More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_0272 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_1355  transcription-repair coupling factor  35.92 
 
 		 1150 aa  660    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1774  transcription-repair coupling factor  42.28 
 
 		 1122 aa  934    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1287  transcription-repair coupling factor  36.25 
 
 		 1155 aa  654    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0502901  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21200  transcription-repair coupling factor  35.76 
 
 		 1170 aa  716    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.010694  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0051  transcription-repair coupling factor  34.83 
 
 		 1176 aa  669    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2147  transcription-repair coupling factor  42.76 
 
 		 1103 aa  711    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0700  transcription-repair coupling factor  35.99 
 
 		 1165 aa  684    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00154056  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0052  transcription-repair coupling factor  34.83 
 
 		 1176 aa  669    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0048  transcription-repair coupling factor  34.76 
 
 		 1178 aa  670    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0048  transcription-repair coupling factor  34.5 
 
 		 1176 aa  670    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3728  transcription-repair coupling factor  36.32 
 
 		 1103 aa  672    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0140  transcription-repair coupling factor  35.66 
 
 		 1159 aa  668    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00133746  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1894  transcription-repair coupling factor  46.8 
 
 		 1109 aa  1038    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.377763  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0058  transcription-repair coupling factor  34.58 
 
 		 1176 aa  667    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2767  transcription-repair coupling factor  37.42 
 
 		 1188 aa  637    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0050  transcription-repair coupling factor  34.76 
 
 		 1177 aa  669    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0272  hypothetical protein  100 
 
 		 1123 aa  2318    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.580517 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0630  transcription-repair coupling factor  38.95 
 
 		 1109 aa  698    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2754  transcription-repair coupling factor  44.45 
 
 		 1112 aa  942    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.502691  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1882  transcription-repair coupling factor  43.19 
 
 		 1099 aa  731    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0052  transcription-repair coupling factor  34.83 
 
 		 1176 aa  669    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3695  transcription-repair coupling factor  54.11 
 
 		 1115 aa  1225    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0538  transcription-repair coupling factor  34.53 
 
 		 1168 aa  644    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0048  transcription-repair coupling factor  35.16 
 
 		 1177 aa  659    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0262  transcription-repair coupling factor  34.48 
 
 		 1179 aa  647    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02560  transcription-repair coupling factor  46.3 
 
 		 1126 aa  1024    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0182  transcription-repair coupling factor  35.84 
 
 		 1183 aa  703    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1246  transcription-repair coupling factor  36.16 
 
 		 1157 aa  667    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.545868  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0770  transcription-repair coupling factor  40.15 
 
 		 1116 aa  728    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0638  transcription-repair coupling factor  38 
 
 		 1141 aa  638    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.138681  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4549  transcription-repair coupling factor  38.03 
 
 		 1182 aa  653    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.191603 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0048  transcription-repair coupling factor  34.67 
 
 		 1176 aa  688    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1696  transcription-repair coupling factor  40.72 
 
 		 1107 aa  708    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000188307 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2072  transcription-repair coupling factor  36.71 
 
 		 1123 aa  657    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5514  transcription-repair coupling factor  52.89 
 
 		 1126 aa  1222    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0022  transcription-repair coupling factor  50.8 
 
 		 1113 aa  1147    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3741  transcription-repair coupling factor  36.95 
 
 		 1182 aa  681    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.34254 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3453  transcription-repair coupling factor  53.43 
 
 		 1122 aa  1212    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0209077 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2807  transcription-repair coupling factor  37.82 
 
 		 1162 aa  698    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2493  transcription-repair coupling factor  37.68 
 
 		 1162 aa  704    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0409  transcription-repair coupling factor  47.67 
 
 		 1126 aa  1102    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1671  transcription-repair coupling factor  38.34 
 
 		 1180 aa  639    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0214  transcription-repair coupling factor  36 
 
 		 1197 aa  663    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0330142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0059  transcription-repair coupling factor  34.83 
 
 		 1176 aa  670    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1202  transcription-repair coupling factor  46.59 
 
 		 1121 aa  1028    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.851406  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0073  transcription-repair coupling factor  36.43 
 
 		 1073 aa  640    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0766  transcription-repair coupling factor  38.19 
 
 		 1120 aa  732    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1299  transcription-repair coupling factor  36.07 
 
 		 1157 aa  666    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5258  transcription-repair coupling factor  34.56 
 
 		 1176 aa  667    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0011  transcription-repair coupling factor  36.65 
 
 		 1162 aa  658    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0048  transcription-repair coupling factor  34.14 
 
 		 1176 aa  659    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0593  transcription-repair coupling factor  35.62 
 
 		 1165 aa  652    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3479  transcription-repair coupling factor  35.86 
 
 		 1189 aa  642    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.706369  normal  0.219385 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0062  transcription-repair coupling factor  34.83 
 
 		 1176 aa  669    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0525  transcription-repair coupling factor  34.53 
 
 		 1168 aa  644    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0499  transcription-repair coupling factor  35.77 
 
