86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1257 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1257  phage terminase GpA  100 
 
 
618 aa  1278    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.268782 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1322  phage terminase GpA  84.63 
 
 
618 aa  1091    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0526731 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2050  phage terminase GpA  81.55 
 
 
618 aa  1058    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0184089 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2579  phage terminase GpA  83.98 
 
 
618 aa  1083    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.20081 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2748  phage terminase GpA  82.52 
 
 
618 aa  1066    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00692747 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2820  phage terminase GpA  82.04 
 
 
618 aa  1060    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2899  phage terminase GpA  97.25 
 
 
618 aa  1244    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.481651 
 
 
-
 
NC_002978  WD0265  prophage LambdaW1, terminase large subunit, putative  52.82 
 
 
608 aa  560  1e-158  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0597  prophage LambdaW4, terminase large subunit, putative  51.2 
 
 
607 aa  555  1e-156  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.201542  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0853  bacteriophage-like protein  48.31 
 
 
660 aa  536  1e-151  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0455431 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3209  terminase GpA  47.78 
 
 
651 aa  531  1e-149  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2658  prophage LambdaMc01, terminase, large subunit  47.71 
 
 
656 aa  526  1e-148  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0731  putative phage terminase large subunit  46.6 
 
 
626 aa  501  1e-140  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0810  phage terminase GpA  47.09 
 
 
614 aa  468  9.999999999999999e-131  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00486859 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1042  Phage terminase GpA  42.32 
 
 
665 aa  442  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0571086  normal  0.208633 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4922  terminase GpA  41.81 
 
 
616 aa  438  1e-121  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0380287 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1203  phage terminase GpA  44.91 
 
 
614 aa  427  1e-118  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3412  terminase, large subunit  40.03 
 
 
674 aa  404  1e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1195  terminase GpA  38.78 
 
 
680 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.992301  normal  0.0460399 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3042  terminase, large subunit, putative  40.57 
 
 
678 aa  398  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.32998  normal  0.381128 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2514  terminase GpA  40.67 
 
 
604 aa  396  1e-109  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1302  phage terminase GpA  40.31 
 
 
650 aa  381  1e-104  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.656027 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1889  terminase GpA  37.44 
 
 
675 aa  369  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0378909  hitchhiker  0.0000599128 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0414  phage-related terminase large subunit  39.93 
 
 
650 aa  371  1e-101  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1173  terminase GpA  39.76 
 
 
650 aa  369  1e-101  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1153  phage-related terminase large subunit  39.93 
 
 
650 aa  371  1e-101  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2094  Phage terminase large subunit (GpA)  36.4 
 
 
708 aa  367  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0401019  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3176  phage terminase GpA  36.88 
 
 
693 aa  338  9.999999999999999e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1170  terminase GpA  35.77 
 
 
684 aa  334  2e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0131  phage terminase GpA  37.14 
 
 
592 aa  334  3e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0672  Phage terminase GpA  32.92 
 
 
725 aa  328  2.0000000000000001e-88  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1779  phage terminase GpA  34.32 
 
 
593 aa  319  1e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0453691  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2309  phage terminase GpA  33.73 
 
 
605 aa  303  4.0000000000000003e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2392  phage terminase GpA  34.35 
 
 
587 aa  304  4.0000000000000003e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3858  terminase GpA  35.22 
 
 
692 aa  299  9e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5775  terminase GpA  34.66 
 
 
689 aa  299  1e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0279  terminase GpA  34.85 
 
 
692 aa  288  2e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3337  phage terminase GpA  33.1 
 
 
1179 aa  276  8e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.27063  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0598  terminase GpA  31.99 
 
 
720 aa  252  2e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3252  phage terminase GpA  30.88 
 
 
634 aa  243  5e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1286  phage terminase large subunit (GpA)  31.57 
 
 
642 aa  240  5.999999999999999e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1877  phage terminase GpA  31.6 
 
 
662 aa  240  6.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1675  phage terminase GpA  30.21 
 
