85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_0414 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010577  XfasM23_1173  terminase GpA  98.46 
 
 		 650 aa  1330    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1153  phage-related terminase large subunit  100 
 
 		 650 aa  1349    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0414  phage-related terminase large subunit  100 
 
 		 650 aa  1349    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1302  phage terminase GpA  56.11 
 
 		 650 aa  720    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.656027 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2899  phage terminase GpA  40.34 
 
 		 618 aa  374  1e-102  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.481651 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1257  phage terminase GpA  39.93 
 
 		 618 aa  372  1e-101  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.268782 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2748  phage terminase GpA  40.07 
 
 		 618 aa  360  4e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00692747 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2820  phage terminase GpA  39.79 
 
 		 618 aa  360  6e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2579  phage terminase GpA  39.9 
 
 		 618 aa  359  8e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20081 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1322  phage terminase GpA  39.9 
 
 		 618 aa  359  9.999999999999999e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0526731 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2050  phage terminase GpA  39.72 
 
 		 618 aa  357  2.9999999999999997e-97  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0184089 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4922  terminase GpA  35.08 
 
 		 616 aa  337  5e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0380287 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2514  terminase GpA  34.01 
 
 		 604 aa  323  5e-87  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1042  Phage terminase GpA  36.03 
 
 		 665 aa  321  3e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0571086  normal  0.208633 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1203  phage terminase GpA  33 
 
 		 614 aa  307  3e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3042  terminase, large subunit, putative  33.28 
 
 		 678 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.32998  normal  0.381128 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2094  Phage terminase large subunit (GpA)  30.23 
 
 		 708 aa  287  4e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0401019  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1195  terminase GpA  33.55 
 
 		 680 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.992301  normal  0.0460399 
 
 
-
 
NC_002978  WD0597  prophage LambdaW4, terminase large subunit, putative  32.76 
 
 		 607 aa  281  2e-74  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.201542  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3412  terminase, large subunit  34.53 
 
 		 674 aa  281  3e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0265  prophage LambdaW1, terminase large subunit, putative  33.97 
 
 		 608 aa  280  5e-74  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2309  phage terminase GpA  30.29 
 
 		 605 aa  275  3e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1779  phage terminase GpA  30.41 
 
 		 593 aa  269  1e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0453691  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0131  phage terminase GpA  32.89 
 
 		 592 aa  268  2e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1889  terminase GpA  31.6 
 
 		 675 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0378909  hitchhiker  0.0000599128 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2392  phage terminase GpA  30.76 
 
 		 587 aa  263  8e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1877  phage terminase GpA  33.56 
 
 		 662 aa  262  1e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2658  prophage LambdaMc01, terminase, large subunit  33 
 
 		 656 aa  262  2e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3176  phage terminase GpA  31.09 
 
 		 693 aa  261  3e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0731  putative phage terminase large subunit  32.1 
 
 		 626 aa  258  2e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3337  phage terminase GpA  31.21 
 
 		 1179 aa  251  2e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.27063  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3209  terminase GpA  32.57 
 
 		 651 aa  251  3e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3858  terminase GpA  28.34 
 
 		 692 aa  247  4e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5775  terminase GpA  28.17 
 
 		 689 aa  246  8e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0853  bacteriophage-like protein  31.84 
 
 		 660 aa  246  9.999999999999999e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0455431 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1108  terminase GpA  33.04 
 
 		 639 aa  244  3e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1170  terminase GpA  29.49 
 
 		 684 aa  243  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0279  terminase GpA  28.12 
 
 		 692 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0810  phage terminase GpA  31.25 
 
 		 614 aa  226  9e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00486859 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0672  Phage terminase GpA  29.67 
 
 		 725 aa  206  1e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1454  phage terminase large subunit (GpA)  28.17 
 
 		 642 aa  191  5e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2257  phage terminase GpA  26.84 
 
 		 725 aa  188  2e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.305557  normal  0.307973 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1286  phage terminase large subunit (GpA)  27.87 
 
