More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1671 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_02560  transcription-repair coupling factor  35.15 
 
 		 1126 aa  642    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0062  transcription-repair coupling factor  39.71 
 
 		 1176 aa  677    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10301  transcriptional-repair coupling factor  43.5 
 
 		 1170 aa  1041    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1281  transcription-repair coupling factor  35.49 
 
 		 1148 aa  653    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1064  transcription-repair coupling factor (superfamily II helicase)  35.2 
 
 		 1154 aa  655    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.566316  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0141  transcription-repair coupling factor  38.82 
 
 		 1169 aa  653    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2632  transcription-repair coupling factor  42.12 
 
 		 1178 aa  659    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0538  transcription-repair coupling factor  38.08 
 
 		 1168 aa  638    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0051  transcription-repair coupling factor  39.71 
 
 		 1176 aa  677    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0048  transcription-repair coupling factor  37.21 
 
 		 1177 aa  686    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0112  transcription-repair coupling factor  37.89 
 
 		 1179 aa  684    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1246  transcription-repair coupling factor  38.49 
 
 		 1157 aa  640    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.545868  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0052  transcription-repair coupling factor  39.71 
 
 		 1176 aa  676    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0048  transcription-repair coupling factor  36.92 
 
 		 1178 aa  678    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0048  transcription-repair coupling factor  39.55 
 
 		 1176 aa  679    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0525  transcription-repair coupling factor  38.08 
 
 		 1168 aa  638    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2754  transcription-repair coupling factor  39.36 
 
 		 1112 aa  657    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.502691  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1092  transcription-repair coupling factor  35.01 
 
 		 1148 aa  653    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0058  transcription-repair coupling factor  36.83 
 
 		 1176 aa  673    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21200  transcription-repair coupling factor  37.45 
 
 		 1170 aa  716    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.010694  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0369  transcriptional-repair coupling factor  50.95 
 
 		 1167 aa  1209    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09271  transcriptional-repair coupling factor  48.27 
 
 		 1169 aa  1162    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.254503  hitchhiker  0.0000230767 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0050  transcription-repair coupling factor  36.88 
 
 		 1177 aa  691    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2767  transcription-repair coupling factor  66.39 
 
 		 1188 aa  1646    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1827  transcription-repair coupling factor  68.08 
 
 		 1169 aa  1694    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0067  transcription-repair coupling factor  38.61 
 
 		 1196 aa  706    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3741  transcription-repair coupling factor  36.39 
 
 		 1182 aa  678    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.34254 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1176  transcription-repair coupling factor  54.19 
 
 		 1192 aa  1313    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.141232  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1300  transcription-repair coupling factor  53.39 
 
 		 1192 aa  1278    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3547  transcription-repair coupling factor  35.75 
 
 		 1158 aa  641    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0162042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0182  transcription-repair coupling factor  38.99 
 
 		 1183 aa  698    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0072  transcription-repair coupling factor  38.43 
 
 		 1176 aa  653    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0902915  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0052  transcription-repair coupling factor  39.71 
 
 		 1176 aa  676    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0961  transcriptional-repair coupling factor  43.54 
 
 		 1174 aa  1043    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.489301  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1326  transcription-repair coupling factor  62.57 
 
 		 1153 aa  1541    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4312  transcription-repair coupling factor  62.87 
 
 		 1158 aa  1541    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0081  transcription-repair coupling factor  37.49 
 
 		 1183 aa  683    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000883466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0884  transcription-repair coupling factor  35.56 
 
 		 1216 aa  636    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0272  hypothetical protein  38.34 
 
 		 1123 aa  639    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.580517 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0111  transcription-repair coupling factor  36.95 
 
 		 1169 aa  688    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00148726  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3090  transcription-repair coupling factor  39.9 
 
 		 1174 aa  687    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.192538  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4404  transcription-repair coupling factor  65.2 
 
 		 1166 aa  1588    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.353859  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1202  transcription-repair coupling factor  36.3 
 
 		 1121 aa  672    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.851406  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0048  transcription-repair coupling factor  37 
 
 		 1176 aa  679    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3738  transcription-repair coupling factor  64.43 
 
 		 1168 aa  1574    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4373  transcription-repair coupling factor  62.77 
 
 		 1158 aa  1542    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.456695  hitchhiker  0.00000184147 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5258  transcription-repair coupling factor  36.83 
 
 		 1176 aa  675    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0140  transcription-repair coupling factor  36.43 
 
 		 1159 aa  652    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00133746  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0059  transcription-repair coupling factor  39.71 
 
 		 1176 aa  677    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0214  transcription-repair coupling factor  35.44 
 
 		 1197 aa  699    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0330142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1355  transcription-repair coupling factor  40.12 
 
 		 1150 aa  674    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2807  transcription-repair coupling factor  35.03 
 
 		 1162 aa  676    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2493  transcription-repair coupling factor  35.12 
 
