84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_10036 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_10036  DNA packaging protein  100 
 
 		 641 aa  1338    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.722543  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3601  phage terminase GpA  52.57 
 
 		 665 aa  650    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0753  phage terminase GpA  52.41 
 
 		 665 aa  649    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0832  phage terminase large subunit (GpA)  99.04 
 
 		 529 aa  1082    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.325192  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1675  phage terminase GpA  51.54 
 
 		 660 aa  647    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2042  terminase GpA  75.04 
 
 		 641 aa  1027    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.324943  normal  0.0895639 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0784  phage terminase GpA  52.57 
 
 		 665 aa  652    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0205779 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2091  terminase GpA  99.69 
 
 		 641 aa  1336    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.11571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1286  phage terminase large subunit (GpA)  66.51 
 
 		 642 aa  912    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2815  phage terminase large subunit  65.72 
 
 		 643 aa  895    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.326238 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1620  phage terminase large subunit  99.22 
 
 		 641 aa  1330    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0047658 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1783  phage terminase large subunit  97.97 
 
 		 641 aa  1291    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0374719 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0780  terminase GpA  52.09 
 
 		 665 aa  643    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.366774 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1454  phage terminase large subunit (GpA)  67.04 
 
 		 642 aa  895    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00731  hypothetical protein  100 
 
 		 641 aa  1338    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.634997  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3252  phage terminase GpA  52.63 
 
 		 634 aa  623  1e-177  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2230  phage terminase large subunit (GpA)  42.79 
 
 		 654 aa  499  1e-140  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01978  hypothetical protein  36.94 
 
 		 635 aa  390  1e-107  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4687  terminase GpA  35.9 
 
 		 698 aa  330  4e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1042  Phage terminase GpA  35.8 
 
 		 665 aa  325  2e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0571086  normal  0.208633 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1203  phage terminase GpA  32.67 
 
 		 614 aa  253  6e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2514  terminase GpA  30.41 
 
 		 604 aa  253  6e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0731  putative phage terminase large subunit  31.53 
 
 		 626 aa  236  7e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2899  phage terminase GpA  31.42 
 
 		 618 aa  230  6e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.481651 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1257  phage terminase GpA  31.01 
 
 		 618 aa  229  1e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.268782 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1302  phage terminase GpA  29.73 
 
 		 650 aa  228  2e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.656027 
 
 
-
 
NC_002978  WD0265  prophage LambdaW1, terminase large subunit, putative  30.67 
 
 		 608 aa  225  2e-57  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2748  phage terminase GpA  30.87 
 
 		 618 aa  219  2e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00692747 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3068  tail assembly chaperone gp38  79.71 
 
 		 247 aa  218  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.577916  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1322  phage terminase GpA  31.23 
 
 		 618 aa  218  2.9999999999999998e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0526731 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2579  phage terminase GpA  30.36 
 
 		 618 aa  217  5e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20081 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4922  terminase GpA  29.22 
 
 		 616 aa  217  5e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0380287 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2050  phage terminase GpA  29.8 
 
 		 618 aa  217  5e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0184089 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2820  phage terminase GpA  30.61 
 
 		 618 aa  217  5.9999999999999996e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2658  prophage LambdaMc01, terminase, large subunit  29.33 
 
 		 656 aa  213  7e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3209  terminase GpA  29.52 
 
 		 651 aa  208  2e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0853  bacteriophage-like protein  30.16 
 
 		 660 aa  208  3e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0455431 
 
 
-
 
NC_002978  WD0597  prophage LambdaW4, terminase large subunit, putative  28.64 
 
 		 607 aa  206  8e-52  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.201542  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0131  phage terminase GpA  28.5 
 
 		 592 aa  203  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1195  terminase GpA  29.93 
 
 		 680 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.992301  normal  0.0460399 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0810  phage terminase GpA  29.4 
 
 		 614 aa  198  3e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00486859 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3042  terminase, large subunit, putative  29.62 
 
