More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2767 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_3090  transcription-repair coupling factor  39.23 
 
 		 1174 aa  746    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.192538  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1202  transcription-repair coupling factor  35.75 
 
 		 1121 aa  657    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.851406  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1281  transcription-repair coupling factor  40 
 
 		 1148 aa  680    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0072  transcription-repair coupling factor  39.52 
 
 		 1176 aa  702    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0902915  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09271  transcriptional-repair coupling factor  49.46 
 
 		 1169 aa  1229    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.254503  hitchhiker  0.0000230767 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0700  transcription-repair coupling factor  36.65 
 
 		 1165 aa  680    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00154056  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1287  transcription-repair coupling factor  37.36 
 
 		 1155 aa  637    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0502901  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0141  transcription-repair coupling factor  38.78 
 
 		 1169 aa  711    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11038  transcription-repair coupling factor mfd  37.44 
 
 		 1234 aa  657    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.970521  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0051  transcription-repair coupling factor  38.27 
 
 		 1176 aa  748    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14371  transcriptional-repair coupling factor  56.79 
 
 		 1193 aa  1335    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0008  transcription-repair coupling factor  39.47 
 
 		 1165 aa  653    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0272  hypothetical protein  37.42 
 
 		 1123 aa  637    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.580517 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0131  transcription-repair coupling factor  37.04 
 
 		 1197 aa  689    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.10317  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0052  transcription-repair coupling factor  38.18 
 
 		 1176 aa  746    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0048  transcription-repair coupling factor  38.27 
 
 		 1178 aa  748    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0048  transcription-repair coupling factor  38.31 
 
 		 1176 aa  746    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0188  transcription-repair coupling factor  36.24 
 
 		 1182 aa  663    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1016  transcription-repair coupling factor  36.2 
 
 		 1153 aa  650    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0983  transcription-repair coupling factor  36.5 
 
 		 1153 aa  648    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10301  transcriptional-repair coupling factor  44.1 
 
 		 1170 aa  1110    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32300  transcription-repair coupling factor Mfd  38.16 
 
 		 1199 aa  680    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.742659  normal  0.328282 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0424  transcription-repair coupling factor  38.19 
 
 		 1210 aa  672    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0369  transcriptional-repair coupling factor  51.88 
 
 		 1167 aa  1276    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0638  transcription-repair coupling factor  39.55 
 
 		 1141 aa  679    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.138681  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1478  transcription-repair coupling factor  38.52 
 
 		 1246 aa  720    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.313815 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0538  transcription-repair coupling factor  38.01 
 
 		 1168 aa  687    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2767  transcription-repair coupling factor  100 
 
 		 1188 aa  2450    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1299  transcription-repair coupling factor  38.23 
 
 		 1157 aa  663    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0777  transcription-repair coupling factor (superfamily II helicase)  39.29 
 
 		 1194 aa  645    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0214  transcription-repair coupling factor  36.71 
 
 		 1197 aa  725    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0330142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4373  transcription-repair coupling factor  67.14 
 
 		 1158 aa  1658    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.456695  hitchhiker  0.00000184147 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0091  transcription-repair coupling factor  37.39 
 
 		 1161 aa  642    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0525  transcription-repair coupling factor  38.01 
 
 		 1168 aa  687    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0884  transcription-repair coupling factor  35.76 
 
 		 1216 aa  647    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1176  transcription-repair coupling factor  58.8 
 
 		 1192 aa  1416    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.141232  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0593  transcription-repair coupling factor  37.99 
 
 		 1165 aa  748    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1300  transcription-repair coupling factor  58.55 
 
 		 1192 aa  1393    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3547  transcription-repair coupling factor  39.54 
 
 		 1158 aa  668    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0162042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0048  transcription-repair coupling factor  38.88 
 
 		 1177 aa  756    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1246  transcription-repair coupling factor  38.12 
 
 		 1157 aa  658    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.545868  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0052  transcription-repair coupling factor  38.18 
 
 		 1176 aa  746    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0961  transcriptional-repair coupling factor  44.29 
 
 		 1174 aa  1112    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.489301  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1326  transcription-repair coupling factor  67.45 
 
 		 1153 aa  1649    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4312  transcription-repair coupling factor  67.22 
 
 		 1158 aa  1659    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0081  transcription-repair coupling factor  38.18 
 
 		 1183 aa  743    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000883466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0262  transcription-repair coupling factor  35.95 
 
 		 1179 aa  669    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2632  transcription-repair coupling factor  39.96 
 
 		 1178 aa  763    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3926  transcription-repair coupling factor  36.72 
 
 		 1208 aa  649    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.892466 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1092  transcription-repair coupling factor  39.43 
 
