More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_09151 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009674  Bcer98_0048  transcription-repair coupling factor  37.04 
 
 		 1176 aa  707    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0124  transcription-repair coupling factor  32.76 
 
 		 1147 aa  636    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00760781  normal  0.18165 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1092  transcription-repair coupling factor  33.22 
 
 		 1148 aa  640    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0538  transcription-repair coupling factor  34.72 
 
 		 1168 aa  644    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0141  transcription-repair coupling factor  35.2 
 
 		 1169 aa  676    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10301  transcriptional-repair coupling factor  78.55 
 
 		 1170 aa  1867    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1827  transcription-repair coupling factor  45.89 
 
 		 1169 aa  1157    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0051  transcription-repair coupling factor  36.15 
 
 		 1176 aa  691    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0140  transcription-repair coupling factor  32.72 
 
 		 1159 aa  652    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00133746  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0052  transcription-repair coupling factor  36.15 
 
 		 1176 aa  691    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0048  transcription-repair coupling factor  35.73 
 
 		 1178 aa  693    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0048  transcription-repair coupling factor  36.24 
 
 		 1176 aa  694    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3090  transcription-repair coupling factor  36.55 
 
 		 1174 aa  722    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.192538  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21200  transcription-repair coupling factor  35.03 
 
 		 1170 aa  688    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.010694  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0369  transcriptional-repair coupling factor  54.7 
 
 		 1167 aa  1274    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0048  transcription-repair coupling factor  36.16 
 
 		 1177 aa  686    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0262  transcription-repair coupling factor  34.31 
 
 		 1179 aa  674    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2767  transcription-repair coupling factor  44.17 
 
 		 1188 aa  1111    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0067  transcription-repair coupling factor  34.39 
 
 		 1196 aa  668    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0593  transcription-repair coupling factor  37.8 
 
 		 1165 aa  703    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10511  transcriptional-repair coupling factor  54.62 
 
 		 1167 aa  1274    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605187 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1176  transcription-repair coupling factor  46.82 
 
 		 1192 aa  1224    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.141232  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09151  transcriptional-repair coupling factor  100 
 
 		 1175 aa  2362    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1300  transcription-repair coupling factor  47.63 
 
 		 1192 aa  1215    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4404  transcription-repair coupling factor  43.98 
 
 		 1166 aa  1105    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.353859  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0052  transcription-repair coupling factor  36.15 
 
 		 1176 aa  691    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0961  transcriptional-repair coupling factor  79.49 
 
 		 1174 aa  1872    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.489301  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1326  transcription-repair coupling factor  45.69 
 
 		 1153 aa  1143    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0081  transcription-repair coupling factor  32.8 
 
 		 1183 aa  650    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000883466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0182  transcription-repair coupling factor  33.39 
 
 		 1183 aa  687    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10301  transcriptional-repair coupling factor  79.28 
 
 		 1169 aa  1885    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2656  transcription-repair coupling factor  33.07 
 
 		 1207 aa  651    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0357057  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0214  transcription-repair coupling factor  35.03 
 
 		 1197 aa  682    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0330142  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0638  transcription-repair coupling factor  35.2 
 
 		 1141 aa  658    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.138681  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0048  transcription-repair coupling factor  36.16 
 
 		 1176 aa  685    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14371  transcriptional-repair coupling factor  47.97 
 
 		 1193 aa  1186    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4373  transcription-repair coupling factor  47.61 
 
 		 1158 aa  1135    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.456695  hitchhiker  0.00000184147 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0062  transcription-repair coupling factor  36.15 
 
 		 1176 aa  691    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0050  transcription-repair coupling factor  36.65 
 
 		 1177 aa  684    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09271  transcriptional-repair coupling factor  50.68 
 
 		 1169 aa  1206    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.254503  hitchhiker  0.0000230767 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2807  transcription-repair coupling factor  36.05 
 
 		 1162 aa  678    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2493  transcription-repair coupling factor  36.48 
 
 		 1162 aa  682    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0072  transcription-repair coupling factor  33.07 
 
 		 1176 aa  667    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0902915  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1671  transcription-repair coupling factor  43.75 
 
 		 1180 aa  1060    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2632  transcription-repair coupling factor  36.78 
 
 		 1178 aa  729    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3741  transcription-repair coupling factor  32.6 
 
 		 1182 aa  648    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.34254 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0525  transcription-repair coupling factor  34.72 
 
 		 1168 aa  644    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4312  transcription-repair coupling factor  47.78 
 
 		 1158 aa  1140    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1064  transcription-repair coupling factor (superfamily II helicase)  32.78 
 
 		 1154 aa  646    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.566316  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0271  transcription-repair coupling factor  37.51 
 
 		 1165 aa  680    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0112  transcription-repair coupling factor  36.54 
 
 		 1179 aa  664    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0058  transcription-repair coupling factor  36.7 
 
 		 1176 aa  691    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3738  transcription-repair coupling factor  46.71 
 
 		 1168 aa  1126    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1355  transcription-repair coupling factor  34.28 
 
 		 1150 aa  658    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5258  transcription-repair coupling factor  36.48 
 
