More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NATL1_10511 on replicon NC_008819
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL1A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_0050  transcription-repair coupling factor  37.77 
 
 		 1177 aa  733    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1281  transcription-repair coupling factor  37.4 
 
 		 1148 aa  657    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0017  transcription-repair coupling factor  35.22 
 
 		 1157 aa  658    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0270668  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10511  transcriptional-repair coupling factor  100 
 
 		 1167 aa  2387    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605187 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0141  transcription-repair coupling factor  35.28 
 
 		 1169 aa  689    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0197  transcription-repair coupling factor  34.32 
 
 		 1157 aa  659    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5656599999999998e-21 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0051  transcription-repair coupling factor  37.42 
 
 		 1176 aa  728    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2754  transcription-repair coupling factor  34.13 
 
 		 1112 aa  647    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.502691  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0182  transcription-repair coupling factor  34.77 
 
 		 1183 aa  707    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3738  transcription-repair coupling factor  52.83 
 
 		 1168 aa  1272    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0048  transcription-repair coupling factor  37.66 
 
 		 1176 aa  727    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0052  transcription-repair coupling factor  37.33 
 
 		 1176 aa  728    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0048  transcription-repair coupling factor  37.51 
 
 		 1178 aa  732    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0048  transcription-repair coupling factor  37.51 
 
 		 1176 aa  731    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14371  transcriptional-repair coupling factor  60.62 
 
 		 1193 aa  1496    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0214  transcription-repair coupling factor  34.5 
 
 		 1157 aa  676    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0683043  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5258  transcription-repair coupling factor  37.87 
 
 		 1176 aa  733    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1355  transcription-repair coupling factor  35.22 
 
 		 1150 aa  660    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0638  transcription-repair coupling factor  36.24 
 
 		 1141 aa  672    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.138681  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0369  transcriptional-repair coupling factor  98.8 
 
 		 1167 aa  2362    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21200  transcription-repair coupling factor  37.11 
 
 		 1170 aa  742    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.010694  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4373  transcription-repair coupling factor  52.81 
 
 		 1158 aa  1258    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.456695  hitchhiker  0.00000184147 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0112  transcription-repair coupling factor  36.59 
 
 		 1179 aa  679    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2767  transcription-repair coupling factor  52.13 
 
 		 1188 aa  1300    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3189  transcription-repair coupling factor  34.09 
 
 		 1218 aa  639    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.905154  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1478  transcription-repair coupling factor  35.83 
 
 		 1246 aa  707    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.313815 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4404  transcription-repair coupling factor  51.74 
 
 		 1166 aa  1273    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.353859  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3135  transcription-repair coupling factor  33.85 
 
 		 1164 aa  647    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.223116  normal  0.109749 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1246  transcription-repair coupling factor  34.46 
 
 		 1157 aa  654    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.545868  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1176  transcription-repair coupling factor  61.53 
 
 		 1192 aa  1561    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.141232  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1092  transcription-repair coupling factor  36.82 
 
 		 1148 aa  661    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1300  transcription-repair coupling factor  61.35 
 
 		 1192 aa  1542    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3547  transcription-repair coupling factor  35.95 
 
 		 1158 aa  687    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0162042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1827  transcription-repair coupling factor  53.4 
 
 		 1169 aa  1349    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0052  transcription-repair coupling factor  37.33 
 
 		 1176 aa  728    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0961  transcriptional-repair coupling factor  54.32 
 
 		 1174 aa  1277    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.489301  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1326  transcription-repair coupling factor  52.69 
 
 		 1153 aa  1321    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0700  transcription-repair coupling factor  34.27 
 
 		 1165 aa  671    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00154056  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0081  transcription-repair coupling factor  35.4 
 
 		 1183 aa  684    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000883466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2632  transcription-repair coupling factor  36.31 
 
 		 1178 aa  727    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1298  transcription-repair coupling factor  35.76 
 
 		 1220 aa  647    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000122104 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3741  transcription-repair coupling factor  34.9 
 
 		 1182 aa  680    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.34254 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0048  transcription-repair coupling factor  38.35 
 
 		 1176 aa  745    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0072  transcription-repair coupling factor  34.46 
 
 		 1176 aa  689    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0902915  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0048  transcription-repair coupling factor  38.12 
 
 		 1177 aa  713    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0525  transcription-repair coupling factor  35.21 
 
 		 1168 aa  666    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2072  transcription-repair coupling factor  38.29 
 
 		 1123 aa  709    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1705  transcription-repair coupling factor  33.42 
 
 		 1174 aa  656    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0059  transcription-repair coupling factor  37.42 
 
 		 1176 aa  729    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1299  transcription-repair coupling factor  34.46 
 
 		 1157 aa  651    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0124  transcription-repair coupling factor  33.45 
 
