81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_0896 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A1068  phage terminase large subunit  70.12 
 
 
713 aa  972    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000112902 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3205  phage terminase large subunit  71.03 
 
 
707 aa  1029    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00573168 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3136  phage terminase large subunit  70.6 
 
 
707 aa  1030    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000155862 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1861  phage terminase large subunit  71.03 
 
 
707 aa  1029    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000286067 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0896  phage terminase large subunit  100 
 
 
700 aa  1440    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1405  phage terminase large subunit  70.12 
 
 
713 aa  972    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000837607 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1140  phage terminase large subunit  70.12 
 
 
713 aa  973    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0692  phage terminase large subunit  65.76 
 
 
709 aa  965    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000410433 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3430  terminase GpA  40.52 
 
 
748 aa  483  1e-135  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3781  putative phage terminase large subunit  35.03 
 
 
720 aa  329  1.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3357  phage terminase GpA  34.62 
 
 
720 aa  323  5e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.27922 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3066  putative phage terminase GpA  30.24 
 
 
700 aa  265  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.267291  hitchhiker  0.000127261 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2193  phage terminase GpA  30.35 
 
 
685 aa  204  4e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.457009  hitchhiker  0.0000566612 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2050  phage terminase GpA  29.8 
 
 
618 aa  162  2e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0184089 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1257  phage terminase GpA  28.39 
 
 
618 aa  160  6e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.268782 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2748  phage terminase GpA  28.85 
 
 
618 aa  160  6e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00692747 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2579  phage terminase GpA  29.48 
 
 
618 aa  159  2e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.20081 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2899  phage terminase GpA  28.06 
 
 
618 aa  157  8e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.481651 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2820  phage terminase GpA  29.32 
 
 
618 aa  155  2.9999999999999998e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1322  phage terminase GpA  28.9 
 
 
618 aa  152  1e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0526731 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1506  phage terminase GpA  26.51 
 
 
711 aa  148  3e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.397253  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2463  terminase GpA  26.49 
 
 
690 aa  148  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3042  terminase, large subunit, putative  26.28 
 
 
678 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.32998  normal  0.381128 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1203  phage terminase GpA  28.17 
 
 
614 aa  141  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4146  terminase GpA  26.17 
 
 
692 aa  141  4.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.195337  normal 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4922  terminase GpA  24.96 
 
 
616 aa  134  6e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0380287 
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6527  terminase GpA  25.67 
 
 
697 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289331  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1195  terminase GpA  25 
 
 
680 aa  131  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.992301  normal  0.0460399 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1042  Phage terminase GpA  28.41 
 
 
665 aa  127  5e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0571086  normal  0.208633 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1889  terminase GpA  25.87 
 
 
675 aa  127  8.000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0378909  hitchhiker  0.0000599128 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2514  terminase GpA  25.2 
 
 
604 aa  127  9e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0731  putative phage terminase large subunit  25.49 
 
 
626 aa  125  2e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0597  prophage LambdaW4, terminase large subunit, putative  26.28 
 
 
607 aa  125  2e-27  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.201542  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0265  prophage LambdaW1, terminase large subunit, putative  27.26 
 
 
608 aa  125  4e-27  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0853  bacteriophage-like protein  25.4 
 
 
660 aa  117  6.9999999999999995e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0455431 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3412  terminase, large subunit  26.46 
 
 
674 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2658  prophage LambdaMc01, terminase, large subunit  24.92 
 
 
656 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3209  terminase GpA  25.08 
 
 
651 aa  108  3e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2094  Phage terminase large subunit (GpA)  24.86 
 
 
708 aa  107  8e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0401019  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1877  phage terminase GpA  23.17 
 
 
662 aa  106  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1170  terminase GpA  24.13 
 
 
684 aa  101  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6601  putative phage terminase large subunit  22.55 
 
 
677 aa  100  8e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1173  terminase GpA  23.73 
 
 
650 aa  92.4  2e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1153  phage-related terminase large subunit  23.55 
 
 
650 aa  90.9  7e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0414  phage-related terminase large subunit  23.55 
 
 
650 aa  90.9  7e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3858  terminase GpA  23.15 
 
 
692 aa  89  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1779  phage terminase GpA  23.68 
 
 
593 aa  89  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0453691  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0598  terminase GpA  25.08 
 
 
720 aa  88.6  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0131  phage terminase GpA  23.99 
 
 
592 aa  88.2  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3176  phage terminase GpA  23.16 
 
 
693 aa  88.6  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1675  phage terminase GpA  25.53 
 
 
660 aa  87.8  6e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1108  terminase GpA  22.9 
 
 
639 aa  87.4  9e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1302  phage terminase GpA  24.67 
 
 
650 aa  87  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.656027 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0810  phage terminase GpA  23.15 
 
 
614 aa  87  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00486859 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0780  terminase GpA  24.65 
 
 
665 aa  86.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.366774 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0784  phage terminase GpA  25.19 
 
 
665 aa  85.5  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0205779 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5775  terminase GpA  22.85 
 
 
689 aa  85.5  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3601  phage terminase GpA  25.31 
 
 
665 aa  85.5  0.000000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2815  phage terminase large subunit  24.4 
 
 
643 aa  84.3  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.326238 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0753  phage terminase GpA  25 
 
 
665 aa  83.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1286  phage terminase large subunit (GpA)  23.95 
 
 
642 aa  82.8  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1620  phage terminase large subunit  24.88 
 
 
641 aa  81.6  0.00000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0047658 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1056  phage terminase GpA  22.99 
 
 
641 aa  81.3  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.172605  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1783  phage terminase large subunit  24.88 
 
 
641 aa  79.3  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0374719 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3252  phage terminase GpA  24.42 
 
 
634 aa  78.6  0.0000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00731  hypothetical protein  24.56 
 
 
641 aa  78.6  0.0000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.634997  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10036  DNA packaging protein  24.56 
 
 
641 aa  78.6  0.0000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.722543  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1454  phage terminase large subunit (GpA)  23.69 
 
 
642 aa  78.6  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2091  terminase GpA  24.56 
 
 
641 aa  78.6  0.0000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.11571  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0279  terminase GpA  23.26 
 
 
692 aa  74.3  0.000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2257  phage terminase GpA  21.49 
 
 
725 aa  72  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.305557  normal  0.307973 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0672  Phage terminase GpA  25.42 
 
 
725 aa  70.1  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1660  phage terminase GpA  23.83 
 
 
680 aa  68.2  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.284129 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0832  phage terminase large subunit (GpA)  24.71 
 
 
529 aa  65.1  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.325192  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2042  terminase GpA  23.26 
 
 
641 aa  64.3  0.000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.324943  normal  0.0895639 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1688  terminase GpA  22.22 
 
 
699 aa  63.2  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3337  phage terminase GpA  22.09 
 
 
1179 aa  62.8  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.27063  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4687  terminase GpA  24.76 
 
 
698 aa  63.2  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2392  phage terminase GpA  22.64 
 
 
587 aa  60.8  0.00000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2230  phage terminase large subunit (GpA)  30.93 
 
 
654 aa  58.5  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2309  phage terminase GpA  21.38 
 
 
605 aa  54.7  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>