More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_10301 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0262  transcription-repair coupling factor  33.13 
 
 		 1179 aa  679    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0111  transcription-repair coupling factor  35.53 
 
 		 1169 aa  695    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00148726  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1281  transcription-repair coupling factor  33.91 
 
 		 1148 aa  639    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3738  transcription-repair coupling factor  46.62 
 
 		 1168 aa  1134    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0048  transcription-repair coupling factor  36.27 
 
 		 1176 aa  689    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14371  transcriptional-repair coupling factor  47.81 
 
 		 1193 aa  1157    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0141  transcription-repair coupling factor  34.81 
 
 		 1169 aa  695    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0051  transcription-repair coupling factor  35.9 
 
 		 1176 aa  691    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0072  transcription-repair coupling factor  32.23 
 
 		 1176 aa  664    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0902915  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0052  transcription-repair coupling factor  36.08 
 
 		 1176 aa  692    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0048  transcription-repair coupling factor  36.08 
 
 		 1178 aa  692    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0048  transcription-repair coupling factor  35.99 
 
 		 1176 aa  692    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2632  transcription-repair coupling factor  36.62 
 
 		 1178 aa  728    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1827  transcription-repair coupling factor  45.15 
 
 		 1169 aa  1156    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0369  transcriptional-repair coupling factor  53.55 
 
 		 1167 aa  1269    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0112  transcription-repair coupling factor  36.62 
 
 		 1179 aa  669    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1092  transcription-repair coupling factor  33.68 
 
 		 1148 aa  645    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0538  transcription-repair coupling factor  33.96 
 
 		 1168 aa  661    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2767  transcription-repair coupling factor  44.38 
 
 		 1188 aa  1136    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10511  transcriptional-repair coupling factor  53.46 
 
 		 1167 aa  1268    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605187 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4373  transcription-repair coupling factor  46.32 
 
 		 1158 aa  1119    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.456695  hitchhiker  0.00000184147 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4404  transcription-repair coupling factor  45.16 
 
 		 1166 aa  1133    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.353859  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1176  transcription-repair coupling factor  46.97 
 
 		 1192 aa  1212    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.141232  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1300  transcription-repair coupling factor  46.77 
 
 		 1192 aa  1199    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10301  transcriptional-repair coupling factor  100 
 
 		 1169 aa  2353    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0052  transcription-repair coupling factor  36.08 
 
 		 1176 aa  692    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0961  transcriptional-repair coupling factor  91.79 
 
 		 1174 aa  2117    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.489301  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1326  transcription-repair coupling factor  44.4 
 
 		 1153 aa  1146    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0081  transcription-repair coupling factor  32.26 
 
 		 1183 aa  660    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000883466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09151  transcriptional-repair coupling factor  79.28 
 
 		 1175 aa  1889    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1478  transcription-repair coupling factor  32.5 
 
 		 1246 aa  680    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.313815 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0197  transcription-repair coupling factor  32.55 
 
 		 1157 aa  642    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5656599999999998e-21 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0525  transcription-repair coupling factor  33.96 
 
 		 1168 aa  661    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1705  transcription-repair coupling factor  31.54 
 
 		 1174 aa  640    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0638  transcription-repair coupling factor  35.19 
 
 		 1141 aa  663    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.138681  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0059  transcription-repair coupling factor  36.08 
 
 		 1176 aa  693    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0048  transcription-repair coupling factor  35.99 
 
 		 1177 aa  699    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0657  transcription-repair coupling factor  33.67 
 
 		 1202 aa  646    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0048  transcription-repair coupling factor  36.3 
 
 		 1176 aa  701    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0188  transcription-repair coupling factor  32.42 
 
 		 1182 aa  642    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5258  transcription-repair coupling factor  36.45 
 
 		 1176 aa  692    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1355  transcription-repair coupling factor  34.28 
 
 		 1150 aa  654    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0058  transcription-repair coupling factor  36.36 
 
 		 1176 aa  691    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2807  transcription-repair coupling factor  36.11 
 
 		 1162 aa  699    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2493  transcription-repair coupling factor  36.55 
 
 		 1162 aa  704    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0214  transcription-repair coupling factor  32.73 
 
 		 1157 aa  649    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0683043  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1671  transcription-repair coupling factor  43.33 
 
 		 1180 aa  1054    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0067  transcription-repair coupling factor  34.99 
 
 		 1196 aa  680    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4312  transcription-repair coupling factor  46.41 
 
 		 1158 aa  1122    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21200  transcription-repair coupling factor  34.45 
 
 		 1170 aa  681    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.010694  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0062  transcription-repair coupling factor  35.9 
 
 		 1176 aa  691    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0131  transcription-repair coupling factor  35.82 
 
 		 1197 aa  703    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.10317  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0700  transcription-repair coupling factor  32.48 
 
 		 1165 aa  640    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00154056  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0011  transcription-repair coupling factor  36.64 
 
