More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_14371 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_13430  transcription-repair coupling factor Mfd  36.92 
 
 		 1211 aa  644    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0858576  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2072  transcription-repair coupling factor  39.28 
 
 		 1123 aa  708    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1281  transcription-repair coupling factor  37.17 
 
 		 1148 aa  652    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0182  transcription-repair coupling factor  37.34 
 
 		 1183 aa  737    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10301  transcriptional-repair coupling factor  47.96 
 
 		 1170 aa  1197    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0141  transcription-repair coupling factor  34.46 
 
 		 1169 aa  680    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09151  transcriptional-repair coupling factor  47.97 
 
 		 1175 aa  1209    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0051  transcription-repair coupling factor  37.62 
 
 		 1176 aa  724    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4624  transcription-repair coupling factor  35.03 
 
 		 1211 aa  637    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21200  transcription-repair coupling factor  35.84 
 
 		 1170 aa  735    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.010694  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1013  transcription-repair coupling factor  35.4 
 
 		 1205 aa  649    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0526678 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4404  transcription-repair coupling factor  57.07 
 
 		 1166 aa  1362    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.353859  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0052  transcription-repair coupling factor  37.45 
 
 		 1176 aa  723    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0048  transcription-repair coupling factor  37.45 
 
 		 1178 aa  723    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0048  transcription-repair coupling factor  37.36 
 
 		 1176 aa  721    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10511  transcriptional-repair coupling factor  60.62 
 
 		 1167 aa  1519    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605187 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0884  transcription-repair coupling factor  37.11 
 
 		 1216 aa  647    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32300  transcription-repair coupling factor Mfd  36.28 
 
 		 1199 aa  647    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.742659  normal  0.328282 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0424  transcription-repair coupling factor  36.61 
 
 		 1210 aa  637    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0369  transcriptional-repair coupling factor  60.45 
 
 		 1167 aa  1521    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14371  transcriptional-repair coupling factor  100 
 
 		 1193 aa  2442    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0638  transcription-repair coupling factor  36.22 
 
 		 1141 aa  673    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.138681  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0538  transcription-repair coupling factor  35.64 
 
 		 1168 aa  674    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2767  transcription-repair coupling factor  56.79 
 
 		 1188 aa  1380    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1246  transcription-repair coupling factor  37.1 
 
 		 1157 aa  658    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.545868  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3135  transcription-repair coupling factor  37.4 
 
 		 1164 aa  672    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.223116  normal  0.109749 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0064  transcription-repair coupling factor  36.42 
 
 		 1201 aa  636    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.862894  normal  0.0454923 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1176  transcription-repair coupling factor  77.58 
 
 		 1192 aa  1920    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.141232  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0048  transcription-repair coupling factor  37.77 
 
 		 1176 aa  729    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1300  transcription-repair coupling factor  75.92 
 
 		 1192 aa  1862    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0593  transcription-repair coupling factor  37.65 
 
 		 1165 aa  747    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4373  transcription-repair coupling factor  56.03 
 
 		 1158 aa  1358    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.456695  hitchhiker  0.00000184147 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0188  transcription-repair coupling factor  36.11 
 
 		 1182 aa  649    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0052  transcription-repair coupling factor  37.45 
 
 		 1176 aa  723    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0961  transcriptional-repair coupling factor  47.42 
 
 		 1174 aa  1189    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.489301  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1326  transcription-repair coupling factor  60.02 
 
 		 1153 aa  1422    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0062  transcription-repair coupling factor  37.62 
 
 		 1176 aa  724    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0081  transcription-repair coupling factor  37.27 
 
 		 1183 aa  727    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000883466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09271  transcriptional-repair coupling factor  57.56 
 
 		 1169 aa  1459    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.254503  hitchhiker  0.0000230767 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3926  transcription-repair coupling factor  36.82 
 
 		 1208 aa  670    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.892466 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1478  transcription-repair coupling factor  37.73 
 
 		 1246 aa  699    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.313815 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0140  transcription-repair coupling factor  36.21 
 
 		 1159 aa  653    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00133746  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3741  transcription-repair coupling factor  38.91 
 
 		 1182 aa  692    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.34254 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0700  transcription-repair coupling factor  35.06 
 
 		 1165 aa  657    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00154056  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1796  transcription-repair coupling protein Mfd  34 
 
 		 1153 aa  644    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.46752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0525  transcription-repair coupling factor  35.64 
 
 		 1168 aa  674    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1064  transcription-repair coupling factor (superfamily II helicase)  36.29 
 
 		 1154 aa  674    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.566316  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1299  transcription-repair coupling factor  37.1 
 
 		 1157 aa  657    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0050  transcription-repair coupling factor  36.71 
 
 		 1177 aa  721    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0214  transcription-repair coupling factor  36.89 
 