 		 1177 aa  683    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.245405  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0878  transcription-repair coupling factor  43.82 
 
 		 1127 aa  736    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1478  transcription-repair coupling factor  44.64 
 
 		 1246 aa  632  1e-180  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.313815 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0091  transcription-repair coupling factor  35.73 
 
 		 1161 aa  635  1e-180  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2656  transcription-repair coupling factor  34.56 
 
 		 1207 aa  635  1e-180  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0357057  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1092  transcription-repair coupling factor  37.4 
 
 		 1148 aa  635  1e-180  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1326  transcription-repair coupling factor  34.79 
 
 		 1153 aa  634  1e-180  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0111  transcription-repair coupling factor  43.04 
 
 		 1169 aa  633  1e-180  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00148726  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1064  transcription-repair coupling factor (superfamily II helicase)  37.3 
 
 		 1154 aa  630  1e-179  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.566316  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0081  transcription-repair coupling factor  43.2 
 
 		 1183 aa  630  1e-179  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000883466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3660  transcription-repair coupling factor  42.31 
 
 		 1265 aa  631  1e-179  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.593932 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0007  transcription-repair coupling factor  36.41 
 
 		 1168 aa  631  1e-179  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1281  transcription-repair coupling factor  36.91 
 
 		 1148 aa  628  1e-178  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5241  transcription-repair coupling factor  35.29 
 
 		 1112 aa  628  1e-178  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1796  transcription-repair coupling protein Mfd  35.18 
 
 		 1153 aa  627  1e-178  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.46752  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3135  transcription-repair coupling factor  36.18 
 
 		 1164 aa  623  1e-177  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.223116  normal  0.109749 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0657  transcription-repair coupling factor  37.11 
 
 		 1202 aa  621  1e-176  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4487  transcription-repair coupling factor  36.13 
 
 		 1233 aa  622  1e-176  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.751357  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0197  transcription-repair coupling factor  45 
 
 		 1157 aa  620  1e-176  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5656599999999998e-21 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0214  transcription-repair coupling factor  42.29 
 
 		 1157 aa  619  1e-176  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0683043  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4332  transcription-repair coupling factor  36.3 
 
 		 1241 aa  622  1e-176  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0186143  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1651  transcription-repair coupling factor  36.31 
 
 		 1198 aa  620  1e-176  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0949353  normal  0.53283 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4468  transcription-repair coupling factor  35.94 
 
 		 1241 aa  619  1e-176  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0141  transcription-repair coupling factor  41.29 
 
 		 1169 aa  616  1e-175  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4404  transcription-repair coupling factor  34.02 
 
 		 1166 aa  616  1e-175  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.353859  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1630  transcription-repair coupling factor  35.58 
 
 		 1160 aa  617  1e-175  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00676636  normal  0.517783 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0424  transcription-repair coupling factor  34.36 
 
 		 1210 aa  617  1e-175  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3547  transcription-repair coupling factor  44.05 
 
 		 1158 aa  617  1e-175  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0162042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0112  transcription-repair coupling factor  40.21 
 
 		 1179 aa  616  1e-175  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0271  transcription-repair coupling factor  45.62 
 
 		 1165 aa  619  1e-175  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1511  transcription-repair coupling factor  36.92 
 
 		 1059 aa  618  1e-175  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2148  transcription-repair coupling factor  36.26 
 
 		 1149 aa  614  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0740298 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0131  transcription-repair coupling factor  46.68 
 
 		 1197 aa  615  9.999999999999999e-175  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.10317  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3594  transcription-repair coupling factor  36.16 
 
 		 1149 aa  615  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.184937 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2632  transcription-repair coupling factor  41.83 
 
 		 1178 aa  614  9.999999999999999e-175  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1543  transcription-repair coupling factor  35.41 
 
 		 1157 aa  615  9.999999999999999e-175  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00144396  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2833  transcription-repair coupling factor  36.93 
 
 		 1157 aa  611  1e-173  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000601821  hitchhiker  0.00381117 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3738  transcription-repair coupling factor  34.68 
 
 		 1168 aa  608  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1705  transcription-repair coupling factor  34.44 
 
 		 1174 aa  607  9.999999999999999e-173  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0399  transcription-repair coupling factor  32.3 
 
 		 1179 aa  607  9.999999999999999e-173  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4373  transcription-repair coupling factor  34.97 
 
 		 1158 aa  607  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.456695  hitchhiker  0.00000184147 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1642  transcription-repair coupling factor protein  36.38 
 
 		 1157 aa  605  1.0000000000000001e-171  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.250538 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0983  transcription-repair coupling factor  34.29 
 
 		 1153 aa  604  1.0000000000000001e-171  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1904  transcription-repair coupling factor  36.35 
 
 		 1143 aa  604  1.0000000000000001e-171  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.288854 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0067  transcription-repair coupling factor  44.7 
 
 		 1196 aa  603  1.0000000000000001e-171  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>