More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0961 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1281  transcription-repair coupling factor  33.83 
 
 		 1148 aa  646    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09151  transcriptional-repair coupling factor  79.49 
 
 		 1175 aa  1902    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0112  transcription-repair coupling factor  37.01 
 
 		 1179 aa  677    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0141  transcription-repair coupling factor  34.57 
 
 		 1169 aa  692    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0538  transcription-repair coupling factor  34.13 
 
 		 1168 aa  655    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0051  transcription-repair coupling factor  35.87 
 
 		 1176 aa  692    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0657  transcription-repair coupling factor  33.15 
 
 		 1202 aa  636    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1827  transcription-repair coupling factor  45.82 
 
 		 1169 aa  1164    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0052  transcription-repair coupling factor  35.96 
 
 		 1176 aa  694    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0048  transcription-repair coupling factor  35.96 
 
 		 1178 aa  693    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0048  transcription-repair coupling factor  35.96 
 
 		 1176 aa  694    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0111  transcription-repair coupling factor  34.64 
 
 		 1169 aa  688    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00148726  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0369  transcriptional-repair coupling factor  54.41 
 
 		 1167 aa  1281    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5258  transcription-repair coupling factor  36.57 
 
 		 1176 aa  692    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0593  transcription-repair coupling factor  37.81 
 
 		 1165 aa  705    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2767  transcription-repair coupling factor  44.45 
 
 		 1188 aa  1138    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0048  transcription-repair coupling factor  36.24 
 
 		 1176 aa  690    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0067  transcription-repair coupling factor  34.48 
 
 		 1196 aa  661    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1176  transcription-repair coupling factor  46.97 
 
 		 1192 aa  1218    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.141232  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1300  transcription-repair coupling factor  46.21 
 
 		 1192 aa  1208    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2632  transcription-repair coupling factor  37.43 
 
 		 1178 aa  727    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0052  transcription-repair coupling factor  35.96 
 
 		 1176 aa  694    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0961  transcriptional-repair coupling factor  100 
 
 		 1174 aa  2362    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.489301  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1326  transcription-repair coupling factor  44.83 
 
 		 1153 aa  1154    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0967  transcription-repair coupling factor  36.75 
 
 		 1170 aa  639    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.8826  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0081  transcription-repair coupling factor  32.6 
 
 		 1183 aa  662    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000883466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0048  transcription-repair coupling factor  35.84 
 
 		 1177 aa  687    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4312  transcription-repair coupling factor  47.61 
 
 		 1158 aa  1143    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3741  transcription-repair coupling factor  32.76 
 
 		 1182 aa  646    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.34254 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0262  transcription-repair coupling factor  33.39 
 
 		 1179 aa  679    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0058  transcription-repair coupling factor  36.47 
 
 		 1176 aa  690    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0525  transcription-repair coupling factor  34.13 
 
 		 1168 aa  655    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1064  transcription-repair coupling factor (superfamily II helicase)  33.07 
 
 		 1154 aa  649    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.566316  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4404  transcription-repair coupling factor  45.56 
 
 		 1166 aa  1144    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.353859  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1092  transcription-repair coupling factor  34.04 
 
 		 1148 aa  656    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10511  transcriptional-repair coupling factor  54.32 
 
 		 1167 aa  1280    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605187 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0072  transcription-repair coupling factor  31.87 
 
 		 1176 aa  656    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0902915  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3090  transcription-repair coupling factor  37.19 
 
 		 1174 aa  732    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.192538  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21200  transcription-repair coupling factor  34.49 
 
 		 1170 aa  684    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.010694  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0048  transcription-repair coupling factor  36.5 
 
 		 1176 aa  702    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4373  transcription-repair coupling factor  47.53 
 
 		 1158 aa  1140    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.456695  hitchhiker  0.00000184147 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2807  transcription-repair coupling factor  35.41 
 
 		 1162 aa  694    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2493  transcription-repair coupling factor  36.14 
 
 		 1162 aa  699    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1671  transcription-repair coupling factor  43.7 
 
 		 1180 aa  1067    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0214  transcription-repair coupling factor  31.84 
 
 		 1157 aa  643    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0683043  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0050  transcription-repair coupling factor  36.9 
 
 		 1177 aa  698    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3738  transcription-repair coupling factor  46.5 
 
 		 1168 aa  1137    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0011  transcription-repair coupling factor  35.4 
 
 		 1162 aa  644    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0638  transcription-repair coupling factor  35.63 
 
 		 1141 aa  657    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.138681  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0271  transcription-repair coupling factor  37.23 
 
 		 1165 aa  693    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0007  transcription-repair coupling factor  35.65 
 
 		 1168 aa  649    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0062  transcription-repair coupling factor  35.87 
 
 		 1176 aa  692    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0059  transcription-repair coupling factor  35.96 
 
 		 1176 aa  695    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0182  transcription-repair coupling factor  32.71 
 
 		 1183 aa  672    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1355  transcription-repair coupling factor  34.12 
 
