More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_38583 on replicon NC_009359
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009359  OSTLU_38583  predicted protein  100 
 
 		 754 aa  1553    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.449683  normal  0.114344 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1827  transcription-repair coupling factor  40.54 
 
 		 1169 aa  476  1e-133  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2767  transcription-repair coupling factor  40.22 
 
 		 1188 aa  478  1e-133  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14371  transcriptional-repair coupling factor  41.02 
 
 		 1193 aa  473  1e-132  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0369  transcriptional-repair coupling factor  45.15 
 
 		 1167 aa  468  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3738  transcription-repair coupling factor  40.86 
 
 		 1168 aa  468  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4404  transcription-repair coupling factor  39.05 
 
 		 1166 aa  463  1e-129  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.353859  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0961  transcriptional-repair coupling factor  39.46 
 
 		 1174 aa  463  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.489301  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4373  transcription-repair coupling factor  39.53 
 
 		 1158 aa  464  1e-129  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.456695  hitchhiker  0.00000184147 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4312  transcription-repair coupling factor  39.37 
 
 		 1158 aa  464  1e-129  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10511  transcriptional-repair coupling factor  44.96 
 
 		 1167 aa  466  1e-129  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605187 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10301  transcriptional-repair coupling factor  38.41 
 
 		 1170 aa  464  1e-129  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10301  transcriptional-repair coupling factor  38.57 
 
 		 1169 aa  463  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1176  transcription-repair coupling factor  39.69 
 
 		 1192 aa  461  9.999999999999999e-129  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.141232  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1300  transcription-repair coupling factor  38.31 
 
 		 1192 aa  461  9.999999999999999e-129  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1326  transcription-repair coupling factor  39.56 
 
 		 1153 aa  461  9.999999999999999e-129  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09151  transcriptional-repair coupling factor  44.28 
 
 		 1175 aa  460  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1671  transcription-repair coupling factor  39.4 
 
 		 1180 aa  457  1e-127  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09271  transcriptional-repair coupling factor  38.41 
 
 		 1169 aa  443  1e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.254503  hitchhiker  0.0000230767 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0011  transcription-repair coupling factor  40.2 
 
 		 1162 aa  440  9.999999999999999e-123  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21200  transcription-repair coupling factor  38.38 
 
 		 1170 aa  435  1e-120  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.010694  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0141  transcription-repair coupling factor  37.95 
 
 		 1169 aa  428  1e-118  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0067  transcription-repair coupling factor  38.18 
 
 		 1196 aa  423  1e-117  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0593  transcription-repair coupling factor  39.14 
 
 		 1165 aa  421  1e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0271  transcription-repair coupling factor  37.88 
 
 		 1165 aa  422  1e-116  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2632  transcription-repair coupling factor  39.42 
 
 		 1178 aa  421  1e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0262  transcription-repair coupling factor  39.52 
 
 		 1179 aa  416  9.999999999999999e-116  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1855  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.72 
 
 		 901 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3660  transcription-repair coupling factor  42.8 
 
 		 1265 aa  418  9.999999999999999e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.593932 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1478  transcription-repair coupling factor  41.8 
 
 		 1246 aa  418  9.999999999999999e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.313815 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1287  transcription-repair coupling factor  36.63 
 
 		 1155 aa  416  1e-114  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0502901  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0052  transcription-repair coupling factor  41.75 
 
 		 1176 aa  412  1e-114  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3090  transcription-repair coupling factor  37.14 
 
 		 1174 aa  413  1e-114  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.192538  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0052  transcription-repair coupling factor  41.75 
 
 		 1176 aa  412  1e-114  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4549  transcription-repair coupling factor  37.32 
 
 		 1182 aa  415  1e-114  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.191603 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3741  transcription-repair coupling factor  42.26 
 
 		 1182 aa  414  1e-114  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.34254 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0007  transcription-repair coupling factor  37.52 
 
 		 1168 aa  414  1e-114  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0048  transcription-repair coupling factor  38.73 
 
 		 1176 aa  413  1e-114  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0051  transcription-repair coupling factor  41.75 
 
 		 1176 aa  412  1e-113  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0059  transcription-repair coupling factor  41.75 
 
 		 1176 aa  412  1e-113  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0048  transcription-repair coupling factor  41.75 
 
 		 1178 aa  412  1e-113  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0048  transcription-repair coupling factor  41.75 
 
 		 1176 aa  412  1e-113  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5258  transcription-repair coupling factor  41.75 
 
 		 1176 aa  411  1e-113  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0525  transcription-repair coupling factor  41.39 
 
 		 1168 aa  412  1e-113  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0538  transcription-repair coupling factor  41.39 
 
 		 1168 aa  412  1e-113  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0058  transcription-repair coupling factor  41.94 
 
 		 1176 aa  412  1e-113  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0399  transcription-repair coupling factor  38.96 
 
 		 1179 aa  410  1e-113  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0062  transcription-repair coupling factor  41.75 
 
 		 1176 aa  412  1e-113  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3728  transcription-repair coupling factor  37.96 
 
 		 1103 aa  409  1.0000000000000001e-112  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0638  transcription-repair coupling factor  36.98 
 
