87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2579 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1257  phage terminase GpA  83.98 
 
 
618 aa  1083    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.268782 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2579  phage terminase GpA  100 
 
 
618 aa  1271    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.20081 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2748  phage terminase GpA  94.82 
 
 
618 aa  1219    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00692747 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2820  phage terminase GpA  95.15 
 
 
618 aa  1217    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2899  phage terminase GpA  85.11 
 
 
618 aa  1095    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.481651 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2050  phage terminase GpA  96.12 
 
 
618 aa  1231    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0184089 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1322  phage terminase GpA  98.38 
 
 
618 aa  1252    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0526731 
 
 
-
 
NC_002978  WD0597  prophage LambdaW4, terminase large subunit, putative  50.26 
 
 
607 aa  546  1e-154  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.201542  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0265  prophage LambdaW1, terminase large subunit, putative  51.2 
 
 
608 aa  545  1e-153  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3209  terminase GpA  46.9 
 
 
651 aa  523  1e-147  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0853  bacteriophage-like protein  46.92 
 
 
660 aa  521  1e-146  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0455431 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2658  prophage LambdaMc01, terminase, large subunit  46.71 
 
 
656 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0731  putative phage terminase large subunit  45.58 
 
 
626 aa  486  1e-136  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0810  phage terminase GpA  47.27 
 
 
614 aa  464  1e-129  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00486859 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4922  terminase GpA  41.54 
 
 
616 aa  445  1e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0380287 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1203  phage terminase GpA  43.69 
 
 
614 aa  442  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3042  terminase, large subunit, putative  42.4 
 
 
678 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.32998  normal  0.381128 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1042  Phage terminase GpA  41.11 
 
 
665 aa  434  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0571086  normal  0.208633 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1195  terminase GpA  39.74 
 
 
680 aa  429  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.992301  normal  0.0460399 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2514  terminase GpA  41.58 
 
 
604 aa  422  1e-117  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3412  terminase, large subunit  40.58 
 
 
674 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1302  phage terminase GpA  38.42 
 
 
650 aa  374  1e-102  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.656027 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2094  Phage terminase large subunit (GpA)  36.73 
 
 
708 aa  366  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0401019  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1153  phage-related terminase large subunit  39.9 
 
 
650 aa  359  9e-98  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0414  phage-related terminase large subunit  39.9 
 
 
650 aa  359  9e-98  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1173  terminase GpA  39.72 
 
 
650 aa  358  1.9999999999999998e-97  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3176  phage terminase GpA  36.42 
 
 
693 aa  342  1e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1170  terminase GpA  35 
 
 
684 aa  342  1e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1889  terminase GpA  35.11 
 
 
675 aa  339  9.999999999999999e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0378909  hitchhiker  0.0000599128 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1779  phage terminase GpA  35.46 
 
 
593 aa  329  7e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0453691  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0131  phage terminase GpA  36.07 
 
 
592 aa  327  5e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0672  Phage terminase GpA  32.09 
 
 
725 aa  322  9.999999999999999e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2392  phage terminase GpA  34.07 
 
 
587 aa  309  1.0000000000000001e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2309  phage terminase GpA  33.67 
 
 
605 aa  307  3e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3858  terminase GpA  33.6 
 
 
692 aa  293  5e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3337  phage terminase GpA  33.74 
 
 
1179 aa  291  3e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.27063  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5775  terminase GpA  33.55 
 
 
689 aa  291  4e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0279  terminase GpA  33.99 
 
 
692 aa  288  2e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0598  terminase GpA  32.53 
 
 
720 aa  251  2e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1877  phage terminase GpA  31.77 
 
 
662 aa  249  9e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3252  phage terminase GpA  30.89 
 
 
634 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6601  putative phage terminase large subunit  31.03 
 
 
677 aa  233  7.000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1108  terminase GpA  31.68 
 
 
639 aa  233  8.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1454  phage terminase large subunit (GpA)  30.81 
 
