81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1675 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011353  ECH74115_1783  phage terminase large subunit  51.64 
 
 		 641 aa  639    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0374719 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2091  terminase GpA  51.8 
 
 		 641 aa  642    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.11571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1675  phage terminase GpA  100 
 
 		 660 aa  1384    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3601  phage terminase GpA  80.18 
 
 		 665 aa  1122    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3252  phage terminase GpA  80.65 
 
 		 634 aa  1070    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1620  phage terminase large subunit  51.8 
 
 		 641 aa  643    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0047658 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0780  terminase GpA  80.8 
 
 		 665 aa  1121    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.366774 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0784  phage terminase GpA  80.34 
 
 		 665 aa  1125    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0205779 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2042  terminase GpA  49.17 
 
 		 641 aa  652    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.324943  normal  0.0895639 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0753  phage terminase GpA  80.03 
 
 		 665 aa  1120    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10036  DNA packaging protein  51.8 
 
 		 641 aa  642    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.722543  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00731  hypothetical protein  51.8 
 
 		 641 aa  642    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.634997  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1286  phage terminase large subunit (GpA)  46.77 
 
 		 642 aa  607  9.999999999999999e-173  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2815  phage terminase large subunit  45.58 
 
 		 643 aa  592  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.326238 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1454  phage terminase large subunit (GpA)  46.77 
 
 		 642 aa  587  1e-166  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0832  phage terminase large subunit (GpA)  50.66 
 
 		 529 aa  561  1e-158  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.325192  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2230  phage terminase large subunit (GpA)  38.85 
 
 		 654 aa  434  1e-120  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01978  hypothetical protein  39.67 
 
 		 635 aa  431  1e-119  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1042  Phage terminase GpA  33.07 
 
 		 665 aa  300  4e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0571086  normal  0.208633 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4687  terminase GpA  31.48 
 
 		 698 aa  293  8e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1257  phage terminase GpA  30.21 
 
 		 618 aa  239  2e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.268782 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2899  phage terminase GpA  30.68 
 
 		 618 aa  237  4e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.481651 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1203  phage terminase GpA  31.53 
 
 		 614 aa  234  4.0000000000000004e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2820  phage terminase GpA  30.26 
 
 		 618 aa  228  4e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1322  phage terminase GpA  30.69 
 
 		 618 aa  227  6e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0526731 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2050  phage terminase GpA  29.95 
 
 		 618 aa  226  1e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0184089 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2579  phage terminase GpA  30.53 
 
 		 618 aa  225  2e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20081 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2748  phage terminase GpA  30.83 
 
 		 618 aa  225  2e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00692747 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2514  terminase GpA  28.86 
 
 		 604 aa  219  1e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4922  terminase GpA  29.67 
 
 		 616 aa  218  2e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0380287 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3209  terminase GpA  28.88 
 
 		 651 aa  213  1e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0853  bacteriophage-like protein  29.27 
 
 		 660 aa  212  2e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0455431 
 
 
-
 
NC_002978  WD0265  prophage LambdaW1, terminase large subunit, putative  27.93 
 
 		 608 aa  209  1e-52  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2658  prophage LambdaMc01, terminase, large subunit  28.29 
 
 		 656 aa  207  7e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0731  putative phage terminase large subunit  28.92 
 
 		 626 aa  203  7e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0597  prophage LambdaW4, terminase large subunit, putative  26.5 
 
 		 607 aa  198  3e-49  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.201542  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2094  Phage terminase large subunit (GpA)  25.58 
 
 		 708 aa  192  2e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0401019  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1302  phage terminase GpA  27.25 
 
 		 650 aa  186  2.0000000000000003e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.656027 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1779  phage terminase GpA  27.35 
 
 		 593 aa  183  7e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0453691  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0131  phage terminase GpA  27.83 
 
 		 592 aa  176  9e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0810  phage terminase GpA  26.95 
 
 		 614 aa  176  9e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00486859 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1195  terminase GpA  27.85 
 
 		 680 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.992301  normal  0.0460399 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1173  terminase GpA  26.58 
 
 		 650 aa  165  2.0000000000000002e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2309  phage terminase GpA  26.46 
 
 		 605 aa  163  7e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1889  terminase GpA  27.01 
 
 		 675 aa  161  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0378909  hitchhiker  0.0000599128 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0414  phage-related terminase large subunit  26.3 
 
 		 650 aa  161  4e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1153  phage-related terminase large subunit  26.3 
 
 		 650 aa  161  4e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1170  terminase GpA  25.8 
 
 		 684 aa  160  8e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3042  terminase, large subunit, putative  28.06 
 
 		 678 aa  159  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.32998  normal  0.381128 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3412  terminase, large subunit  28.39 
 
 		 674 aa  154  4e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2392  phage terminase GpA  24.53 
 
 		 587 aa  152  2e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5775  terminase GpA  24.23 
 
 		 689 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3858  terminase GpA  24.64 
 
 		 692 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2257  phage terminase GpA  26.66 
 
 		 725 aa  145  2e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.305557  normal  0.307973 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0279  terminase GpA  25.66 
 
 		 692 aa  141  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1660  phage terminase GpA  24.48 
 
 		 680 aa  139  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.284129 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3337  phage terminase GpA  26.29 
 
 		 1179 aa  138  4e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.27063  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1877  phage terminase GpA  25.75 
 
 		 662 aa  130  8.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1108  terminase GpA  25.96 
 
 		 639 aa  127  5e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0672  Phage terminase GpA  24.01 
 
 		 725 aa  127  6e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3068  tail assembly chaperone gp38  54.37 
 
 		 247 aa  124  4e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.577916  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3176  phage terminase GpA  24.96 
 
 		 693 aa  122  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0598  terminase GpA  24.37 
 
 		 720 aa  115  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6601  putative phage terminase large subunit  24.38 
 
 		 677 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1688  terminase GpA  22.75 
 
 		 699 aa  109  2e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2193  phage terminase GpA  23.8 
 
 		 685 aa  103  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.457009  hitchhiker  0.0000566612 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3205  phage terminase large subunit  23.73 
 
 		 707 aa  95.9  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00573168 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1861  phage terminase large subunit  23.73 
 
 		 707 aa  95.9  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000286067 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3136  phage terminase large subunit  23.77 
 
 		 707 aa  95.5  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000155862 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1056  phage terminase GpA  22.55 
 
 		 641 aa  92  3e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.172605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1506  phage terminase GpA  21.29 
 
 		 711 aa  90.5  8e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.397253  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3066  putative phage terminase GpA  21.71 
 
 		 700 aa  90.1  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.267291  hitchhiker  0.000127261 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0896  phage terminase large subunit  25.53 
 
 		 700 aa  87.8  6e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0692  phage terminase large subunit  23.24 
 
 		 709 aa  81.6  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000410433 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1140  phage terminase large subunit  23.74 
 
 		 713 aa  80.1  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1405  phage terminase large subunit  23.02 
 
 		 713 aa  77  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000837607 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1068  phage terminase large subunit  23.02 
 
 		 713 aa  77  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000112902 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4146  terminase GpA  24.19 
 
 		 692 aa  57  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.195337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3781  putative phage terminase large subunit  19.67 
 
 		 720 aa  55.5  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3357  phage terminase GpA  19.19 
 
 		 720 aa  54.3  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.27922 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2463  terminase GpA  21.19 
 
 		 690 aa  47  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>