 		 642 aa  187  4e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6601  putative phage terminase large subunit  27.67 
 
 		 677 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2042  terminase GpA  28.11 
 
 		 641 aa  185  3e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.324943  normal  0.0895639 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2230  phage terminase large subunit (GpA)  28.05 
 
 		 654 aa  183  1e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2815  phage terminase large subunit  27.04 
 
 		 643 aa  181  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.326238 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1620  phage terminase large subunit  27.66 
 
 		 641 aa  180  7e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0047658 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00731  hypothetical protein  27.82 
 
 		 641 aa  180  9e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.634997  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10036  DNA packaging protein  27.82 
 
 		 641 aa  180  9e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.722543  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1783  phage terminase large subunit  28.03 
 
 		 641 aa  179  1e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0374719 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2091  terminase GpA  27.82 
 
 		 641 aa  179  1e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.11571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01978  hypothetical protein  26.94 
 
 		 635 aa  174  2.9999999999999996e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4687  terminase GpA  26.97 
 
 		 698 aa  165  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1675  phage terminase GpA  26.9 
 
 		 660 aa  161  4e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1688  terminase GpA  28.02 
 
 		 699 aa  158  3e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3252  phage terminase GpA  25.08 
 
 		 634 aa  157  6e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0780  terminase GpA  24.73 
 
 		 665 aa  156  1e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.366774 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0784  phage terminase GpA  24.73 
 
 		 665 aa  153  8.999999999999999e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0205779 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3601  phage terminase GpA  24.42 
 
 		 665 aa  153  1e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0753  phage terminase GpA  24.57 
 
 		 665 aa  151  3e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0598  terminase GpA  27.43 
 
 		 720 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2311  Phage terminase large subunit (gp15)  24.26 
 
 		 671 aa  141  3e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0832  phage terminase large subunit (GpA)  25.62 
 
 		 529 aa  137  5e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.325192  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1056  phage terminase GpA  24.67 
 
 		 641 aa  130  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.172605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1660  phage terminase GpA  23.84 
 
 		 680 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.284129 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2193  phage terminase GpA  25 
 
 		 685 aa  115  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.457009  hitchhiker  0.0000566612 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1506  phage terminase GpA  23.36 
 
 		 711 aa  114  6e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.397253  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3357  phage terminase GpA  24.51 
 
 		 720 aa  108  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.27922 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3781  putative phage terminase large subunit  24.32 
 
 		 720 aa  105  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1861  phage terminase large subunit  23.63 
 
 		 707 aa  103  9e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000286067 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3136  phage terminase large subunit  23.63 
 
 		 707 aa  103  9e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000155862 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3205  phage terminase large subunit  23.63 
 
 		 707 aa  103  9e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00573168 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0692  phage terminase large subunit  23.55 
 
 		 709 aa  95.5  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000410433 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2463  terminase GpA  25.08 
 
 		 690 aa  95.1  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3066  putative phage terminase GpA  25.42 
 
 		 700 aa  95.1  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.267291  hitchhiker  0.000127261 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4146  terminase GpA  24.25 
 
 		 692 aa  95.1  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.195337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0896  phage terminase large subunit  23.55 
 
 		 700 aa  91.7  4e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1140  phage terminase large subunit  23.35 
 
 		 713 aa  89.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1405  phage terminase large subunit  23.2 
 
 		 713 aa  87.8  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000837607 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1068  phage terminase large subunit  23.2 
 
 		 713 aa  87.8  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000112902 
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6527  terminase GpA  24.22 
 
 		 697 aa  81.6  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289331  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6670  hypothetical protein  27.22 
 
 		 330 aa  54.3  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3430  terminase GpA  22.22 
 
 		 748 aa  51.6  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1355  Bacteriophage tail assembly protein-like protein  19.91 
 
 		 565 aa  44.3  0.006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00357201  hitchhiker  0.000000000207538 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>