85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_2309 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_3337  phage terminase GpA  67.44 
 
 
1179 aa  783    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.27063  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2392  phage terminase GpA  64.21 
 
 
587 aa  777    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0131  phage terminase GpA  60.51 
 
 
592 aa  709    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1779  phage terminase GpA  59.46 
 
 
593 aa  726    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0453691  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2309  phage terminase GpA  100 
 
 
605 aa  1244    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1042  Phage terminase GpA  36.73 
 
 
665 aa  348  2e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0571086  normal  0.208633 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2050  phage terminase GpA  33.67 
 
 
618 aa  308  1.0000000000000001e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0184089 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2579  phage terminase GpA  33.67 
 
 
618 aa  307  3e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.20081 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2820  phage terminase GpA  33.79 
 
 
618 aa  307  3e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2748  phage terminase GpA  33.5 
 
 
618 aa  306  6e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00692747 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2899  phage terminase GpA  33.84 
 
 
618 aa  304  3.0000000000000004e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.481651 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1257  phage terminase GpA  33.73 
 
 
618 aa  303  4.0000000000000003e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.268782 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1322  phage terminase GpA  33.11 
 
 
618 aa  300  5e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0526731 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4922  terminase GpA  32.14 
 
 
616 aa  293  8e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0380287 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1302  phage terminase GpA  30.63 
 
 
650 aa  276  8e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.656027 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0414  phage-related terminase large subunit  30.46 
 
 
650 aa  274  3e-72  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1153  phage-related terminase large subunit  30.46 
 
 
650 aa  274  3e-72  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1173  terminase GpA  30.29 
 
 
650 aa  274  3e-72  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0731  putative phage terminase large subunit  31.14 
 
 
626 aa  256  7e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2094  Phage terminase large subunit (GpA)  30.8 
 
 
708 aa  255  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0401019  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0265  prophage LambdaW1, terminase large subunit, putative  30.89 
 
 
608 aa  251  2e-65  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3042  terminase, large subunit, putative  31.47 
 
 
678 aa  249  1e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.32998  normal  0.381128 
 
 
-
 
NC_002978  WD0597  prophage LambdaW4, terminase large subunit, putative  30.12 
 
 
607 aa  248  2e-64  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.201542  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2658  prophage LambdaMc01, terminase, large subunit  30.76 
 
 
656 aa  246  6e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3176  phage terminase GpA  32.88 
 
 
693 aa  246  8e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2514  terminase GpA  29.2 
 
 
604 aa  241  2e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3209  terminase GpA  30.13 
 
 
651 aa  240  4e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0853  bacteriophage-like protein  30.47 
 
 
660 aa  239  1e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0455431 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1203  phage terminase GpA  31.43 
 
 
614 aa  239  1e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1195  terminase GpA  30.46 
 
 
680 aa  237  4e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.992301  normal  0.0460399 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0810  phage terminase GpA  30 
 
 
614 aa  234  4.0000000000000004e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00486859 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1889  terminase GpA  29.87 
 
 
675 aa  229  1e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0378909  hitchhiker  0.0000599128 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3412  terminase, large subunit  29.42 
 
 
674 aa  220  5e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1877  phage terminase GpA  28.85 
 
 
662 aa  218  2e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1108  terminase GpA  28.46 
 
 
639 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1454  phage terminase large subunit (GpA)  27.3 
 
 
642 aa  211  3e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3858  terminase GpA  28.32 
 
 
692 aa  210  5e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1286  phage terminase large subunit (GpA)  27.33 
 
 
642 aa  209  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0279  terminase GpA  28.34 
 
 
692 aa  207  6e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5775  terminase GpA  27.62 
 
 
689 aa  205  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1170  terminase GpA  28.69 
 
 
684 aa  204  3e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2815  phage terminase large subunit  28.07 
 
 
643 aa  200  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.326238 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1620  phage terminase large subunit  26.52 
 
 
641 aa  189  1e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0047658 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1783  phage terminase large subunit  26.7 
 
 
641 aa  189  2e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0374719 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00731  hypothetical protein  26.36 
 
 
641 aa  187  4e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.634997  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10036  DNA packaging protein  26.36 
 
 
641 aa  187  4e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.722543  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2091  terminase GpA  26.36 
 
 
641 aa  187  5e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.11571  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2042  terminase GpA  27.23 
 
 
641 aa  186  9e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.324943  normal  0.0895639 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2257  phage terminase GpA  26.05 
 
 
725 aa  182  2e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.305557  normal  0.307973 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6601  putative phage terminase large subunit  24.62 
 
 
677 aa  179  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2230  phage terminase large subunit (GpA)  26.76 
 
 
654 aa  174  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4687  terminase GpA  26.28 
 
 
698 aa  172  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0672  Phage terminase GpA  26.83 
 
 
725 aa  172  1e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1675  phage terminase GpA  26.46 
 
 
660 aa  163  7e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0832  phage terminase large subunit (GpA)  26.22 
 
 
529 aa  163  7e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.325192  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3252  phage terminase GpA  25.75 
 
 
634 aa  162  2e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01978  hypothetical protein  25 
 
 
635 aa  162  2e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0780  terminase GpA  25.91 
 
 
665 aa  156  1e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.366774 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0784  phage terminase GpA  25.91 
 
 
665 aa  153  1e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0205779 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3601  phage terminase GpA  25.91 
 
 
665 aa  153  1e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0753  phage terminase GpA  25.82 
 
 
665 aa  150  5e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1660  phage terminase GpA  24.2 
 
 
680 aa  143  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.284129 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1688  terminase GpA  26.02 
 
 
699 aa  131  4.0000000000000003e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1056  phage terminase GpA  24.74 
 
 
641 aa  109  1e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.172605  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0598  terminase GpA  23.09 
 
 
720 aa  107  8e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2311  Phage terminase large subunit (gp15)  23.31 
 
 
671 aa  99  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1506  phage terminase GpA  24.81 
 
 
711 aa  99.4  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.397253  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2193  phage terminase GpA  25.08 
 
 
685 aa  98.6  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.457009  hitchhiker  0.0000566612 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2463  terminase GpA  23.61 
 
 
690 aa  79  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4146  terminase GpA  24.7 
 
 
692 aa  78.2  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.195337  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3357  phage terminase GpA  20.97 
 
 
720 aa  76.6  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.27922 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3781  putative phage terminase large subunit  21 
 
 
720 aa  76.6  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0692  phage terminase large subunit  22.34 
 
 
709 aa  70.5  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000410433 
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6527  terminase GpA  21.96 
 
 
697 aa  69.7  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289331  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1861  phage terminase large subunit  22.67 
 
 
707 aa  65.9  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000286067 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3205  phage terminase large subunit  22.67 
 
 
707 aa  65.9  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00573168 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3136  phage terminase large subunit  22.67 
 
 
707 aa  65.1  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000155862 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3430  terminase GpA  24.23 
 
 
748 aa  63.9  0.000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1355  Bacteriophage tail assembly protein-like protein  25.76 
 
 
565 aa  61.6  0.00000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00357201  hitchhiker  0.000000000207538 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3066  putative phage terminase GpA  22.94 
 
 
700 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.267291  hitchhiker  0.000127261 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1405  phage terminase large subunit  21.28 
 
 
713 aa  58.9  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000837607 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1140  phage terminase large subunit  21.53 
 
 
713 aa  59.3  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1068  phage terminase large subunit  21.28 
 
 
713 aa  58.9  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000112902 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0896  phage terminase large subunit  21.38 
 
 
700 aa  54.7  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3068  tail assembly chaperone gp38  32.1 
 
 
247 aa  46.6  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.577916  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>