84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3858 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5775  terminase GpA  97.69 
 
 		 689 aa  1351    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3858  terminase GpA  100 
 
 		 692 aa  1402    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0279  terminase GpA  79.16 
 
 		 692 aa  1120    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2094  Phage terminase large subunit (GpA)  40.59 
 
 		 708 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0401019  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1889  terminase GpA  41.06 
 
 		 675 aa  429  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0378909  hitchhiker  0.0000599128 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3209  terminase GpA  39 
 
 		 651 aa  409  1.0000000000000001e-112  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2658  prophage LambdaMc01, terminase, large subunit  40.53 
 
 		 656 aa  409  1.0000000000000001e-112  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0853  bacteriophage-like protein  40.58 
 
 		 660 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0455431 
 
 
-
 
NC_002978  WD0265  prophage LambdaW1, terminase large subunit, putative  35.31 
 
 		 608 aa  345  2e-93  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0597  prophage LambdaW4, terminase large subunit, putative  33.87 
 
 		 607 aa  344  4e-93  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.201542  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0810  phage terminase GpA  34.91 
 
 		 614 aa  326  1e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00486859 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0731  putative phage terminase large subunit  34.82 
 
 		 626 aa  323  5e-87  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6670  hypothetical protein  98.11 
 
 		 330 aa  323  5e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2899  phage terminase GpA  35.27 
 
 		 618 aa  302  2e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.481651 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1257  phage terminase GpA  35.22 
 
 		 618 aa  299  1e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.268782 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1042  Phage terminase GpA  33.55 
 
 		 665 aa  295  2e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0571086  normal  0.208633 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1322  phage terminase GpA  33.6 
 
 		 618 aa  295  3e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0526731 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2579  phage terminase GpA  33.6 
 
 		 618 aa  293  6e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20081 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2820  phage terminase GpA  33.28 
 
 		 618 aa  293  7e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2050  phage terminase GpA  33.6 
 
 		 618 aa  292  1e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0184089 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2748  phage terminase GpA  33.44 
 
 		 618 aa  291  3e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00692747 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4922  terminase GpA  30.47 
 
 		 616 aa  289  1e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0380287 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1203  phage terminase GpA  33.82 
 
 		 614 aa  288  2e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2514  terminase GpA  30.23 
 
 		 604 aa  263  6e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3042  terminase, large subunit, putative  30.05 
 
 		 678 aa  259  1e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.32998  normal  0.381128 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1195  terminase GpA  30.18 
 
 		 680 aa  258  3e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.992301  normal  0.0460399 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3412  terminase, large subunit  30.89 
 
 		 674 aa  257  4e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1173  terminase GpA  28.5 
 
 		 650 aa  247  4.9999999999999997e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0414  phage-related terminase large subunit  28.34 
 
 		 650 aa  246  6.999999999999999e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1153  phage-related terminase large subunit  28.34 
 
 		 650 aa  246  6.999999999999999e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1302  phage terminase GpA  29.65 
 
 		 650 aa  241  4e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.656027 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1877  phage terminase GpA  31.3 
 
 		 662 aa  234  5e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1108  terminase GpA  31.55 
 
 		 639 aa  225  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0598  terminase GpA  29.08 
 
 		 720 aa  224  3e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3176  phage terminase GpA  30.39 
 
 		 693 aa  213  7e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2257  phage terminase GpA  30.52 
 
 		 725 aa  213  7e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.305557  normal  0.307973 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2309  phage terminase GpA  28.32 
 
 		 605 aa  210  6e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1779  phage terminase GpA  27.19 
 
 		 593 aa  210  6e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0453691  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1170  terminase GpA  27.21 
 
 		 684 aa  202  3e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2392  phage terminase GpA  26.97 
 
 		 587 aa  184  4.0000000000000006e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0131  phage terminase GpA  27.65 
 
 		 592 aa  179  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2815  phage terminase large subunit  27.22 
 