 		 1162 aa  646    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0593  transcription-repair coupling factor  37.72 
 
 		 1165 aa  706    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0271  transcription-repair coupling factor  35.8 
 
 		 1165 aa  698    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0399  transcription-repair coupling factor  32.93 
 
 		 1179 aa  660    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0007  transcription-repair coupling factor  35.28 
 
 		 1168 aa  640    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0050  transcription-repair coupling factor  36.49 
 
 		 1177 aa  694    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3741  transcription-repair coupling factor  32.02 
 
 		 1182 aa  641    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.34254 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0182  transcription-repair coupling factor  32.87 
 
 		 1183 aa  687    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1064  transcription-repair coupling factor (superfamily II helicase)  33.54 
 
 		 1154 aa  647    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.566316  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3090  transcription-repair coupling factor  37.39 
 
 		 1174 aa  738    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.192538  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10301  transcriptional-repair coupling factor  94.53 
 
 		 1170 aa  2198    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09271  transcriptional-repair coupling factor  50.04 
 
 		 1169 aa  1214    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.254503  hitchhiker  0.0000230767 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0424  transcription-repair coupling factor  31.41 
 
 		 1210 aa  634  1e-180  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0967  transcription-repair coupling factor  36.23 
 
 		 1170 aa  630  1e-179  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.8826  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2072  transcription-repair coupling factor  45.18 
 
 		 1123 aa  630  1e-179  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1298  transcription-repair coupling factor  33.52 
 
 		 1220 aa  627  1e-178  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000122104 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1016  transcription-repair coupling factor  35.32 
 
 		 1153 aa  623  1e-177  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0983  transcription-repair coupling factor  35.41 
 
 		 1153 aa  625  1e-177  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1023  transcription-repair coupling factor  30.78 
 
 		 1168 aa  623  1e-177  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1299  transcription-repair coupling factor  33.27 
 
 		 1157 aa  619  1e-176  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1246  transcription-repair coupling factor  33.27 
 
 		 1157 aa  620  1e-176  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.545868  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5241  transcription-repair coupling factor  29.49 
 
 		 1112 aa  617  1e-175  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0124  transcription-repair coupling factor  32.52 
 
 		 1147 aa  617  1e-175  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00760781  normal  0.18165 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0924  transcription-repair coupling factor  31.28 
 
 		 1224 aa  619  1e-175  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.410165  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0022  transcription-repair coupling factor  33.98 
 
 		 1113 aa  614  9.999999999999999e-175  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4245  transcription-repair coupling factor  32.16 
 
 		 1211 aa  612  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4624  transcription-repair coupling factor  31.76 
 
 		 1211 aa  614  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1913  transcription-repair coupling factor  32.85 
 
 		 1192 aa  615  9.999999999999999e-175  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4331  transcription-repair coupling factor  32.16 
 
 		 1211 aa  612  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.376638 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1287  transcription-repair coupling factor  33.64 
 
 		 1155 aa  610  1e-173  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0502901  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0008  transcription-repair coupling factor  36.11 
 
 		 1165 aa  610  1e-173  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0214  transcription-repair coupling factor  44.13 
 
 		 1197 aa  612  1e-173  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0330142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1796  transcription-repair coupling protein Mfd  33.33 
 
 		 1153 aa  611  1e-173  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.46752  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05560  transcription-repair coupling factor Mfd  32.99 
 
 		 1218 aa  612  1e-173  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0777  transcription-repair coupling factor (superfamily II helicase)  33.67 
 
 		 1194 aa  607  9.999999999999999e-173  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1725  transcription-repair coupling factor  32.25 
 
 		 1160 aa  606  9.999999999999999e-173  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1642  transcription-repair coupling factor  32.44 
 
 		 1158 aa  603  1.0000000000000001e-171  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3547  transcription-repair coupling factor  44.65 
 
 		 1158 aa  603  1.0000000000000001e-171  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0162042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1168  transcription-repair coupling factor  33.33 
 
 		 1159 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.507558  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3660  transcription-repair coupling factor  38.9 
 
 		 1265 aa  605  1.0000000000000001e-171  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.593932 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3135  transcription-repair coupling factor  30.9 
 
 		 1164 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.223116  normal  0.109749 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07020  transcription-repair coupling factor Mfd  30.22 
 
 		 1244 aa  600  1e-170  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0711584  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0898  transcription-repair coupling factor  31.34 
 
 		 1214 aa  601  1e-170  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.165774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0639  transcription-repair coupling factor  32.73 
 
 		 1156 aa  600  1e-170  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1202  transcription-repair coupling factor  33 
 
 		 1121 aa  600  1e-170  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.851406  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14570  transcription-repair coupling factor  31.8 
 
 		 1149 aa  599  1e-170  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1013  transcription-repair coupling factor  29.77 
 
 		 1205 aa  600  1e-170  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0526678 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>