More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2656 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01110  transcription-repair coupling factor  38.22 
 
 		 1148 aa  702    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.358379  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2533  transcription-repair coupling factor  37.81 
 
 		 1164 aa  703    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00875995  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1281  transcription-repair coupling factor  42.56 
 
 		 1148 aa  889    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0017  transcription-repair coupling factor  41.66 
 
 		 1157 aa  754    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0270668  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0262  transcription-repair coupling factor  35.35 
 
 		 1179 aa  725    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1327  transcription-repair coupling factor  38.75 
 
 		 1156 aa  639    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.241535  hitchhiker  0.000253034 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1287  transcription-repair coupling factor  35.84 
 
 		 1155 aa  664    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0502901  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0141  transcription-repair coupling factor  36.28 
 
 		 1169 aa  733    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2848  transcription-repair coupling factor  36.87 
 
 		 1164 aa  640    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.420758  normal  0.818462 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1092  transcription-repair coupling factor  42.5 
 
 		 1148 aa  902    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0051  transcription-repair coupling factor  38.92 
 
 		 1176 aa  791    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2139  transcription-repair coupling factor  36.68 
 
 		 1207 aa  696    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.84833  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0008  transcription-repair coupling factor  37.38 
 
 		 1165 aa  665    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09151  transcriptional-repair coupling factor  33.27 
 
 		 1175 aa  646    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1709  transcription-repair coupling factor  37.71 
 
 		 1137 aa  665    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.517079  normal  0.0571023 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0525  transcription-repair coupling factor  37.37 
 
 		 1168 aa  736    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0052  transcription-repair coupling factor  38.92 
 
 		 1176 aa  790    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0048  transcription-repair coupling factor  38.7 
 
 		 1178 aa  791    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0048  transcription-repair coupling factor  38.84 
 
 		 1176 aa  791    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0111  transcription-repair coupling factor  40.14 
 
 		 1169 aa  790    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00148726  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1016  transcription-repair coupling factor  38.16 
 
 		 1153 aa  682    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0983  transcription-repair coupling factor  38.25 
 
 		 1153 aa  687    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0140  transcription-repair coupling factor  40.66 
 
 		 1159 aa  773    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00133746  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4359  transcription-repair coupling factor  37.29 
 
 		 1174 aa  644    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.281858  normal  0.0471962 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0424  transcription-repair coupling factor  40.2 
 
 		 1210 aa  751    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0369  transcriptional-repair coupling factor  33.63 
 
 		 1167 aa  644    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1656  transcription-repair coupling factor  36.57 
 
 		 1146 aa  659    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.221559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2767  transcription-repair coupling factor  36.2 
 
 		 1188 aa  687    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4404  transcription-repair coupling factor  36.8 
 
 		 1166 aa  687    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.353859  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1478  transcription-repair coupling factor  53.92 
 
 		 1246 aa  1214    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.313815 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1067  transcription-repair coupling factor  36.98 
 
 		 1193 aa  687    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4624  transcription-repair coupling factor  37.31 
 
 		 1211 aa  734    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0091  transcription-repair coupling factor  40.7 
 
 		 1161 aa  741    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5255  transcription-repair coupling factor  38.67 
 
 		 1156 aa  640    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0305001  normal  0.983896 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10511  transcriptional-repair coupling factor  33.63 
 
 		 1167 aa  643    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605187 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1176  transcription-repair coupling factor  35.93 
 
 		 1192 aa  652    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.141232  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3660  transcription-repair coupling factor  53.78 
 
 		 1265 aa  1211    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.593932 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1300  transcription-repair coupling factor  36.08 
 
 		 1192 aa  643    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3547  transcription-repair coupling factor  41.58 
 
 		 1158 aa  780    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0162042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1257  transcription-repair coupling factor  38.58 
 
 		 1147 aa  674    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.230651  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1168  transcription-repair coupling factor  35.76 
 
 		 1159 aa  637    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.507558  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0052  transcription-repair coupling factor  38.92 
 
 		 1176 aa  790    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11038  transcription-repair coupling factor mfd  37.46 
 
 		 1234 aa  728    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.970521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1326  transcription-repair coupling factor  38.77 
 
 		 1153 aa  714    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0639  transcription-repair coupling factor  37.98 
 
 		 1156 aa  662    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09271  transcriptional-repair coupling factor  33.51 
 
 		 1169 aa  662    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.254503  hitchhiker  0.0000230767 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0081  transcription-repair coupling factor  40.61 
 
 		 1183 aa  822    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000883466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3157  transcription-repair coupling factor  36.98 
 
 		 1164 aa  637    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4332  transcription-repair coupling factor  39.24 
 
 		 1241 aa  688    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0186143  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3926  transcription-repair coupling factor  39.9 
 
