72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2311 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2311  Phage terminase large subunit (gp15)  100 
 
 		 671 aa  1404    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6601  putative phage terminase large subunit  40.23 
 
 		 677 aa  436  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0597  prophage LambdaW4, terminase large subunit, putative  29.11 
 
 		 607 aa  245  1.9999999999999999e-63  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.201542  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0265  prophage LambdaW1, terminase large subunit, putative  29.58 
 
 		 608 aa  242  2e-62  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0731  putative phage terminase large subunit  30.08 
 
 		 626 aa  234  4.0000000000000004e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0853  bacteriophage-like protein  29.95 
 
 		 660 aa  227  6e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0455431 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3209  terminase GpA  29.15 
 
 		 651 aa  223  9.999999999999999e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2658  prophage LambdaMc01, terminase, large subunit  29.36 
 
 		 656 aa  221  5e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2899  phage terminase GpA  26.26 
 
 		 618 aa  179  1e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.481651 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3412  terminase, large subunit  28 
 
 		 674 aa  177  4e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1195  terminase GpA  27.33 
 
 		 680 aa  177  5e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.992301  normal  0.0460399 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1257  phage terminase GpA  26.42 
 
 		 618 aa  177  6e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.268782 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3042  terminase, large subunit, putative  27.1 
 
 		 678 aa  175  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.32998  normal  0.381128 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0810  phage terminase GpA  27.18 
 
 		 614 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00486859 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2820  phage terminase GpA  26.11 
 
 		 618 aa  172  1e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2748  phage terminase GpA  26.11 
 
 		 618 aa  171  3e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00692747 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1322  phage terminase GpA  26.47 
 
 		 618 aa  171  5e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0526731 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1170  terminase GpA  25.68 
 
 		 684 aa  170  6e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2050  phage terminase GpA  25.75 
 
 		 618 aa  167  5.9999999999999996e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0184089 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2579  phage terminase GpA  25.96 
 
 		 618 aa  167  6.9999999999999995e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20081 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2514  terminase GpA  27.29 
 
 		 604 aa  166  9e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1660  phage terminase GpA  25.95 
 
 		 680 aa  166  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.284129 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0598  terminase GpA  26.5 
 
 		 720 aa  164  6e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4922  terminase GpA  26.93 
 
 		 616 aa  154  4e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0380287 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5775  terminase GpA  25.97 
 
 		 689 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3858  terminase GpA  25.51 
 
 		 692 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1173  terminase GpA  24.75 
 
 		 650 aa  146  1e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0279  terminase GpA  25.04 
 
 		 692 aa  143  8e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4687  terminase GpA  25.7 
 
 		 698 aa  143  8e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1153  phage-related terminase large subunit  24.26 
 
 		 650 aa  141  3.9999999999999997e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0414  phage-related terminase large subunit  24.26 
 
 		 650 aa  141  3.9999999999999997e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1302  phage terminase GpA  24.38 
 
 		 650 aa  138  4e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.656027 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0672  Phage terminase GpA  23.63 
 
 		 725 aa  137  5e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1688  terminase GpA  25.04 
 
 		 699 aa  130  7.000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2257  phage terminase GpA  24.24 
 
 		 725 aa  129  3e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.305557  normal  0.307973 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1203  phage terminase GpA  25.65 
 
 		 614 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1042  Phage terminase GpA  24.27 
 
 		 665 aa  115  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0571086  normal  0.208633 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2309  phage terminase GpA  23.31 
 
 		 605 aa  99.8  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0131  phage terminase GpA  22.72 
 
 		 592 aa  99.8  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1056  phage terminase GpA  22.26 
 
 		 641 aa  95.9  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.172605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3176  phage terminase GpA  21.84 
 
 		 693 aa  95.5  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1108  terminase GpA  20.58 
 
 		 639 aa  91.3  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1877  phage terminase GpA  20.24 
 
 		 662 aa  90.9  7e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2094  Phage terminase large subunit (GpA)  25.04 
 
 		 708 aa  89.4  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0401019  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1779  phage terminase GpA  21.51 
 
 		 593 aa  89  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0453691  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1889  terminase GpA  23.08 
 
 		 675 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0378909  hitchhiker  0.0000599128 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1286  phage terminase large subunit (GpA)  23.2 
 
 		 642 aa  76.6  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2392  phage terminase GpA  22.1 
 
 		 587 aa  74.3  0.000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2230  phage terminase large subunit (GpA)  21.74 
 
 		 654 aa  67  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3337  phage terminase GpA  21.44 
 
 		 1179 aa  67  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.27063  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1454  phage terminase large subunit (GpA)  22.7 
 
 		 642 aa  67  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1506  phage terminase GpA  24.34 
 
 		 711 aa  65.9  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.397253  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2463  terminase GpA  27.73 
 
 		 690 aa  64.7  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00731  hypothetical protein  22.34 
 
 		 641 aa  61.6  0.00000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.634997  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10036  DNA packaging protein  22.34 
 
 		 641 aa  61.6  0.00000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.722543  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1620  phage terminase large subunit  24.15 
 
 		 641 aa  61.6  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0047658 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2091  terminase GpA  24.4 
 
 		 641 aa  61.6  0.00000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.11571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1783  phage terminase large subunit  24.15 
 
 		 641 aa  60.5  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0374719 
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6527  terminase GpA  26.99 
 
 		 697 aa  58.5  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289331  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4146  terminase GpA  23.36 
 
 		 692 aa  58.5  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.195337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2815  phage terminase large subunit  21.91 
 
 		 643 aa  55.5  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.326238 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3066  putative phage terminase GpA  23.22 
 
 		 700 aa  54.7  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.267291  hitchhiker  0.000127261 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1140  phage terminase large subunit  22.64 
 
 		 713 aa  53.5  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2193  phage terminase GpA  21.7 
 
 		 685 aa  52.4  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.457009  hitchhiker  0.0000566612 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1405  phage terminase large subunit  22.48 
 
 		 713 aa  50.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000837607 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1068  phage terminase large subunit  22.48 
 
 		 713 aa  50.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000112902 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01978  hypothetical protein  21.03 
 
 		 635 aa  50.1  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2042  terminase GpA  22.02 
 
 		 641 aa  47.8  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.324943  normal  0.0895639 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0692  phage terminase large subunit  21.36 
 
 		 709 aa  47.8  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000410433 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3205  phage terminase large subunit  20.36 
 
 		 707 aa  47.4  0.0008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00573168 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1861  phage terminase large subunit  20.36 
 
 		 707 aa  47.4  0.0008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000286067 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3136  phage terminase large subunit  20.36 
 
 		 707 aa  47.4  0.0009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000155862 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>