More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0967 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_0829  transcription-repair coupling factor  34.67 
 
 		 1218 aa  674    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.46683  normal  0.375475 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07020  transcription-repair coupling factor Mfd  34.09 
 
 		 1244 aa  665    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0711584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09151  transcriptional-repair coupling factor  35.43 
 
 		 1175 aa  648    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1281  transcription-repair coupling factor  36.12 
 
 		 1148 aa  704    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0017  transcription-repair coupling factor  35.15 
 
 		 1157 aa  662    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0270668  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0777  transcription-repair coupling factor (superfamily II helicase)  35.87 
 
 		 1194 aa  659    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0538  transcription-repair coupling factor  38.13 
 
 		 1168 aa  774    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1287  transcription-repair coupling factor  35.88 
 
 		 1155 aa  685    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0502901  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0141  transcription-repair coupling factor  38.44 
 
 		 1169 aa  802    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1948  transcription-repair coupling factor  34.97 
 
 		 1198 aa  655    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0051  transcription-repair coupling factor  40.07 
 
 		 1176 aa  866    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0059  transcription-repair coupling factor  39.98 
 
 		 1176 aa  863    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0008  transcription-repair coupling factor  39.94 
 
 		 1165 aa  727    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0050  transcription-repair coupling factor  40.43 
 
 		 1177 aa  830    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3738  transcription-repair coupling factor  34.22 
 
 		 1168 aa  677    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0052  transcription-repair coupling factor  39.98 
 
 		 1176 aa  863    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0048  transcription-repair coupling factor  39.98 
 
 		 1178 aa  863    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0048  transcription-repair coupling factor  39.97 
 
 		 1176 aa  864    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0048  transcription-repair coupling factor  40.15 
 
 		 1176 aa  869    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0124  transcription-repair coupling factor  33.19 
 
 		 1147 aa  645    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00760781  normal  0.18165 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4373  transcription-repair coupling factor  34.62 
 
 		 1158 aa  671    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.456695  hitchhiker  0.00000184147 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3741  transcription-repair coupling factor  34.97 
 
 		 1182 aa  724    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.34254 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0214  transcription-repair coupling factor  40.09 
 
 		 1197 aa  875    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0330142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0424  transcription-repair coupling factor  36.1 
 
 		 1210 aa  660    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0369  transcriptional-repair coupling factor  35.71 
 
 		 1167 aa  669    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4312  transcription-repair coupling factor  34.45 
 
 		 1158 aa  667    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0525  transcription-repair coupling factor  38.13 
 
 		 1168 aa  774    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10301  transcriptional-repair coupling factor  36.1 
 
 		 1169 aa  651    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2767  transcription-repair coupling factor  37.19 
 
 		 1188 aa  681    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3660  transcription-repair coupling factor  35.19 
 
 		 1265 aa  717    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.593932 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05560  transcription-repair coupling factor Mfd  35.53 
 
 		 1218 aa  669    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0182  transcription-repair coupling factor  41.14 
 
 		 1183 aa  872    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0072  transcription-repair coupling factor  36.09 
 
 		 1176 aa  785    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0902915  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0091  transcription-repair coupling factor  33.21 
 
 		 1161 aa  644    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0593  transcription-repair coupling factor  43.86 
 
 		 1165 aa  929    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1013  transcription-repair coupling factor  33.61 
 
 		 1205 aa  658    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0526678 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0188  transcription-repair coupling factor  35.46 
 
 		 1182 aa  679    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1067  transcription-repair coupling factor  34.64 
 
 		 1193 aa  649    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0967  transcription-repair coupling factor  100 
 
 		 1170 aa  2340    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.8826  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3547  transcription-repair coupling factor  35.64 
 
 		 1158 aa  695    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0162042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10301  transcriptional-repair coupling factor  35.12 
 
 		 1170 aa  651    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0214  transcription-repair coupling factor  33.48 
 
 		 1157 aa  681    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0683043  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0052  transcription-repair coupling factor  39.98 
 
 		 1176 aa  863    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0961  transcriptional-repair coupling factor  37.13 
 
 		 1174 aa  645    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.489301  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1326  transcription-repair coupling factor  34.21 
 
 		 1153 aa  683    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0081  transcription-repair coupling factor  37.46 
 
 		 1183 aa  858    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000883466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11038  transcription-repair coupling factor mfd  34.3 
 
 		 1234 aa  653    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.970521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0112  transcription-repair coupling factor  41.49 
 
 		 1179 aa  889    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0062  transcription-repair coupling factor  40.07 
 
 		 1176 aa  866    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1298  transcription-repair coupling factor  34.9 
 
 		 1220 aa  650    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000122104 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1092  transcription-repair coupling factor  36.75 
 