 		 1208 aa  733    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.892466 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2157  transcription-repair coupling factor  38.01 
 
 		 1148 aa  669    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1246  transcription-repair coupling factor  36.92 
 
 		 1157 aa  699    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.545868  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1948  transcription-repair coupling factor  38.32 
 
 		 1198 aa  718    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1796  transcription-repair coupling protein Mfd  36.81 
 
 		 1153 aa  679    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.46752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1748  transcription-repair coupling factor  38.14 
 
 		 1134 aa  687    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.921754  normal  0.10168 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2632  transcription-repair coupling factor  37.57 
 
 		 1178 aa  785    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0884  transcription-repair coupling factor  38.78 
 
 		 1216 aa  714    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0803  transcription-repair coupling factor  40.18 
 
 		 1188 aa  729    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0214899 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1567  transcription-repair coupling factor  39.8 
 
 		 1150 aa  682    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0112  transcription-repair coupling factor  38.49 
 
 		 1179 aa  771    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2550  transcription-repair coupling factor  36.55 
 
 		 1161 aa  637    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.277957  normal  0.0823791 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4549  transcription-repair coupling factor  36.68 
 
 		 1182 aa  733    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.191603 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1705  transcription-repair coupling factor  37.48 
 
 		 1174 aa  728    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0829  transcription-repair coupling factor  39.71 
 
 		 1218 aa  714    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.46683  normal  0.375475 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6135  transcription-repair coupling factor  38.76 
 
 		 1156 aa  642    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.352842  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4245  transcription-repair coupling factor  37.44 
 
 		 1211 aa  733    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1598  transcription-repair coupling factor  37.28 
 
 		 1148 aa  680    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000129728  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1725  transcription-repair coupling factor  36.57 
 
 		 1160 aa  665    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1299  transcription-repair coupling factor  36.84 
 
 		 1157 aa  697    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0538  transcription-repair coupling factor  37.37 
 
 		 1168 aa  736    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2807  transcription-repair coupling factor  38.15 
 
 		 1162 aa  783    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2493  transcription-repair coupling factor  38.24 
 
 		 1162 aa  785    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1161  transcription-repair coupling factor  37.45 
 
 		 1143 aa  711    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2656  transcription-repair coupling factor  100 
 
 		 1207 aa  2456    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0357057  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1629  transcription-repair coupling factor  37 
 
 		 1148 aa  691    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.027535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1476  transcription-repair coupling factor  38.69 
 
 		 1155 aa  695    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0179996  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1800  transcription-repair coupling factor  36.76 
 
 		 1166 aa  666    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1236  transcription-repair coupling factor  38.22 
 
 		 1148 aa  701    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00316475  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0073  transcription-repair coupling factor  47.86 
 
 		 1073 aa  674    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0048  transcription-repair coupling factor  38.49 
 
 		 1176 aa  796    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1932  transcription-repair coupling factor  38.54 
 
 		 1185 aa  640    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25230  transcription-repair coupling factor  37.78 
 
 		 1148 aa  665    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0011  transcription-repair coupling factor  37.94 
 
 		 1162 aa  739    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0183  transcription-repair coupling factor  37.88 
 
 		 1188 aa  734    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0271  transcription-repair coupling factor  37.2 
 
 		 1165 aa  716    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0399  transcription-repair coupling factor  38.48 
 
 		 1179 aa  726    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0007  transcription-repair coupling factor  36.98 
 
 		 1168 aa  687    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1245  transcription-repair coupling factor  38.53 
 
 		 1222 aa  682    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.877482  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1944  transcription-repair coupling factor  38.76 
 
 		 1156 aa  642    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3479  transcription-repair coupling factor  39.04 
 
 		 1189 aa  702    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.706369  normal  0.219385 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1651  transcription-repair coupling factor  36.8 
 
 		 1198 aa  699    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0949353  normal  0.53283 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1237  transcription-repair coupling factor  38.22 
 
 		 1148 aa  701    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.792337  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1913  transcription-repair coupling factor  38.96 
 
 		 1192 aa  696    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0499  transcription-repair coupling factor  47.4 
 
 		 1177 aa  695    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.245405  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1933  transcription-repair coupling factor  38.38 
 
 		 1173 aa  689    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.436616  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4478  transcription-repair coupling factor  39.04 
 
 		 1229 aa  696    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.419935 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0924  transcription-repair coupling factor  37.13 
 
 		 1224 aa  710    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.410165  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1330  transcription-repair coupling factor  37.98 
 
 		 1155 aa  682    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.643209  normal  0.63963 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4331  transcription-repair coupling factor  37.44 
 
 		 1211 aa  733    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.376638 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2204  transcription-repair coupling factor  35.94 
 
 		 1163 aa  659    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0607404  normal  0.440495 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>