More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCAH820_0059 on replicon NC_011773
Organism: Bacillus cereus AH820



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01110  transcription-repair coupling factor  35.46 
 
 
1148 aa  685    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.358379  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2533  transcription-repair coupling factor  35.46 
 
 
1164 aa  684    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00875995  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1281  transcription-repair coupling factor  41.04 
 
 
1148 aa  796    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0017  transcription-repair coupling factor  38.96 
 
 
1157 aa  748    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0270668  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10301  transcriptional-repair coupling factor  36.17 
 
 
1170 aa  680    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1260  transcription-repair coupling factor  35.68 
 
 
1189 aa  675    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.148669  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1287  transcription-repair coupling factor  39.08 
 
 
1155 aa  752    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0502901  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0141  transcription-repair coupling factor  50.82 
 
 
1169 aa  1154    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1864  transcription-repair coupling factor  36.13 
 
 
1147 aa  696    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0555269  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1642  transcription-repair coupling factor protein  35.36 
 
 
1157 aa  676    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.250538 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0051  transcription-repair coupling factor  99.83 
 
 
1176 aa  2397    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2406  transcription-repair coupling factor  37.99 
 
 
1162 aa  669    Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00482386  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0008  transcription-repair coupling factor  47.02 
 
 
1165 aa  998    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4404  transcription-repair coupling factor  37.75 
 
 
1166 aa  759    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.353859  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2255  transcription-repair coupling factor  37.86 
 
 
1164 aa  695    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4359  transcription-repair coupling factor  35.4 
 
 
1174 aa  668    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.281858  normal  0.0471962 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0052  transcription-repair coupling factor  99.91 
 
 
1176 aa  2398    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0048  transcription-repair coupling factor  99.91 
 
 
1178 aa  2398    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0048  transcription-repair coupling factor  99.74 
 
 
1176 aa  2394    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1491  transcription-repair coupling factor  35.68 
 
 
1157 aa  675    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3318  transcription-repair coupling factor  35.68 
 
 
1189 aa  675    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.101121  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1569  transcription-repair coupling factor  35.9 
 
 
1184 aa  652    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.878317  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1257  transcription-repair coupling factor  37.21 
 
 
1147 aa  695    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.230651  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1965  transcription-repair coupling factor  35.62 
 
 
1147 aa  686    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.550833  normal  0.680854 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0424  transcription-repair coupling factor  38.21 
 
 
1210 aa  736    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0369  transcriptional-repair coupling factor  37.33 
 
 
1167 aa  712    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1360  transcription-repair coupling factor  36.01 
 
 
1150 aa  673    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1656  transcription-repair coupling factor  35.9 
 
 
1146 aa  676    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.221559  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1513  transcription-repair coupling factor  36.33 
 
 
1174 aa  652    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.696907  normal  0.0197286 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2767  transcription-repair coupling factor  38.27 
 
 
1188 aa  748    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2513  transcription-repair coupling factor  35.68 
 
 
1189 aa  674    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1642  transcription-repair coupling factor  36.27 
 
 
1158 aa  679    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1988  transcription-repair coupling factor  35.68 
 
 
1157 aa  675    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.232338  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10511  transcriptional-repair coupling factor  37.42 
 
 
1167 aa  712    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00605187 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0091  transcription-repair coupling factor  38.66 
 
 
1161 aa  770    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5255  transcription-repair coupling factor  36.67 
 
 
1156 aa  688    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0305001  normal  0.983896 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2632  transcription-repair coupling factor  45.49 
 
 
1178 aa  1006    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1176  transcription-repair coupling factor  37.38 
 
 
1192 aa  729    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.141232  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2402  transcription-repair coupling factor  35.68 
 
 
1189 aa  673    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1300  transcription-repair coupling factor  36.47 
 
 
1192 aa  721    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3547  transcription-repair coupling factor  39.63 
 
 
1158 aa  780    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0162042  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2039  transcription-repair coupling factor  37.82 
 
 
1152 aa  657    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.583772  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0052  transcription-repair coupling factor  99.91 
 
 
1176 aa  2398    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0961  transcriptional-repair coupling factor  35.62 
 
 
1174 aa  676    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.489301  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1326  transcription-repair coupling factor  36.84 
 
 
1153 aa  726    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0081  transcription-repair coupling factor  44.84 
 
 
1183 aa  996    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000883466  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2550  transcription-repair coupling factor  35.82 
 
 
1161 aa  659    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.277957  normal  0.0823791 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4332  transcription-repair coupling factor  36.63 
 
 
1241 aa  700    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0186143  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3926  transcription-repair coupling factor  38.32 
 
 
1208 aa  727    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.892466 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2850  transcription-repair coupling factor  35.61 
 