 		 1148 aa  716    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0067  transcription-repair coupling factor  37.02 
 
 		 1196 aa  813    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0058  transcription-repair coupling factor  39.97 
 
 		 1176 aa  859    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1796  transcription-repair coupling protein Mfd  36.03 
 
 		 1153 aa  647    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.46752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08480  transcription-repair coupling factor Mfd  32.87 
 
 		 1155 aa  639    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.13697  normal  0.343175 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0048  transcription-repair coupling factor  39.98 
 
 		 1177 aa  827    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0048  transcription-repair coupling factor  39.65 
 
 		 1176 aa  858    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0262  transcription-repair coupling factor  38.94 
 
 		 1179 aa  806    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2685  transcription-repair coupling factor  34.07 
 
 		 1218 aa  661    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4624  transcription-repair coupling factor  34.61 
 
 		 1211 aa  679    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09271  transcriptional-repair coupling factor  33.74 
 
 		 1169 aa  661    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.254503  hitchhiker  0.0000230767 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4549  transcription-repair coupling factor  34.99 
 
 		 1182 aa  685    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.191603 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3090  transcription-repair coupling factor  39.85 
 
 		 1174 aa  860    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.192538  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0111  transcription-repair coupling factor  39.68 
 
 		 1169 aa  870    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00148726  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2632  transcription-repair coupling factor  40.84 
 
 		 1178 aa  898    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4245  transcription-repair coupling factor  34.61 
 
 		 1211 aa  678    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2656  transcription-repair coupling factor  36.5 
 
 		 1207 aa  737    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0357057  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2072  transcription-repair coupling factor  47.68 
 
 		 1123 aa  689    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0197  transcription-repair coupling factor  34.38 
 
 		 1157 aa  681    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5656599999999998e-21 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1355  transcription-repair coupling factor  36.01 
 
 		 1150 aa  717    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2807  transcription-repair coupling factor  42.05 
 
 		 1162 aa  882    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2493  transcription-repair coupling factor  43 
 
 		 1162 aa  883    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1978  transcription-repair coupling factor  31.96 
 
 		 1159 aa  639    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1671  transcription-repair coupling factor  33.04 
 
 		 1180 aa  636    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1800  transcription-repair coupling factor  34.36 
 
 		 1166 aa  652    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1023  transcription-repair coupling factor  34.36 
 
 		 1168 aa  650    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0073  transcription-repair coupling factor  34.71 
 
 		 1073 aa  681    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0131  transcription-repair coupling factor  38.19 
 
 		 1197 aa  812    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.10317  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5258  transcription-repair coupling factor  39.63 
 
 		 1176 aa  856    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02437  transcription-repair coupling factor  34.72 
 
 		 1165 aa  635    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.272439  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0011  transcription-repair coupling factor  41.08 
 
 		 1162 aa  808    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0183  transcription-repair coupling factor  37.92 
 
 		 1188 aa  766    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0271  transcription-repair coupling factor  40.26 
 
 		 1165 aa  810    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0399  transcription-repair coupling factor  37.3 
 
 		 1179 aa  781    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0007  transcription-repair coupling factor  39.15 
 
 		 1168 aa  739    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4404  transcription-repair coupling factor  34.41 
 
 		 1166 aa  665    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.353859  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1064  transcription-repair coupling factor (superfamily II helicase)  35.98 
 
 		 1154 aa  711    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.566316  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3479  transcription-repair coupling factor  34.86 
 
 		 1189 aa  676    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.706369  normal  0.219385 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0140  transcription-repair coupling factor  35.17 
 
 		 1159 aa  709    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00133746  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4478  transcription-repair coupling factor  33 
 
 		 1229 aa  650    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.419935 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0499  transcription-repair coupling factor  34.17 
 
 		 1177 aa  677    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.245405  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10511  transcriptional-repair coupling factor  36.15 
 
 		 1167 aa  673    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605187 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1705  transcription-repair coupling factor  34.11 
 
 		 1174 aa  684    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0638  transcription-repair coupling factor  38.73 
 
 		 1141 aa  745    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.138681  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07780  transcription-repair coupling factor Mfd  36.9 
 
 		 1212 aa  656    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.784778  normal  0.111573 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4331  transcription-repair coupling factor  34.61 
 
 		 1211 aa  678    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.376638 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2204  transcription-repair coupling factor  35.02 
 
 		 1163 aa  645    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0607404  normal  0.440495 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4777  transcription-repair coupling factor  34.79 
 
 		 1212 aa  661    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.549284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1827  transcription-repair coupling factor  34.5 
 
 		 1169 aa  673    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21200  transcription-repair coupling factor  38.72 
 
 		 1170 aa  830    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.010694  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>