 		 1148 aa  676    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1705  transcription-repair coupling factor  37.82 
 
 		 1174 aa  652    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3660  transcription-repair coupling factor  38.44 
 
 		 1265 aa  707    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.593932 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0048  transcription-repair coupling factor  37.97 
 
 		 1176 aa  738    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4404  transcription-repair coupling factor  81.98 
 
 		 1166 aa  2033    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.353859  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21200  transcription-repair coupling factor  39.5 
 
 		 1170 aa  796    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.010694  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0067  transcription-repair coupling factor  40.19 
 
 		 1196 aa  736    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1298  transcription-repair coupling factor  36.89 
 
 		 1220 aa  656    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000122104 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09151  transcriptional-repair coupling factor  44.17 
 
 		 1175 aa  1092    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0111  transcription-repair coupling factor  40.61 
 
 		 1169 aa  758    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00148726  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2072  transcription-repair coupling factor  42.56 
 
 		 1123 aa  730    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1067  transcription-repair coupling factor  39.61 
 
 		 1193 aa  660    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0803  transcription-repair coupling factor  37.75 
 
 		 1188 aa  671    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0214899 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1827  transcription-repair coupling factor  73.02 
 
 		 1169 aa  1802    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2656  transcription-repair coupling factor  36.35 
 
 		 1207 aa  682    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0357057  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0140  transcription-repair coupling factor  37.32 
 
 		 1159 aa  691    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00133746  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4245  transcription-repair coupling factor  36.17 
 
 		 1211 aa  661    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0829  transcription-repair coupling factor  35.35 
 
 		 1218 aa  647    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.46683  normal  0.375475 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0124  transcription-repair coupling factor  38.48 
 
 		 1147 aa  652    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00760781  normal  0.18165 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10301  transcriptional-repair coupling factor  44.38 
 
 		 1169 aa  1115    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0058  transcription-repair coupling factor  38.31 
 
 		 1176 aa  741    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2807  transcription-repair coupling factor  35.02 
 
 		 1162 aa  723    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2493  transcription-repair coupling factor  35.22 
 
 		 1162 aa  726    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1013  transcription-repair coupling factor  36.06 
 
 		 1205 aa  653    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0526678 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1671  transcription-repair coupling factor  66.39 
 
 		 1180 aa  1646    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0048  transcription-repair coupling factor  38.2 
 
 		 1176 aa  749    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0050  transcription-repair coupling factor  38.05 
 
 		 1177 aa  732    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4624  transcription-repair coupling factor  36.16 
 
 		 1211 aa  660    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0182  transcription-repair coupling factor  40.85 
 
 		 1183 aa  726    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0073  transcription-repair coupling factor  36.69 
 
 		 1073 aa  666    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1894  transcription-repair coupling factor  34.22 
 
 		 1109 aa  647    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.377763  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1935  transcription-repair coupling factor  35.46 
 
 		 1216 aa  640    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.671489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0062  transcription-repair coupling factor  38.27 
 
 		 1176 aa  748    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0011  transcription-repair coupling factor  38.91 
 
 		 1162 aa  701    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0183  transcription-repair coupling factor  35.8 
 
 		 1188 aa  638    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0271  transcription-repair coupling factor  38.3 
 
 		 1165 aa  702    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0399  transcription-repair coupling factor  36.32 
 
 		 1179 aa  657    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0007  transcription-repair coupling factor  38.19 
 
 		 1168 aa  695    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1245  transcription-repair coupling factor  35.89 
 
 		 1222 aa  650    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.877482  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0112  transcription-repair coupling factor  38.5 
 
 		 1179 aa  724    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4525  transcription-repair coupling factor  36.34 
 
 		 1192 aa  642    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3738  transcription-repair coupling factor  67.66 
 
 		 1168 aa  1677    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3741  transcription-repair coupling factor  36.72 
 
 		 1182 aa  700    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.34254 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1913  transcription-repair coupling factor  38.02 
 
 		 1192 aa  656    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0499  transcription-repair coupling factor  38.24 
 
 		 1177 aa  654    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.245405  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0059  transcription-repair coupling factor  38.27 
 
 		 1176 aa  748    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10511  transcriptional-repair coupling factor  52.13 
 
 		 1167 aa  1284    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605187 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0924  transcription-repair coupling factor  35.71 
 
 		 1224 aa  657    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.410165  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5258  transcription-repair coupling factor  38.22 
 
 		 1176 aa  740    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4331  transcription-repair coupling factor  36.17 
 
 		 1211 aa  661    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.376638 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0967  transcription-repair coupling factor  37.15 
 
 		 1170 aa  648    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.8826  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>