More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0183 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01110  transcription-repair coupling factor  35.36 
 
 		 1148 aa  668    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.358379  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1709  transcription-repair coupling factor  36 
 
 		 1137 aa  664    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.517079  normal  0.0571023 
 
 
-
 
NC_002936  DET1281  transcription-repair coupling factor  37.38 
 
 		 1148 aa  709    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0777  transcription-repair coupling factor (superfamily II helicase)  36.26 
 
 		 1194 aa  644    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1476  transcription-repair coupling factor  36.94 
 
 		 1155 aa  663    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0179996  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2632  transcription-repair coupling factor  39.54 
 
 		 1178 aa  806    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1287  transcription-repair coupling factor  38.7 
 
 		 1155 aa  687    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0502901  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0141  transcription-repair coupling factor  42.07 
 
 		 1169 aa  904    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1988  transcription-repair coupling factor  36.15 
 
 		 1157 aa  640    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.232338  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1642  transcription-repair coupling factor protein  36.27 
 
 		 1157 aa  640    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.250538 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0051  transcription-repair coupling factor  46.11 
 
 		 1176 aa  1011    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0593  transcription-repair coupling factor  41.98 
 
 		 1165 aa  853    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0008  transcription-repair coupling factor  44.51 
 
 		 1165 aa  925    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2255  transcription-repair coupling factor  37.31 
 
 		 1164 aa  670    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0525  transcription-repair coupling factor  40.62 
 
 		 1168 aa  871    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0052  transcription-repair coupling factor  46.11 
 
 		 1176 aa  1012    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0048  transcription-repair coupling factor  46.11 
 
 		 1178 aa  1012    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0048  transcription-repair coupling factor  46.11 
 
 		 1176 aa  1013    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1491  transcription-repair coupling factor  36.15 
 
 		 1157 aa  640    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1016  transcription-repair coupling factor  36.72 
 
 		 1153 aa  657    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0983  transcription-repair coupling factor  36.57 
 
 		 1153 aa  665    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0262  transcription-repair coupling factor  47.94 
 
 		 1179 aa  1093    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1859  transcription-repair coupling factor  36.12 
 
 		 1156 aa  638    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0201793  hitchhiker  0.000194707 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1965  transcription-repair coupling factor  36.55 
 
 		 1147 aa  656    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.550833  normal  0.680854 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0424  transcription-repair coupling factor  36.16 
 
 		 1210 aa  640    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1998  transcription-repair coupling factor  34.93 
 
 		 1176 aa  657    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0120843 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1478  transcription-repair coupling factor  46.2 
 
 		 1246 aa  650    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.313815 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1292  transcription-repair coupling factor  35.08 
 
 		 1148 aa  678    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.208562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1543  transcription-repair coupling factor  37.33 
 
 		 1157 aa  659    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00144396  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2767  transcription-repair coupling factor  36.02 
 
 		 1188 aa  643    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2513  transcription-repair coupling factor  36.06 
 
 		 1189 aa  639    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0072  transcription-repair coupling factor  38.51 
 
 		 1176 aa  794    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0902915  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3866  transcription-repair coupling factor  35.38 
 
 		 1149 aa  661    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3157  transcription-repair coupling factor  36.66 
 
 		 1164 aa  638    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0091  transcription-repair coupling factor  37.19 
 
 		 1161 aa  685    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5255  transcription-repair coupling factor  36.12 
 
 		 1156 aa  637    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0305001  normal  0.983896 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2359  transcription-repair coupling factor  36.06 
 
 		 1189 aa  639    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.741078  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1968  transcription-repair coupling factor  36.15 
 
 		 1156 aa  640    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.095546 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1630  transcription-repair coupling factor  36.98 
 
 		 1160 aa  681    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00676636  normal  0.517783 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3547  transcription-repair coupling factor  47.82 
 
 		 1158 aa  642    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0162042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2158  transcription-repair coupling factor  36.05 
 
 		 1162 aa  669    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0247263  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0052  transcription-repair coupling factor  46.11 
 
 		 1176 aa  1012    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0048  transcription-repair coupling factor  45.84 
 
 		 1176 aa  1005    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2656  transcription-repair coupling factor  38.3 
 
 		 1207 aa  738    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0357057  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0639  transcription-repair coupling factor  34.74 
 
 		 1156 aa  639    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1092  transcription-repair coupling factor  36.53 
 
 		 1148 aa  697    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0081  transcription-repair coupling factor  40.59 
 
 		 1183 aa  854    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000883466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1330  transcription-repair coupling factor  34.99 
 
 		 1148 aa  675    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00266348 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0997  transcription-repair coupling factor  36.34 
 
 		 1164 aa  645    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0031  transcription-repair coupling factor  34.47 
 
 		 1195 aa  643    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1246  transcription-repair coupling factor  35.97 
 