 		 1197 aa  702    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0330142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0829  transcription-repair coupling factor  37.97 
 
 		 1218 aa  661    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.46683  normal  0.375475 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10301  transcriptional-repair coupling factor  47.81 
 
 		 1169 aa  1182    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2632  transcription-repair coupling factor  36.19 
 
 		 1178 aa  716    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4549  transcription-repair coupling factor  36.2 
 
 		 1182 aa  677    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.191603 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1092  transcription-repair coupling factor  37 
 
 		 1148 aa  670    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0898  transcription-repair coupling factor  36.46 
 
 		 1214 aa  649    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.165774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1202  transcription-repair coupling factor  33.09 
 
 		 1121 aa  636    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.851406  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0048  transcription-repair coupling factor  36.96 
 
 		 1176 aa  718    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4245  transcription-repair coupling factor  35.12 
 
 		 1211 aa  640    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0262  transcription-repair coupling factor  34.05 
 
 		 1179 aa  655    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0059  transcription-repair coupling factor  37.55 
 
 		 1176 aa  724    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2807  transcription-repair coupling factor  36.17 
 
 		 1162 aa  708    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2493  transcription-repair coupling factor  36.2 
 
 		 1162 aa  708    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0111  transcription-repair coupling factor  39.03 
 
 		 1169 aa  724    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00148726  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1671  transcription-repair coupling factor  52.96 
 
 		 1180 aa  1294    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0058  transcription-repair coupling factor  37.5 
 
 		 1176 aa  720    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4312  transcription-repair coupling factor  56.19 
 
 		 1158 aa  1363    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1827  transcription-repair coupling factor  59.31 
 
 		 1169 aa  1448    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1355  transcription-repair coupling factor  37.15 
 
 		 1150 aa  657    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0112  transcription-repair coupling factor  36.72 
 
 		 1179 aa  663    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0048  transcription-repair coupling factor  36.95 
 
 		 1177 aa  707    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0067  transcription-repair coupling factor  36.19 
 
 		 1196 aa  712    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0072  transcription-repair coupling factor  37.84 
 
 		 1176 aa  691    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0902915  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0271  transcription-repair coupling factor  35.63 
 
 		 1165 aa  663    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0399  transcription-repair coupling factor  35.35 
 
 		 1179 aa  638    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0007  transcription-repair coupling factor  36.46 
 
 		 1168 aa  673    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1245  transcription-repair coupling factor  35.69 
 
 		 1222 aa  642    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.877482  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2656  transcription-repair coupling factor  36.36 
 
 		 1207 aa  656    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0357057  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3479  transcription-repair coupling factor  34.84 
 
 		 1189 aa  650    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.706369  normal  0.219385 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1913  transcription-repair coupling factor  38.05 
 
 		 1192 aa  636    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0803  transcription-repair coupling factor  38.19 
 
 		 1188 aa  670    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0214899 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0924  transcription-repair coupling factor  34.79 
 
 		 1224 aa  644    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.410165  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3090  transcription-repair coupling factor  36.25 
 
 		 1174 aa  718    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.192538  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4331  transcription-repair coupling factor  35.12 
 
 		 1211 aa  640    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.376638 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4777  transcription-repair coupling factor  35.42 
 
 		 1212 aa  639    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.549284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5258  transcription-repair coupling factor  37.41 
 
 		 1176 aa  720    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3738  transcription-repair coupling factor  56.14 
 
 		 1168 aa  1361    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3660  transcription-repair coupling factor  37.21 
 
 		 1265 aa  679    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.593932 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07780  transcription-repair coupling factor Mfd  35.6 
 
 		 1212 aa  632  1e-180  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.784778  normal  0.111573 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1016  transcription-repair coupling factor  35.03 
 
 		 1153 aa  634  1e-180  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0983  transcription-repair coupling factor  34.94 
 
 		 1153 aa  633  1e-180  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0620  transcription-repair coupling factor  33.51 
 
 		 1244 aa  635  1e-180  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0131  transcription-repair coupling factor  44.13 
 
 		 1197 aa  635  1e-180  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.10317  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1298  transcription-repair coupling factor  35.5 
 
 		 1220 aa  634  1e-180  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000122104 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1287  transcription-repair coupling factor  34.07 
 
 		 1155 aa  629  1e-179  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0502901  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1067  transcription-repair coupling factor  35.84 
 
 		 1193 aa  632  1e-179  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0639  transcription-repair coupling factor  35.86 
 
 		 1156 aa  630  1e-179  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1630  transcription-repair coupling factor  35.48 
 
 		 1160 aa  630  1e-179  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00676636  normal  0.517783 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02560  transcription-repair coupling factor  34.56 
 
 		 1126 aa  632  1e-179  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1560  transcription-repair coupling factor  35.66 
 
 		 1195 aa  626  1e-178  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.93701  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>