 		 1150 aa  661    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10301  transcriptional-repair coupling factor  91.79 
 
 		 1169 aa  2144    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10301  transcriptional-repair coupling factor  91.45 
 
 		 1170 aa  2134    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09271  transcriptional-repair coupling factor  50.09 
 
 		 1169 aa  1199    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.254503  hitchhiker  0.0000230767 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14371  transcriptional-repair coupling factor  47.42 
 
 		 1193 aa  1170    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0188  transcription-repair coupling factor  31.61 
 
 		 1182 aa  635  1e-180  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0983  transcription-repair coupling factor  35.35 
 
 		 1153 aa  630  1e-179  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2072  transcription-repair coupling factor  45.47 
 
 		 1123 aa  632  1e-179  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0131  transcription-repair coupling factor  45.34 
 
 		 1197 aa  630  1e-179  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.10317  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1016  transcription-repair coupling factor  35.41 
 
 		 1153 aa  629  1e-178  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1023  transcription-repair coupling factor  30.53 
 
 		 1168 aa  626  1e-178  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1246  transcription-repair coupling factor  33.58 
 
 		 1157 aa  624  1e-177  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.545868  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1299  transcription-repair coupling factor  33.58 
 
 		 1157 aa  624  1e-177  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5241  transcription-repair coupling factor  29.25 
 
 		 1112 aa  623  1e-177  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3479  transcription-repair coupling factor  34.09 
 
 		 1189 aa  625  1e-177  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.706369  normal  0.219385 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0008  transcription-repair coupling factor  36.24 
 
 		 1165 aa  620  1e-176  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1642  transcription-repair coupling factor  32.99 
 
 		 1158 aa  620  1e-176  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0424  transcription-repair coupling factor  30.93 
 
 		 1210 aa  619  1e-175  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1298  transcription-repair coupling factor  33.21 
 
 		 1220 aa  617  1e-175  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000122104 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0022  transcription-repair coupling factor  33.63 
 
 		 1113 aa  616  1e-175  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0124  transcription-repair coupling factor  31.43 
 
 		 1147 aa  613  9.999999999999999e-175  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00760781  normal  0.18165 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1478  transcription-repair coupling factor  39.16 
 
 		 1246 aa  615  9.999999999999999e-175  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.313815 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1894  transcription-repair coupling factor  32.8 
 
 		 1109 aa  613  9.999999999999999e-175  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.377763  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1796  transcription-repair coupling protein Mfd  33.84 
 
 		 1153 aa  612  1e-173  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.46752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1202  transcription-repair coupling factor  33.61 
 
 		 1121 aa  607  9.999999999999999e-173  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.851406  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0214  transcription-repair coupling factor  44.13 
 
 		 1197 aa  606  9.999999999999999e-173  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0330142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0091  transcription-repair coupling factor  31.47 
 
 		 1161 aa  608  9.999999999999999e-173  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1913  transcription-repair coupling factor  33.46 
 
 		 1192 aa  608  9.999999999999999e-173  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1543  transcription-repair coupling factor  32.65 
 
 		 1157 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00144396  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3547  transcription-repair coupling factor  44.65 
 
 		 1158 aa  603  1.0000000000000001e-171  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0162042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1811  transcription-repair coupling factor  33.15 
 
 		 1157 aa  601  1e-170  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000258386  normal  0.0877788 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5514  transcription-repair coupling factor  33.15 
 
 		 1126 aa  601  1e-170  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1013  transcription-repair coupling factor  29.73 
 
 		 1205 aa  601  1e-170  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0526678 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0898  transcription-repair coupling factor  30.24 
 
 		 1214 aa  601  1e-170  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.165774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2158  transcription-repair coupling factor  31.86 
 
 		 1162 aa  597  1e-169  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0247263  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1287  transcription-repair coupling factor  34.06 
 
 		 1155 aa  596  1e-169  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0502901  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3660  transcription-repair coupling factor  37.94 
 
 		 1265 aa  599  1e-169  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.593932 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1168  transcription-repair coupling factor  33.36 
 
 		 1159 aa  598  1e-169  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.507558  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01528  transcription-repair coupling factor  32.88 
 
 		 1153 aa  597  1e-169  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0696  transcription-repair coupling factor  31.84 
 
 		 1151 aa  596  1e-169  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.221423  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1327  transcription-repair coupling factor  32.05 
 
 		 1156 aa  594  1e-168  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.241535  hitchhiker  0.000253034 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2255  transcription-repair coupling factor  31.85 
 
 		 1164 aa  595  1e-168  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3081  transcription-repair coupling factor  31.07 
 
 		 1171 aa  595  1e-168  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.195799  normal  0.080304 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1567  transcription-repair coupling factor  31.81 
 
 		 1150 aa  594  1e-168  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1691  transcription-repair coupling factor  31.8 
 
 		 1153 aa  593  1e-168  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.427142  normal  0.0220248 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0399  transcription-repair coupling factor  42.49 
 
 		 1179 aa  596  1e-168  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>