 
660 aa  239  1e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6601  putative phage terminase large subunit  31.05 
 
 
677 aa  239  1e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1454  phage terminase large subunit (GpA)  31.69 
 
 
642 aa  238  4e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3601  phage terminase GpA  31.07 
 
 
665 aa  237  4e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0780  terminase GpA  30.96 
 
 
665 aa  236  6e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.366774 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0784  phage terminase GpA  30.91 
 
 
665 aa  237  6e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0205779 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0753  phage terminase GpA  30.76 
 
 
665 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1108  terminase GpA  32.43 
 
 
639 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1688  terminase GpA  29.04 
 
 
699 aa  231  3e-59  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2091  terminase GpA  31.27 
 
 
641 aa  228  3e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.11571  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10036  DNA packaging protein  31.48 
 
 
641 aa  228  3e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.722543  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00731  hypothetical protein  31.48 
 
 
641 aa  228  3e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.634997  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2230  phage terminase large subunit (GpA)  30.72 
 
 
654 aa  227  4e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1620  phage terminase large subunit  31.14 
 
 
641 aa  225  2e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0047658 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1783  phage terminase large subunit  31.14 
 
 
641 aa  224  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0374719 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01978  hypothetical protein  31.21 
 
 
635 aa  224  4.9999999999999996e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2042  terminase GpA  31.65 
 
 
641 aa  223  6e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.324943  normal  0.0895639 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2815  phage terminase large subunit  30.2 
 
 
643 aa  220  5e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.326238 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2257  phage terminase GpA  29.48 
 
 
725 aa  211  3e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.305557  normal  0.307973 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4687  terminase GpA  27.85 
 
 
698 aa  190  8e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1660  phage terminase GpA  28.64 
 
 
680 aa  189  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.284129 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1140  phage terminase large subunit  29.48 
 
 
713 aa  187  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1068  phage terminase large subunit  28.19 
 
 
713 aa  186  8e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000112902 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1405  phage terminase large subunit  28.19 
 
 
713 aa  186  8e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000837607 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0832  phage terminase large subunit (GpA)  29.11 
 
 
529 aa  181  4e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.325192  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2311  Phage terminase large subunit (gp15)  26.42 
 
 
671 aa  177  5e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1506  phage terminase GpA  27.8 
 
 
711 aa  170  6e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.397253  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3136  phage terminase large subunit  28.14 
 
 
707 aa  163  8.000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000155862 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1861  phage terminase large subunit  28.14 
 
 
707 aa  163  9e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000286067 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3205  phage terminase large subunit  28.14 
 
 
707 aa  163  9e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00573168 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0896  phage terminase large subunit  28.39 
 
 
700 aa  160  5e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0692  phage terminase large subunit  28.21 
 
 
709 aa  158  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000410433 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1056  phage terminase GpA  28.18 
 
 
641 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.172605  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4146  terminase GpA  27.14 
 
 
692 aa  132  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.195337  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3066  putative phage terminase GpA  26.82 
 
 
700 aa  131  5.0000000000000004e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.267291  hitchhiker  0.000127261 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2193  phage terminase GpA  26.07 
 
 
685 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.457009  hitchhiker  0.0000566612 
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6527  terminase GpA  26.16 
 
 
697 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289331  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2463  terminase GpA  26.54 
 
 
690 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3430  terminase GpA  25.3 
 
 
748 aa  104  5e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3357  phage terminase GpA  24.15 
 
 
720 aa  99.8  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.27922 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3781  putative phage terminase large subunit  23.58 
 
 
720 aa  98.2  4e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6670  hypothetical protein  29.19 
 
 
330 aa  63.9  0.000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03899  product of A truncated bacteriophage gene protein  70.45 
 
 
97 aa  60.5  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.670346  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1355  Bacteriophage tail assembly protein-like protein  22.22 
 
 
565 aa  55.8  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00357201  hitchhiker  0.000000000207538 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>