 		 675 aa  178  3e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0378909  hitchhiker  0.0000599128 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2094  Phage terminase large subunit (GpA)  25.6 
 
 		 708 aa  178  3e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0401019  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0131  phage terminase GpA  29.16 
 
 		 592 aa  174  5.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3042  terminase, large subunit, putative  28.92 
 
 		 678 aa  171  3e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.32998  normal  0.381128 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0810  phage terminase GpA  27.17 
 
 		 614 aa  169  1e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00486859 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1195  terminase GpA  27.57 
 
 		 680 aa  168  4e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.992301  normal  0.0460399 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1170  terminase GpA  25.78 
 
 		 684 aa  162  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3412  terminase, large subunit  27.9 
 
 		 674 aa  161  3e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1173  terminase GpA  24.92 
 
 		 650 aa  159  1e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5775  terminase GpA  25.12 
 
 		 689 aa  155  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0414  phage-related terminase large subunit  24.42 
 
 		 650 aa  153  8.999999999999999e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1153  phage-related terminase large subunit  24.42 
 
 		 650 aa  153  8.999999999999999e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2309  phage terminase GpA  25.91 
 
 		 605 aa  153  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3858  terminase GpA  25.2 
 
 		 692 aa  153  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2392  phage terminase GpA  25.08 
 
 		 587 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0279  terminase GpA  26.48 
 
 		 692 aa  147  6e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1660  phage terminase GpA  25.08 
 
 		 680 aa  139  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.284129 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2257  phage terminase GpA  25.77 
 
 		 725 aa  139  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.305557  normal  0.307973 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0672  Phage terminase GpA  24.19 
 
 		 725 aa  139  2e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1877  phage terminase GpA  25.41 
 
 		 662 aa  130  7.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3337  phage terminase GpA  26.04 
 
 		 1179 aa  128  3e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.27063  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0598  terminase GpA  25.27 
 
 		 720 aa  127  7e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3068  tail assembly chaperone gp38  55.34 
 
 		 247 aa  123  9e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.577916  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3176  phage terminase GpA  24.53 
 
 		 693 aa  121  3.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6601  putative phage terminase large subunit  24.07 
 
 		 677 aa  119  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1108  terminase GpA  24.52 
 
 		 639 aa  117  5e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2193  phage terminase GpA  24.12 
 
 		 685 aa  114  6e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.457009  hitchhiker  0.0000566612 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1688  terminase GpA  23.04 
 
 		 699 aa  108  4e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3205  phage terminase large subunit  25 
 
 		 707 aa  104  4e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00573168 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1861  phage terminase large subunit  25 
 
 		 707 aa  104  4e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000286067 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3136  phage terminase large subunit  25 
 
 		 707 aa  104  5e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000155862 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1056  phage terminase GpA  22.64 
 
 		 641 aa  100  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.172605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0692  phage terminase large subunit  24.44 
 
 		 709 aa  97.8  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000410433 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1506  phage terminase GpA  21.42 
 
 		 711 aa  93.2  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.397253  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3066  putative phage terminase GpA  24.01 
 
 		 700 aa  92  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.267291  hitchhiker  0.000127261 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1140  phage terminase large subunit  24.56 
 
 		 713 aa  90.9  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0896  phage terminase large subunit  25.31 
 
 		 700 aa  85.5  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1068  phage terminase large subunit  24.93 
 
 		 713 aa  83.6  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000112902 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1405  phage terminase large subunit  24.93 
 
 		 713 aa  83.6  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000837607 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3781  putative phage terminase large subunit  20.93 
 
 		 720 aa  73.2  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3357  phage terminase GpA  21.36 
 
 		 720 aa  71.2  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.27922 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4146  terminase GpA  24.13 
 
 		 692 aa  71.2  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.195337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2463  terminase GpA  23.01 
 
 		 690 aa  58.2  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6527  terminase GpA  24.22 
 
 		 697 aa  57.4  0.0000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289331  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>