 		 1176 aa  689    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0059  transcription-repair coupling factor  36.15 
 
 		 1176 aa  691    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1023  transcription-repair coupling factor  31.68 
 
 		 1168 aa  633  1e-180  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1281  transcription-repair coupling factor  32.93 
 
 		 1148 aa  631  1e-179  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4549  transcription-repair coupling factor  32.13 
 
 		 1182 aa  632  1e-179  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.191603 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0214  transcription-repair coupling factor  31.65 
 
 		 1157 aa  626  1e-178  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0683043  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08480  transcription-repair coupling factor Mfd  32.83 
 
 		 1155 aa  629  1e-178  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.13697  normal  0.343175 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0967  transcription-repair coupling factor  35.41 
 
 		 1170 aa  629  1e-178  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.8826  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0011  transcription-repair coupling factor  34.27 
 
 		 1162 aa  628  1e-178  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2072  transcription-repair coupling factor  45.09 
 
 		 1123 aa  625  1e-177  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5241  transcription-repair coupling factor  30.23 
 
 		 1112 aa  624  1e-177  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0131  transcription-repair coupling factor  44.19 
 
 		 1197 aa  623  1e-177  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.10317  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0007  transcription-repair coupling factor  34.73 
 
 		 1168 aa  625  1e-177  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0111  transcription-repair coupling factor  46.21 
 
 		 1169 aa  618  1e-175  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00148726  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1016  transcription-repair coupling factor  34.33 
 
 		 1153 aa  613  9.999999999999999e-175  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1478  transcription-repair coupling factor  42.63 
 
 		 1246 aa  610  1e-173  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.313815 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0983  transcription-repair coupling factor  34.39 
 
 		 1153 aa  610  1e-173  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4876  transcription-repair coupling factor  30.47 
 
 		 1257 aa  612  1e-173  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.968673  normal  0.26689 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3135  transcription-repair coupling factor  30.94 
 
 		 1164 aa  609  1e-173  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.223116  normal  0.109749 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1705  transcription-repair coupling factor  30.26 
 
 		 1174 aa  610  1e-173  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1796  transcription-repair coupling protein Mfd  33.94 
 
 		 1153 aa  603  1.0000000000000001e-171  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.46752  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3728  transcription-repair coupling factor  31.12 
 
 		 1103 aa  605  1.0000000000000001e-171  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1642  transcription-repair coupling factor  32.28 
 
 		 1158 aa  600  1e-170  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1299  transcription-repair coupling factor  32.14 
 
 		 1157 aa  597  1e-169  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1567  transcription-repair coupling factor  32.24 
 
 		 1150 aa  597  1e-169  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1246  transcription-repair coupling factor  32.23 
 
 		 1157 aa  598  1e-169  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.545868  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0409  transcription-repair coupling factor  32.89 
 
 		 1126 aa  594  1e-168  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0091  transcription-repair coupling factor  31.46 
 
 		 1161 aa  595  1e-168  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3660  transcription-repair coupling factor  41 
 
 		 1265 aa  593  1e-168  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.593932 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0657  transcription-repair coupling factor  42.48 
 
 		 1202 aa  592  1e-167  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3547  transcription-repair coupling factor  43.94 
 
 		 1158 aa  588  1e-166  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0162042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1630  transcription-repair coupling factor  32.39 
 
 		 1160 aa  587  1e-166  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00676636  normal  0.517783 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2399  transcription-repair coupling factor  31.73 
 
 		 1178 aa  588  1e-166  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00178528  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0399  transcription-repair coupling factor  43.01 
 
 		 1179 aa  588  1e-166  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1168  transcription-repair coupling factor  32.9 
 
 		 1159 aa  585  1.0000000000000001e-165  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.507558  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0639  transcription-repair coupling factor  32.26 
 
 		 1156 aa  584  1.0000000000000001e-165  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1543  transcription-repair coupling factor  32.6 
 
 		 1157 aa  585  1.0000000000000001e-165  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00144396  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0803  transcription-repair coupling factor  42.02 
 
 		 1188 aa  583  1.0000000000000001e-165  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0214899 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3479  transcription-repair coupling factor  43.26 
 
 		 1189 aa  585  1.0000000000000001e-165  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.706369  normal  0.219385 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1651  transcription-repair coupling factor  31.46 
 
 		 1198 aa  583  1.0000000000000001e-165  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0949353  normal  0.53283 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0499  transcription-repair coupling factor  42.92 
 
 		 1177 aa  585  1.0000000000000001e-165  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.245405  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1933  transcription-repair coupling factor  32.18 
 
 		 1173 aa  583  1.0000000000000001e-165  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.436616  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0008  transcription-repair coupling factor  35.62 
 
 		 1165 aa  581  1e-164  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0424  transcription-repair coupling factor  40.95 
 
 		 1210 aa  582  1e-164  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0188  transcription-repair coupling factor  41.43 
 
 		 1182 aa  582  1e-164  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1998  transcription-repair coupling factor  31.2 
 
 		 1176 aa  581  1e-164  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0120843 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>