21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS03899 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS03899  product of A truncated bacteriophage gene protein  100 
 
 		 97 aa  194  5.000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.670346  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0853  bacteriophage-like protein  94.64 
 
 		 660 aa  103  7e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0455431 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2658  prophage LambdaMc01, terminase, large subunit  87.27 
 
 		 656 aa  96.7  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3209  terminase GpA  90.38 
 
 		 651 aa  94.4  4e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0810  phage terminase GpA  58.18 
 
 		 614 aa  63.9  0.0000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00486859 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1257  phage terminase GpA  70.45 
 
 		 618 aa  60.5  0.000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.268782 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2899  phage terminase GpA  73.81 
 
 		 618 aa  60.1  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.481651 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2820  phage terminase GpA  70.45 
 
 		 618 aa  59.3  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2748  phage terminase GpA  70.45 
 
 		 618 aa  59.3  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00692747 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2579  phage terminase GpA  65.31 
 
 		 618 aa  59.3  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20081 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1322  phage terminase GpA  65.31 
 
 		 618 aa  59.3  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0526731 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2050  phage terminase GpA  65.31 
 
 		 618 aa  59.3  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0184089 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0731  putative phage terminase large subunit  69.23 
 
 		 626 aa  55.8  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0265  prophage LambdaW1, terminase large subunit, putative  71.05 
 
 		 608 aa  54.3  0.0000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0597  prophage LambdaW4, terminase large subunit, putative  57.14 
 
 		 607 aa  50.8  0.000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.201542  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3858  terminase GpA  46.03 
 
 		 692 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3042  terminase, large subunit, putative  50.88 
 
 		 678 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.32998  normal  0.381128 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1195  terminase GpA  50.88 
 
 		 680 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.992301  normal  0.0460399 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3412  terminase, large subunit  49.12 
 
 		 674 aa  41.6  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1042  Phage terminase GpA  37.93 
 
 		 665 aa  40.4  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0571086  normal  0.208633 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3176  phage terminase GpA  40.74 
 
 		 693 aa  40  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.693881 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>