 		 1147 aa  649    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00760781  normal  0.18165 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0538  transcription-repair coupling factor  35.21 
 
 		 1168 aa  666    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09151  transcriptional-repair coupling factor  54.62 
 
 		 1175 aa  1268    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10301  transcriptional-repair coupling factor  53.46 
 
 		 1169 aa  1266    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4549  transcription-repair coupling factor  34.65 
 
 		 1182 aa  676    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.191603 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2656  transcription-repair coupling factor  34 
 
 		 1207 aa  652    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0357057  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1064  transcription-repair coupling factor (superfamily II helicase)  37.21 
 
 		 1154 aa  669    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.566316  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0593  transcription-repair coupling factor  37.45 
 
 		 1165 aa  703    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0620  transcription-repair coupling factor  35.14 
 
 		 1244 aa  641    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0262  transcription-repair coupling factor  34.32 
 
 		 1179 aa  677    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2807  transcription-repair coupling factor  37.39 
 
 		 1162 aa  730    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2493  transcription-repair coupling factor  37.57 
 
 		 1162 aa  736    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0111  transcription-repair coupling factor  36.04 
 
 		 1169 aa  725    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00148726  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1671  transcription-repair coupling factor  51.03 
 
 		 1180 aa  1229    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0214  transcription-repair coupling factor  36.24 
 
 		 1197 aa  707    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0330142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0062  transcription-repair coupling factor  37.42 
 
 		 1176 aa  728    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1067  transcription-repair coupling factor  34.89 
 
 		 1193 aa  650    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0058  transcription-repair coupling factor  37.69 
 
 		 1176 aa  730    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09271  transcriptional-repair coupling factor  59.78 
 
 		 1169 aa  1425    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.254503  hitchhiker  0.0000230767 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0011  transcription-repair coupling factor  35.75 
 
 		 1162 aa  680    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0271  transcription-repair coupling factor  34.56 
 
 		 1165 aa  699    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0399  transcription-repair coupling factor  34.67 
 
 		 1179 aa  659    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0007  transcription-repair coupling factor  37.26 
 
 		 1168 aa  685    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1245  transcription-repair coupling factor  35.21 
 
 		 1222 aa  644    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.877482  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10301  transcriptional-repair coupling factor  54.2 
 
 		 1170 aa  1275    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4312  transcription-repair coupling factor  52.98 
 
 		 1158 aa  1261    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0067  transcription-repair coupling factor  36.57 
 
 		 1196 aa  719    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1913  transcription-repair coupling factor  34.6 
 
 		 1192 aa  642    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0499  transcription-repair coupling factor  34.47 
 
 		 1177 aa  649    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.245405  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0803  transcription-repair coupling factor  34.21 
 
 		 1188 aa  648    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0214899 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3660  transcription-repair coupling factor  34.72 
 
 		 1265 aa  687    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.593932 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0924  transcription-repair coupling factor  34.23 
 
 		 1224 aa  640    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.410165  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1023  transcription-repair coupling factor  33.39 
 
 		 1168 aa  648    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0967  transcription-repair coupling factor  36.04 
 
 		 1170 aa  655    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.8826  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3090  transcription-repair coupling factor  36.61 
 
 		 1174 aa  721    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.192538  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1287  transcription-repair coupling factor  34.23 
 
 		 1155 aa  633  1e-180  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0502901  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0983  transcription-repair coupling factor  34.91 
 
 		 1153 aa  633  1e-180  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1292  transcription-repair coupling factor  31.67 
 
 		 1161 aa  634  1e-180  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4777  transcription-repair coupling factor  33.87 
 
 		 1212 aa  632  1e-180  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.549284  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1016  transcription-repair coupling factor  34.91 
 
 		 1153 aa  632  1e-179  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0188  transcription-repair coupling factor  33.96 
 
 		 1182 aa  632  1e-179  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0022  transcription-repair coupling factor  34.12 
 
 		 1113 aa  628  1e-178  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0829  transcription-repair coupling factor  33.27 
 
 		 1218 aa  629  1e-178  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.46683  normal  0.375475 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08480  transcription-repair coupling factor Mfd  33.27 
 
 		 1155 aa  626  1e-178  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.13697  normal  0.343175 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5514  transcription-repair coupling factor  32.85 
 
 		 1126 aa  627  1e-178  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1511  transcription-repair coupling factor  35.54 
 
 		 1059 aa  625  1e-177  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32300  transcription-repair coupling factor Mfd  33.75 
 
 		 1199 aa  624  1e-177  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.742659  normal  0.328282 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0657  transcription-repair coupling factor  34.13 
 
 		 1202 aa  625  1e-177  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1933  transcription-repair coupling factor  33.36 
 
 		 1173 aa  620  1e-176  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.436616  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0131  transcription-repair coupling factor  46.13 
 
 		 1197 aa  620  1e-176  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.10317  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>