 
1171 aa  666    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.334437  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09151  transcriptional-repair coupling factor  36.32 
 
 
1175 aa  684    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1331  transcription-repair coupling factor  35.98 
 
 
1175 aa  659    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.54754  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1796  transcription-repair coupling protein Mfd  37.02 
 
 
1153 aa  699    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.46752  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2610  transcription-repair coupling factor  33.84 
 
 
1172 aa  639    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.776583  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1748  transcription-repair coupling factor  36.06 
 
 
1134 aa  719    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.921754  normal  0.10168 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2313  transcription-repair coupling factor  37 
 
 
1160 aa  690    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.141111  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1674  transcription-repair coupling factor  38.03 
 
 
1179 aa  695    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000415877  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2622  transcription-repair coupling factor  35.15 
 
 
1172 aa  665    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.153021  hitchhiker  0.000463296 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1567  transcription-repair coupling factor  36.86 
 
 
1150 aa  691    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2053  transcription-repair coupling factor  35.98 
 
 
1173 aa  654    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0242332  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4549  transcription-repair coupling factor  37.28 
 
 
1182 aa  735    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.191603 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10301  transcriptional-repair coupling factor  36.08 
 
 
1169 aa  678    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6135  transcription-repair coupling factor  36.42 
 
 
1156 aa  687    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.352842  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4245  transcription-repair coupling factor  37.12 
 
 
1211 aa  712    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0909  transcription-repair coupling factor  38.42 
 
 
1054 aa  664    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1725  transcription-repair coupling factor  38.52 
 
 
1160 aa  719    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1702  transcription-repair coupling factor  36.95 
 
 
1167 aa  656    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3453  transcription-repair coupling factor  35.7 
 
 
1122 aa  665    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0209077 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2807  transcription-repair coupling factor  48.05 
 
 
1162 aa  999    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2493  transcription-repair coupling factor  48.14 
 
 
1162 aa  1005    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2359  transcription-repair coupling factor  35.68 
 
 
1189 aa  674    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.741078  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1671  transcription-repair coupling factor  39.71 
 
 
1180 aa  677    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1730  transcription-repair coupling factor  38.74 
 
 
1160 aa  697    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00119053  normal  0.38574 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1810  transcription-repair coupling factor  38.72 
 
 
1160 aa  703    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.540051  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1800  transcription-repair coupling factor  37.09 
 
 
1166 aa  681    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2399  transcription-repair coupling factor  37.81 
 
 
1178 aa  706    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00178528  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0073  transcription-repair coupling factor  40.04 
 
 
1073 aa  777    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1485  transcription-repair coupling factor  37.21 
 
 
1172 aa  682    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.432425 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1932  transcription-repair coupling factor  36.76 
 
 
1185 aa  686    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0011  transcription-repair coupling factor  48 
 
 
1162 aa  1067    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0183  transcription-repair coupling factor  46.02 
 
 
1188 aa  1010    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0271  transcription-repair coupling factor  46.43 
 
 
1165 aa  1030    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0399  transcription-repair coupling factor  45.19 
 
 
1179 aa  1013    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0007  transcription-repair coupling factor  49.77 
 
 
1168 aa  1045    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1245  transcription-repair coupling factor  39.1 
 
 
1222 aa  705    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.877482  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1944  transcription-repair coupling factor  36.42 
 
 
1156 aa  687    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3479  transcription-repair coupling factor  36.88 
 
 
1189 aa  748    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.706369  normal  0.219385 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1651  transcription-repair coupling factor  37.79 
 
 
1198 aa  732    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0949353  normal  0.53283 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2289  transcription-repair coupling factor  38.42 
 
 
1160 aa  696    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00423432  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1913  transcription-repair coupling factor  40.24 
 
 
1192 aa  707    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0499  transcription-repair coupling factor  37.84 
 
 
1177 aa  788    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.245405  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14371  transcriptional-repair coupling factor  37.45 
 
 
1193 aa  696    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4624  transcription-repair coupling factor  37.12 
 
 
1211 aa  713    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0924  transcription-repair coupling factor  38.85 
 
 
1224 aa  731    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.410165  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1330  transcription-repair coupling factor  38.04 
 
 
1155 aa  706    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.643209  normal  0.63963 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4331  transcription-repair coupling factor  37.12 
 
 
1211 aa  712    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.376638 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2204  transcription-repair coupling factor  36.9 
 
 
1163 aa  686    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0607404  normal  0.440495 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4777  transcription-repair coupling factor  37.61 
 
 
1212 aa  709    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.549284  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1933  transcription-repair coupling factor  37.75 
 
 
1173 aa  719    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.436616  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1260  transcription-repair coupling factor  37.06 
 
 
1159 aa  652    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.843901  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>