 		 1157 aa  647    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.545868  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1933  transcription-repair coupling factor  35.2 
 
 		 1173 aa  663    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.436616  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1331  transcription-repair coupling factor  35.72 
 
 		 1175 aa  637    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.54754  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1796  transcription-repair coupling protein Mfd  34.82 
 
 		 1153 aa  666    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.46752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0538  transcription-repair coupling factor  40.62 
 
 		 1168 aa  871    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1748  transcription-repair coupling factor  34.96 
 
 		 1134 aa  656    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.921754  normal  0.10168 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1315  transcription-repair coupling factor  34.99 
 
 		 1148 aa  675    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000147681 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2313  transcription-repair coupling factor  35.54 
 
 		 1160 aa  644    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.141111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1674  transcription-repair coupling factor  36.32 
 
 		 1179 aa  651    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000415877  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2012  transcription-repair coupling factor  35.45 
 
 		 1148 aa  670    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00267728 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1567  transcription-repair coupling factor  36.12 
 
 		 1150 aa  682    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01528  transcription-repair coupling factor  36.98 
 
 		 1153 aa  672    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1260  transcription-repair coupling factor  36.15 
 
 		 1189 aa  640    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.148669  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0048  transcription-repair coupling factor  45.75 
 
 		 1176 aa  1003    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1874  transcription-repair coupling factor  35.3 
 
 		 1160 aa  636    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.157118  normal  0.0187303 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1629  transcription-repair coupling factor  35.3 
 
 		 1148 aa  668    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.027535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6135  transcription-repair coupling factor  36.06 
 
 		 1156 aa  638    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.352842  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2402  transcription-repair coupling factor  36.06 
 
 		 1189 aa  638    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1299  transcription-repair coupling factor  36 
 
 		 1157 aa  645    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1725  transcription-repair coupling factor  36.25 
 
 		 1160 aa  677    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1201  transcription-repair coupling factor  34.38 
 
 		 1154 aa  658    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.656597  normal  0.0999319 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1569  transcription-repair coupling factor  36.21 
 
 		 1184 aa  637    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.878317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2807  transcription-repair coupling factor  41.13 
 
 		 1162 aa  819    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2493  transcription-repair coupling factor  41.03 
 
 		 1162 aa  822    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1161  transcription-repair coupling factor  38.98 
 
 		 1143 aa  682    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0700  transcription-repair coupling factor  36.36 
 
 		 1165 aa  705    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00154056  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3660  transcription-repair coupling factor  36.54 
 
 		 1265 aa  695    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.593932 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2157  transcription-repair coupling factor  36.29 
 
 		 1148 aa  659    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1800  transcription-repair coupling factor  34.49 
 
 		 1166 aa  647    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2399  transcription-repair coupling factor  36.98 
 
 		 1178 aa  660    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00178528  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0073  transcription-repair coupling factor  35.71 
 
 		 1073 aa  706    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1932  transcription-repair coupling factor  36.21 
 
 		 1185 aa  642    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0140  transcription-repair coupling factor  47.01 
 
 		 1159 aa  648    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00133746  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0011  transcription-repair coupling factor  45.45 
 
 		 1162 aa  976    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0183  transcription-repair coupling factor  100 
 
 		 1188 aa  2419    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0271  transcription-repair coupling factor  45.8 
 
 		 1165 aa  1010    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0399  transcription-repair coupling factor  51.39 
 
 		 1179 aa  1225    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0007  transcription-repair coupling factor  45.24 
 
 		 1168 aa  928    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2006  transcription-repair coupling factor  35.69 
 
 		 1155 aa  636    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000316908 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1944  transcription-repair coupling factor  36.06 
 
 		 1156 aa  638    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3479  transcription-repair coupling factor  36.98 
 
 		 1189 aa  678    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.706369  normal  0.219385 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1651  transcription-repair coupling factor  36.7 
 
 		 1198 aa  656    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0949353  normal  0.53283 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4404  transcription-repair coupling factor  34.42 
 
 		 1166 aa  636    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.353859  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0111  transcription-repair coupling factor  41.37 
 
 		 1169 aa  853    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00148726  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0499  transcription-repair coupling factor  35.71 
 
 		 1177 aa  696    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.245405  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0067  transcription-repair coupling factor  38.87 
 
 		 1196 aa  812    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04745  transcription-repair coupling factor  35.43 
 
 		 1154 aa  644    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.982613  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1330  transcription-repair coupling factor  36.94 
 
 		 1155 aa  660    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.643209  normal  0.63963 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3318  transcription-repair coupling factor  36.15 
 
 		 1189 aa  640    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.101121  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2204  transcription-repair coupling factor  36.61 
 
 		 1163 aa  669    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0607404  normal  0.440495 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>