 		 1141 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.138681  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2656  transcription-repair coupling factor  40.76 
 
 		 1207 aa  407  1.0000000000000001e-112  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0357057  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0048  transcription-repair coupling factor  41.55 
 
 		 1176 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0050  transcription-repair coupling factor  37.84 
 
 		 1177 aa  404  1e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1642  transcription-repair coupling factor  38 
 
 		 1158 aa  404  1e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1292  transcription-repair coupling factor  39.93 
 
 		 1161 aa  404  1e-111  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1342  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.13 
 
 		 893 aa  404  1e-111  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0160807  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1344  transcription-repair coupling factor  38.35 
 
 		 893 aa  404  1e-111  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000252576  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0048  transcription-repair coupling factor  37.52 
 
 		 1177 aa  403  1e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5241  transcription-repair coupling factor  36.38 
 
 		 1112 aa  403  1e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0182  transcription-repair coupling factor  37.48 
 
 		 1183 aa  404  1e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1511  transcription-repair coupling factor  36.5 
 
 		 1059 aa  404  1e-111  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2938  transcription-repair coupling factor  38.56 
 
 		 1172 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0124  transcription-repair coupling factor  40.34 
 
 		 1147 aa  401  9.999999999999999e-111  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00760781  normal  0.18165 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0073  transcription-repair coupling factor  41.46 
 
 		 1073 aa  402  9.999999999999999e-111  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1202  transcription-repair coupling factor  39.35 
 
 		 1121 aa  396  1e-109  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.851406  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1355  transcription-repair coupling factor  35.91 
 
 		 1150 aa  397  1e-109  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1974  transcription factor CarD  37.94 
 
 		 988 aa  397  1e-109  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0348295 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0081  transcription-repair coupling factor  36.95 
 
 		 1183 aa  398  1e-109  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000883466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0140  transcription-repair coupling factor  36.63 
 
 		 1159 aa  396  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00133746  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0909  transcription-repair coupling factor  41.97 
 
 		 1054 aa  397  1e-109  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0620  transcription-repair coupling factor  41.25 
 
 		 1244 aa  395  1e-108  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3866  transcription-repair coupling factor  37.58 
 
 		 1149 aa  393  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3547  transcription-repair coupling factor  37.76 
 
 		 1158 aa  394  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0162042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0910  transcription-repair coupling factor  37.44 
 
 		 1179 aa  394  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01110  transcription-repair coupling factor  41.47 
 
 		 1148 aa  390  1e-107  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.358379  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2533  transcription-repair coupling factor  41.47 
 
 		 1164 aa  390  1e-107  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00875995  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1281  transcription-repair coupling factor  37.71 
 
 		 1148 aa  390  1e-107  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0112  transcription-repair coupling factor  36.58 
 
 		 1179 aa  390  1e-107  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1758  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.31 
 
 		 923 aa  391  1e-107  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0298982  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1513  transcription-repair coupling factor  38.62 
 
 		 1174 aa  392  1e-107  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.696907  normal  0.0197286 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01118  hypothetical protein  41.47 
 
 		 1148 aa  390  1e-107  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.451631  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1709  transcription-repair coupling factor  37.36 
 
 		 1137 aa  389  1e-107  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.517079  normal  0.0571023 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2012  transcription-repair coupling factor  41.47 
 
 		 1148 aa  390  1e-107  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00267728 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0700  transcription-repair coupling factor  36.62 
 
 		 1165 aa  392  1e-107  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00154056  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2622  transcription-repair coupling factor  38.78 
 
 		 1172 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.153021  hitchhiker  0.000463296 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1237  transcription-repair coupling factor  41.47 
 
 		 1148 aa  390  1e-107  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.792337  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2487  transcription-repair coupling factor  41.47 
 
 		 1164 aa  390  1e-107  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0203456  hitchhiker  0.00300257 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5514  transcription-repair coupling factor  37.57 
 
 		 1126 aa  392  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1161  transcription-repair coupling factor  42.44 
 
 		 1143 aa  390  1e-107  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1236  transcription-repair coupling factor  41.47 
 
 		 1148 aa  390  1e-107  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00316475  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0499  transcription-repair coupling factor  39.85 
 
 		 1177 aa  391  1e-107  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.245405  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2209  transcription-repair coupling factor  41.47 
 
 		 1148 aa  390  1e-107  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.872306  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1494  transcription-repair coupling factor  41.47 
 
 		 1148 aa  390  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.44461  normal  0.168665 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1330  transcription-repair coupling factor  41.28 
 
 		 1148 aa  388  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00266348 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2153  transcription-repair coupling factor  41.28 
 
 		 1148 aa  388  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.164525  hitchhiker  0.0000432293 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2850  transcription-repair coupling factor  37.82 
 
 		 1171 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.334437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2610  transcription-repair coupling factor  38.3 
 
 		 1172 aa  388  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.776583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1998  transcription-repair coupling factor  40.87 
 
 		 1176 aa  389  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0120843 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3479  transcription-repair coupling factor  37.05 
 
 		 1189 aa  387  1e-106  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.706369  normal  0.219385 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1476  transcription-repair coupling factor  37.5 
 
 		 1155 aa  388  1e-106  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0179996  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>