 		 678 aa  192  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.32998  normal  0.381128 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3412  terminase, large subunit  30.51 
 
 		 674 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2309  phage terminase GpA  26.36 
 
 		 605 aa  187  6e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1779  phage terminase GpA  27.06 
 
 		 593 aa  186  1.0000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0453691  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2094  Phage terminase large subunit (GpA)  27.84 
 
 		 708 aa  186  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0401019  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1889  terminase GpA  28.53 
 
 		 675 aa  185  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0378909  hitchhiker  0.0000599128 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1173  terminase GpA  28.38 
 
 		 650 aa  185  3e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1153  phage-related terminase large subunit  27.82 
 
 		 650 aa  179  1e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0414  phage-related terminase large subunit  27.82 
 
 		 650 aa  179  1e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2392  phage terminase GpA  25.37 
 
 		 587 aa  173  9e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1170  terminase GpA  26.81 
 
 		 684 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3337  phage terminase GpA  26.53 
 
 		 1179 aa  164  4.0000000000000004e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.27063  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3176  phage terminase GpA  27.79 
 
 		 693 aa  162  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3858  terminase GpA  27.68 
 
 		 692 aa  161  3e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0598  terminase GpA  27.83 
 
 		 720 aa  157  4e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5775  terminase GpA  27.11 
 
 		 689 aa  157  6e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0672  Phage terminase GpA  25.43 
 
 		 725 aa  145  3e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0279  terminase GpA  26 
 
 		 692 aa  139  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6601  putative phage terminase large subunit  25.08 
 
 		 677 aa  135  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2257  phage terminase GpA  25.89 
 
 		 725 aa  128  3e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.305557  normal  0.307973 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1108  terminase GpA  25.88 
 
 		 639 aa  124  6e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1688  terminase GpA  24.29 
 
 		 699 aa  124  7e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1877  phage terminase GpA  25.76 
 
 		 662 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1660  phage terminase GpA  23.64 
 
 		 680 aa  118  3.9999999999999997e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.284129 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1056  phage terminase GpA  23.87 
 
 		 641 aa  101  5e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.172605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3066  putative phage terminase GpA  25.87 
 
 		 700 aa  96.3  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.267291  hitchhiker  0.000127261 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1506  phage terminase GpA  24.92 
 
 		 711 aa  94.4  6e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.397253  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2193  phage terminase GpA  23.83 
 
 		 685 aa  91.7  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.457009  hitchhiker  0.0000566612 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2463  terminase GpA  25.6 
 
 		 690 aa  90.1  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1140  phage terminase large subunit  24.25 
 
 		 713 aa  85.9  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1405  phage terminase large subunit  23.96 
 
 		 713 aa  79.7  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000837607 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1068  phage terminase large subunit  23.96 
 
 		 713 aa  79.7  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000112902 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0896  phage terminase large subunit  24.56 
 
 		 700 aa  78.6  0.0000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3136  phage terminase large subunit  23.85 
 
 		 707 aa  76.6  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000155862 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3205  phage terminase large subunit  23.85 
 
 		 707 aa  76.3  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00573168 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1861  phage terminase large subunit  23.85 
 
 		 707 aa  76.3  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000286067 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4146  terminase GpA  23.08 
 
 		 692 aa  73.2  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.195337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0692  phage terminase large subunit  22.69 
 
 		 709 aa  69.3  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000410433 
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6527  terminase GpA  22.62 
 
 		 697 aa  62.8  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289331  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2311  Phage terminase large subunit (gp15)  24.47 
 
 		 671 aa  62  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3781  putative phage terminase large subunit  21.61 
 
 		 720 aa  47  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1355  Bacteriophage tail assembly protein-like protein  20.52 
 
 		 565 aa  45.1  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00357201  hitchhiker  0.000000000207538 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3357  phage terminase GpA  21.58 
 
 		 720 aa  44.7  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.27922 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>