 		 643 aa  176  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.326238 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1286  phage terminase large subunit (GpA)  26.91 
 
 		 642 aa  173  1e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1454  phage terminase large subunit (GpA)  26.98 
 
 		 642 aa  171  6e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3337  phage terminase GpA  25.62 
 
 		 1179 aa  167  4e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.27063  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2230  phage terminase large subunit (GpA)  25.61 
 
 		 654 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1660  phage terminase GpA  25.62 
 
 		 680 aa  164  4.0000000000000004e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.284129 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1783  phage terminase large subunit  28 
 
 		 641 aa  164  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0374719 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1620  phage terminase large subunit  27.84 
 
 		 641 aa  164  7e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0047658 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4687  terminase GpA  27.54 
 
 		 698 aa  163  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6601  putative phage terminase large subunit  26.57 
 
 		 677 aa  162  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00731  hypothetical protein  27.68 
 
 		 641 aa  162  3e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.634997  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10036  DNA packaging protein  27.68 
 
 		 641 aa  162  3e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.722543  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2091  terminase GpA  27.68 
 
 		 641 aa  162  3e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.11571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0780  terminase GpA  25.36 
 
 		 665 aa  159  1e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.366774 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2042  terminase GpA  26.32 
 
 		 641 aa  155  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.324943  normal  0.0895639 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0784  phage terminase GpA  25.2 
 
 		 665 aa  154  7e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0205779 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3601  phage terminase GpA  25.2 
 
 		 665 aa  154  7e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0672  Phage terminase GpA  25.85 
 
 		 725 aa  152  3e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0753  phage terminase GpA  24.88 
 
 		 665 aa  150  8e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1675  phage terminase GpA  24.64 
 
 		 660 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2311  Phage terminase large subunit (gp15)  25.51 
 
 		 671 aa  148  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1056  phage terminase GpA  27.05 
 
 		 641 aa  146  2e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.172605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01978  hypothetical protein  25.42 
 
 		 635 aa  144  5e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1688  terminase GpA  24.3 
 
 		 699 aa  140  6e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3252  phage terminase GpA  26.26 
 
 		 634 aa  137  9e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3066  putative phage terminase GpA  25.99 
 
 		 700 aa  130  6e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.267291  hitchhiker  0.000127261 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0832  phage terminase large subunit (GpA)  26.46 
 
 		 529 aa  129  3e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.325192  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1068  phage terminase large subunit  24.22 
 
 		 713 aa  103  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000112902 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1405  phage terminase large subunit  24.22 
 
 		 713 aa  103  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000837607 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0692  phage terminase large subunit  23.72 
 
 		 709 aa  103  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000410433 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1140  phage terminase large subunit  24.22 
 
 		 713 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1506  phage terminase GpA  22.71 
 
 		 711 aa  92.8  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.397253  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3205  phage terminase large subunit  22.91 
 
 		 707 aa  89.4  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00573168 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3136  phage terminase large subunit  22.91 
 
 		 707 aa  89  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000155862 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1861  phage terminase large subunit  22.91 
 
 		 707 aa  89.4  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000286067 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0896  phage terminase large subunit  23.15 
 
 		 700 aa  89  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6527  terminase GpA  25.96 
 
 		 697 aa  87.8  7e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289331  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2463  terminase GpA  24.83 
 
 		 690 aa  84.7  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4146  terminase GpA  24.09 
 
 		 692 aa  77.4  0.0000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.195337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2193  phage terminase GpA  22.24 
 
 		 685 aa  77  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.457009  hitchhiker  0.0000566612 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3781  putative phage terminase large subunit  24.1 
 
 		 720 aa  72.4  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3357  phage terminase GpA  23.38 
 
 		 720 aa  69.3  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.27922 
 
 
-
 
NC_003296  RS03899  product of A truncated bacteriophage gene protein  46.03 
 
 		 97 aa  44.3  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.670346  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>