 
642 aa  229  1e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1286  phage terminase large subunit (GpA)  30.86 
 
 
642 aa  228  2e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0784  phage terminase GpA  30.55 
 
 
665 aa  226  1e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0205779 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0780  terminase GpA  30.9 
 
 
665 aa  225  2e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.366774 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3601  phage terminase GpA  30.8 
 
 
665 aa  225  2e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1675  phage terminase GpA  30.53 
 
 
660 aa  225  2e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0753  phage terminase GpA  30.7 
 
 
665 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2042  terminase GpA  31.72 
 
 
641 aa  219  2e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.324943  normal  0.0895639 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2815  phage terminase large subunit  30.69 
 
 
643 aa  218  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.326238 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10036  DNA packaging protein  30.36 
 
 
641 aa  218  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.722543  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00731  hypothetical protein  30.36 
 
 
641 aa  218  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.634997  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2091  terminase GpA  30.36 
 
 
641 aa  218  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.11571  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1620  phage terminase large subunit  30.19 
 
 
641 aa  216  9.999999999999999e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0047658 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1783  phage terminase large subunit  30.3 
 
 
641 aa  214  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0374719 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2257  phage terminase GpA  28.45 
 
 
725 aa  214  3.9999999999999995e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.305557  normal  0.307973 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1688  terminase GpA  28.34 
 
 
699 aa  211  4e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2230  phage terminase large subunit (GpA)  29.59 
 
 
654 aa  201  5e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01978  hypothetical protein  29.43 
 
 
635 aa  197  4.0000000000000005e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4687  terminase GpA  28.78 
 
 
698 aa  197  6e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1506  phage terminase GpA  27.99 
 
 
711 aa  196  8.000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.397253  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1660  phage terminase GpA  28.48 
 
 
680 aa  194  3e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.284129 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1140  phage terminase large subunit  28.35 
 
 
713 aa  176  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1068  phage terminase large subunit  28.71 
 
 
713 aa  175  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000112902 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1405  phage terminase large subunit  28.71 
 
 
713 aa  175  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000837607 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3136  phage terminase large subunit  28.59 
 
 
707 aa  170  6e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000155862 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3205  phage terminase large subunit  28.59 
 
 
707 aa  170  7e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00573168 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1861  phage terminase large subunit  28.59 
 
 
707 aa  170  7e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000286067 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0832  phage terminase large subunit (GpA)  27.89 
 
 
529 aa  168  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.325192  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2311  Phage terminase large subunit (gp15)  25.96 
 
 
671 aa  167  6.9999999999999995e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1056  phage terminase GpA  28.87 
 
 
641 aa  163  9e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.172605  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0692  phage terminase large subunit  28.37 
 
 
709 aa  161  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000410433 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0896  phage terminase large subunit  29.48 
 
 
700 aa  159  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4146  terminase GpA  26.43 
 
 
692 aa  140  6e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.195337  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3066  putative phage terminase GpA  27.09 
 
 
700 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.267291  hitchhiker  0.000127261 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2193  phage terminase GpA  25.73 
 
 
685 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.457009  hitchhiker  0.0000566612 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2463  terminase GpA  26.08 
 
 
690 aa  127  5e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6527  terminase GpA  25.2 
 
 
697 aa  121  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289331  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3357  phage terminase GpA  24.92 
 
 
720 aa  105  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.27922 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3781  putative phage terminase large subunit  25.55 
 
 
720 aa  105  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3430  terminase GpA  24.86 
 
 
748 aa  104  5e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6670  hypothetical protein  29.19 
 
 
330 aa  61.2  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1355  Bacteriophage tail assembly protein-like protein  21.57 
 
 
565 aa  59.3  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00357201  hitchhiker  0.000000000207538 
 
 
-
 
NC_003296  RS03899  product of A truncated bacteriophage gene protein  65.31 
 
 
97 aa  59.3  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.670346  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38583  predicted protein  25 
 
 
754 aa  44.7  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.449683  normal  0.114344 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>