82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_1688 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010577  XfasM23_1688  terminase GpA  100 
 
 		 699 aa  1443    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0647  phage-related terminase large subunit  95.74 
 
 		 237 aa  434  1e-120  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0265  prophage LambdaW1, terminase large subunit, putative  31.54 
 
 		 608 aa  269  1e-70  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0597  prophage LambdaW4, terminase large subunit, putative  30.52 
 
 		 607 aa  261  4e-68  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.201542  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2658  prophage LambdaMc01, terminase, large subunit  31.43 
 
 		 656 aa  259  1e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0731  putative phage terminase large subunit  31.85 
 
 		 626 aa  251  4e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0853  bacteriophage-like protein  31.33 
 
 		 660 aa  249  1e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0455431 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1170  terminase GpA  29.25 
 
 		 684 aa  248  2e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3209  terminase GpA  30.48 
 
 		 651 aa  246  6.999999999999999e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3042  terminase, large subunit, putative  29.88 
 
 		 678 aa  239  2e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.32998  normal  0.381128 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0810  phage terminase GpA  32.51 
 
 		 614 aa  235  2.0000000000000002e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00486859 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1195  terminase GpA  30.34 
 
 		 680 aa  233  1e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.992301  normal  0.0460399 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1257  phage terminase GpA  29.04 
 
 		 618 aa  230  7e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.268782 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2899  phage terminase GpA  28.84 
 
 		 618 aa  229  1e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.481651 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1042  Phage terminase GpA  30.81 
 
 		 665 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0571086  normal  0.208633 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2050  phage terminase GpA  28.27 
 
 		 618 aa  213  1e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0184089 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2748  phage terminase GpA  28.34 
 
 		 618 aa  211  3e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00692747 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3412  terminase, large subunit  29.25 
 
 		 674 aa  211  4e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2579  phage terminase GpA  28.27 
 
 		 618 aa  211  5e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20081 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1322  phage terminase GpA  28.43 
 
 		 618 aa  210  6e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0526731 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2820  phage terminase GpA  28.1 
 
 		 618 aa  209  1e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2514  terminase GpA  29.93 
 
 		 604 aa  184  4.0000000000000006e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0598  terminase GpA  27.08 
 
 		 720 aa  184  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0672  Phage terminase GpA  31.75 
 
 		 725 aa  183  1e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1302  phage terminase GpA  28.1 
 
 		 650 aa  181  4.999999999999999e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.656027 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1660  phage terminase GpA  28.18 
 
 		 680 aa  162  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.284129 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4922  terminase GpA  29.1 
 
 		 616 aa  160  7e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0380287 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0414  phage-related terminase large subunit  26.58 
 
 		 650 aa  159  2e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1153  phage-related terminase large subunit  26.58 
 
 		 650 aa  159  2e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1173  terminase GpA  27.8 
 
 		 650 aa  158  3e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1203  phage terminase GpA  26.63 
 
 		 614 aa  152  2e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2815  phage terminase large subunit  24.74 
 
 		 643 aa  150  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.326238 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1454  phage terminase large subunit (GpA)  25.08 
 
 		 642 aa  150  9e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6601  putative phage terminase large subunit  26.3 
 
 		 677 aa  150  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1286  phage terminase large subunit (GpA)  25.38 
 
 		 642 aa  144  4e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2094  Phage terminase large subunit (GpA)  26.09 
 
 		 708 aa  145  4e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0401019  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0279  terminase GpA  24.89 
 
 		 692 aa  143  9.999999999999999e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5775  terminase GpA  24.7 
 
 		 689 aa  142  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3858  terminase GpA  24.3 
 
 		 692 aa  141  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4687  terminase GpA  24.1 
 
 		 698 aa  138  3.0000000000000003e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2257  phage terminase GpA  24.5 
 
 		 725 aa  137  7.000000000000001e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.305557  normal  0.307973 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1877  phage terminase GpA  26.97 
 
 		 662 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1779  phage terminase GpA  25.84 
 
 		 593 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0453691  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2311  Phage terminase large subunit (gp15)  25.48 
 
 		 671 aa  132  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2309  phage terminase GpA  26.02 
 
 		 605 aa  131  5.0000000000000004e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2042  terminase GpA  25.32 
 
 		 641 aa  127  7e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.324943  normal  0.0895639 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3176  phage terminase GpA  25.04 
 
 		 693 aa  125  3e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1620  phage terminase large subunit  24.23 
 
 		 641 aa  124  4e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0047658 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1783  phage terminase large subunit  25 
 
 		 641 aa  124  8e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0374719 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00731  hypothetical protein  24.44 
 
 		 641 aa  123  9e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.634997  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10036  DNA packaging protein  24.44 
 
 		 641 aa  123  9e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.722543  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2091  terminase GpA  24.44 
 
 		 641 aa  123  9.999999999999999e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.11571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1889  terminase GpA  23.77 
 
 		 675 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0378909  hitchhiker  0.0000599128 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0832  phage terminase large subunit (GpA)  24.23 
 
 		 529 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.325192  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0131  phage terminase GpA  24.63 
 
 		 592 aa  120  7.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1108  terminase GpA  25.31 
 
 		 639 aa  112  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2392  phage terminase GpA  24.22 
 
 		 587 aa  111  5e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1675  phage terminase GpA  22.75 
 
 		 660 aa  109  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0780  terminase GpA  23.68 
 
 		 665 aa  108  4e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.366774 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3601  phage terminase GpA  23.04 
 
 		 665 aa  108  5e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0784  phage terminase GpA  23.68 
 
 		 665 aa  107  7e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0205779 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0753  phage terminase GpA  22.83 
 
 		 665 aa  107  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3337  phage terminase GpA  24.95 
 
 		 1179 aa  105  3e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.27063  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2230  phage terminase large subunit (GpA)  23.96 
 
 		 654 aa  102  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2193  phage terminase GpA  24.42 
 
 		 685 aa  102  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.457009  hitchhiker  0.0000566612 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01978  hypothetical protein  24.43 
 
 		 635 aa  100  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3252  phage terminase GpA  22.37 
 
 		 634 aa  97.4  8e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3066  putative phage terminase GpA  21.47 
 
 		 700 aa  81.3  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.267291  hitchhiker  0.000127261 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1056  phage terminase GpA  23.69 
 
 		 641 aa  75.9  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.172605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3136  phage terminase large subunit  22.08 
 
 		 707 aa  75.1  0.000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000155862 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1861  phage terminase large subunit  22.08 
 
 		 707 aa  75.1  0.000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000286067 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3205  phage terminase large subunit  22.08 
 
 		 707 aa  75.1  0.000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00573168 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1140  phage terminase large subunit  21.34 
 
 		 713 aa  72.4  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1506  phage terminase GpA  24.25 
 
 		 711 aa  71.2  0.00000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.397253  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1068  phage terminase large subunit  21.19 
 
 		 713 aa  69.3  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000112902 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1405  phage terminase large subunit  21.19 
 
 		 713 aa  69.3  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000837607 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0896  phage terminase large subunit  22.56 
 
 		 700 aa  64.3  0.000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0692  phage terminase large subunit  21.39 
 
 		 709 aa  51.2  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000410433 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2463  terminase GpA  22.4 
 
 		 690 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3781  putative phage terminase large subunit  20.26 
 
 		 720 aa  45.8  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6527  terminase GpA  24 
 
 		 697 aa  45.4  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289331  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3357  phage terminase GpA  20.78 
 
 		 720 aa  44.3  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.27922 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>