 		 1162 aa  682    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1671  transcription-repair coupling factor  100 
 
 		 1180 aa  2422    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1478  transcription-repair coupling factor  37.15 
 
 		 1246 aa  709    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.313815 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0593  transcription-repair coupling factor  36.42 
 
 		 1165 aa  695    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0048  transcription-repair coupling factor  37.63 
 
 		 1176 aa  696    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0073  transcription-repair coupling factor  36.52 
 
 		 1073 aa  651    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1299  transcription-repair coupling factor  38.49 
 
 		 1157 aa  641    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10301  transcriptional-repair coupling factor  43.33 
 
 		 1169 aa  1035    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0131  transcription-repair coupling factor  36.36 
 
 		 1197 aa  655    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.10317  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0271  transcription-repair coupling factor  38.33 
 
 		 1165 aa  665    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0399  transcription-repair coupling factor  36.49 
 
 		 1179 aa  654    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10511  transcriptional-repair coupling factor  51.03 
 
 		 1167 aa  1212    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605187 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09151  transcriptional-repair coupling factor  43.75 
 
 		 1175 aa  1041    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0499  transcription-repair coupling factor  38.66 
 
 		 1177 aa  650    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.245405  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14371  transcriptional-repair coupling factor  52.96 
 
 		 1193 aa  1253    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0700  transcription-repair coupling factor  38.72 
 
 		 1165 aa  652    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00154056  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2072  transcription-repair coupling factor  37.96 
 
 		 1123 aa  695    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0262  transcription-repair coupling factor  34.34 
 
 		 1179 aa  635  1e-180  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1894  transcription-repair coupling factor  33.81 
 
 		 1109 aa  633  1e-180  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.377763  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0007  transcription-repair coupling factor  36.48 
 
 		 1168 aa  634  1e-180  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0409  transcription-repair coupling factor  36.97 
 
 		 1126 aa  633  1e-180  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3660  transcription-repair coupling factor  47.44 
 
 		 1265 aa  630  1e-179  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.593932 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0022  transcription-repair coupling factor  37.06 
 
 		 1113 aa  632  1e-179  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3135  transcription-repair coupling factor  37.78 
 
 		 1164 aa  630  1e-179  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.223116  normal  0.109749 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3453  transcription-repair coupling factor  33.8 
 
 		 1122 aa  630  1e-179  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0209077 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0124  transcription-repair coupling factor  34.5 
 
 		 1147 aa  631  1e-179  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00760781  normal  0.18165 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3479  transcription-repair coupling factor  36.17 
 
 		 1189 aa  630  1e-179  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.706369  normal  0.219385 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0829  transcription-repair coupling factor  34.84 
 
 		 1218 aa  626  1e-178  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.46683  normal  0.375475 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0017  transcription-repair coupling factor  38.88 
 
 		 1157 aa  625  1e-177  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0270668  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1023  transcription-repair coupling factor  35.79 
 
 		 1168 aa  625  1e-177  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3695  transcription-repair coupling factor  34.92 
 
 		 1115 aa  625  1e-177  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2478  transcription-repair coupling factor  37.68 
 
 		 1150 aa  622  1e-176  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.349906  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2786  transcription-repair coupling factor  37.63 
 
 		 1150 aa  619  1e-175  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.974454  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0091  transcription-repair coupling factor  35.04 
 
 		 1161 aa  619  1e-175  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0657  transcription-repair coupling factor  37.57 
 
 		 1202 aa  619  1e-175  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0803  transcription-repair coupling factor  34.8 
 
 		 1188 aa  618  1e-175  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0214899 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32300  transcription-repair coupling factor Mfd  35.78 
 
 		 1199 aa  618  1e-175  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.742659  normal  0.328282 
 
 
-
 
NC_002950  PG1774  transcription-repair coupling factor  33.36 
 
 		 1122 aa  613  9.999999999999999e-175  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1647  transcription-repair coupling factor  37.16 
 
 		 1150 aa  614  9.999999999999999e-175  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2656  transcription-repair coupling factor  42.59 
 
 		 1207 aa  616  9.999999999999999e-175  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0357057  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0183  transcription-repair coupling factor  37.14 
 
 		 1188 aa  615  9.999999999999999e-175  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3728  transcription-repair coupling factor  34.29 
 
 		 1103 aa  615  9.999999999999999e-175  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5514  transcription-repair coupling factor  33.36 
 
 		 1126 aa  611  1e-173  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1067  transcription-repair coupling factor  33.61 
 
 		 1193 aa  611  1e-173  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1705  transcription-repair coupling factor  33.71 
 
 		 1174 aa  609  1e-173  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1725  transcription-repair coupling factor  38.73 
 
 		 1160 aa  612  1e-173  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0011  transcription-repair coupling factor  37.49 
 
 		 1162 aa  610  1e-173  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1298  transcription-repair coupling factor  36.97 
 
 		 1220 aa  608  9.999999999999999e-173  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000122104 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>