More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_13430 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_0777  transcription-repair coupling factor (superfamily II helicase)  53.87 
 
 		 1194 aa  1207    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2533  transcription-repair coupling factor  36.98 
 
 		 1164 aa  643    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00875995  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1281  transcription-repair coupling factor  38.99 
 
 		 1148 aa  696    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0017  transcription-repair coupling factor  39.84 
 
 		 1157 aa  669    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0270668  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1092  transcription-repair coupling factor  39.28 
 
 		 1148 aa  689    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0124  transcription-repair coupling factor  36.81 
 
 		 1147 aa  680    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00760781  normal  0.18165 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1647  transcription-repair coupling factor  38.1 
 
 		 1150 aa  650    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0141  transcription-repair coupling factor  36.88 
 
 		 1169 aa  704    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4525  transcription-repair coupling factor  56.37 
 
 		 1192 aa  1180    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0050  transcription-repair coupling factor  37.6 
 
 		 1177 aa  694    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0051  transcription-repair coupling factor  38.13 
 
 		 1176 aa  715    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0593  transcription-repair coupling factor  37.51 
 
 		 1165 aa  737    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0008  transcription-repair coupling factor  37.04 
 
 		 1165 aa  650    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3660  transcription-repair coupling factor  50.29 
 
 		 1265 aa  656    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.593932 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1935  transcription-repair coupling factor  58.89 
 
 		 1216 aa  1385    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.671489  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0638  transcription-repair coupling factor  38.1 
 
 		 1141 aa  687    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.138681  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0052  transcription-repair coupling factor  38.22 
 
 		 1176 aa  719    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0048  transcription-repair coupling factor  38.22 
 
 		 1178 aa  716    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0048  transcription-repair coupling factor  38.04 
 
 		 1176 aa  713    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0048  transcription-repair coupling factor  37.63 
 
 		 1176 aa  713    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1016  transcription-repair coupling factor  36.72 
 
 		 1153 aa  645    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0983  transcription-repair coupling factor  35.93 
 
 		 1153 aa  644    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0182  transcription-repair coupling factor  41.52 
 
 		 1183 aa  741    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0829  transcription-repair coupling factor  58.55 
 
 		 1218 aa  1331    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.46683  normal  0.375475 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0424  transcription-repair coupling factor  58.98 
 
 		 1210 aa  1322    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0131  transcription-repair coupling factor  39.42 
 
 		 1197 aa  740    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.10317  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1827  transcription-repair coupling factor  36.99 
 
 		 1169 aa  651    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2487  transcription-repair coupling factor  37.07 
 
 		 1164 aa  643    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0203456  hitchhiker  0.00300257 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2767  transcription-repair coupling factor  38.29 
 
 		 1188 aa  640    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2632  transcription-repair coupling factor  37.07 
 
 		 1178 aa  744    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0700  transcription-repair coupling factor  37.95 
 
 		 1165 aa  677    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00154056  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0525  transcription-repair coupling factor  37.44 
 
 		 1168 aa  718    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0538  transcription-repair coupling factor  37.44 
 
 		 1168 aa  718    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0091  transcription-repair coupling factor  38.03 
 
 		 1161 aa  659    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0062  transcription-repair coupling factor  38.13 
 
 		 1176 aa  715    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13430  transcription-repair coupling factor Mfd  100 
 
 		 1211 aa  2412    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0858576  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1330  transcription-repair coupling factor  37.18 
 
 		 1148 aa  638    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00266348 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0214  transcription-repair coupling factor  38.57 
 
 		 1197 aa  732    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0330142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3547  transcription-repair coupling factor  39.34 
 
 		 1158 aa  710    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0162042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2656  transcription-repair coupling factor  37.36 
 
 		 1207 aa  681    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0357057  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1594  transcription-repair coupling factor  40.8 
 
 		 1131 aa  637    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0052  transcription-repair coupling factor  38.22 
 
 		 1176 aa  719    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4624  transcription-repair coupling factor  56.4 
 
 		 1211 aa  1190    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1292  transcription-repair coupling factor  37.18 
 
 		 1161 aa  663    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0048  transcription-repair coupling factor  37.57 
 
 		 1176 aa  722    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0803  transcription-repair coupling factor  60.67 
 
 		 1188 aa  1282    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0214899 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0081  transcription-repair coupling factor  40.43 
 
 		 1183 aa  764    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000883466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3090  transcription-repair coupling factor  38.19 
 
 		 1174 aa  721    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.192538  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0058  transcription-repair coupling factor  38.09 
 
 		 1176 aa  715    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3926  transcription-repair coupling factor  59.32 
 
 		 1208 aa  1267    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.892466 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5258  transcription-repair coupling factor  37.74 
 
 		 1176 aa  717    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0262  transcription-repair coupling factor  38.05 
 
 		 1179 aa  678    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1948  transcription-repair coupling factor  56.63 
 
 		 1198 aa  1173    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0197  transcription-repair coupling factor  40.48 
 
 		 1157 aa  699    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5656599999999998e-21 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21200  transcription-repair coupling factor  37.95 
 
 		 1170 aa  765    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.010694  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0665  transcription-repair coupling factor  57.98 
 
 		 1187 aa  1250    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2072  transcription-repair coupling factor  41.63 
 
 		 1123 aa  669    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0188  transcription-repair coupling factor  60.82 
 
 		 1182 aa  1353    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1298  transcription-repair coupling factor  57.57 
 
 		 1220 aa  1320    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000122104 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4404  transcription-repair coupling factor  36.35 
 
 		 1166 aa  637    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.353859  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0112  transcription-repair coupling factor  38.66 
 
 		 1179 aa  697    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0059  transcription-repair coupling factor  38.22 
 
 		 1176 aa  717    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0214  transcription-repair coupling factor  40.54 
 
 		 1157 aa  696    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0683043  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1969  transcription-repair coupling factor  37.18 
 
 		 1148 aa  638    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.201191  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11038  transcription-repair coupling factor mfd  52.86 
 
 		 1234 aa  1156    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.970521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1236  transcription-repair coupling factor  37.07 
 
 		 1148 aa  645    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00316475  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4245  transcription-repair coupling factor  56.4 
 
 		 1211 aa  1189    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1067  transcription-repair coupling factor  61.45 
 
 		 1193 aa  1385    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32300  transcription-repair coupling factor Mfd  58.64 
 
 		 1199 aa  1275    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.742659  normal  0.328282 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0072  transcription-repair coupling factor  49.86 
 
 		 1176 aa  687    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0902915  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1478  transcription-repair coupling factor  47.53 
 
 		 1246 aa  657    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.313815 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2807  transcription-repair coupling factor  38.69 
 
 		 1162 aa  781    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2493  transcription-repair coupling factor  38.53 
 
 		 1162 aa  775    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0140  transcription-repair coupling factor  41.31 
 
 		 1159 aa  732    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00133746  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1292  transcription-repair coupling factor  37.09 
 
 		 1148 aa  636    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.208562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3741  transcription-repair coupling factor  41.05 
 
 		 1182 aa  748    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.34254 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1358  transcription-repair coupling factor  37.56 
 
 		 1157 aa  659    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.450147  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2399  transcription-repair coupling factor  36.73 
 
 		 1178 aa  638    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00178528  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0067  transcription-repair coupling factor  36.22 
 
 		 1196 aa  721    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07020  transcription-repair coupling factor Mfd  60.75 
 
 		 1244 aa  1370    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0711584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1315  transcription-repair coupling factor  37.18 
 
 		 1148 aa  638    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000147681 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1013  transcription-repair coupling factor  63.06 
 
 		 1205 aa  1410    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0526678 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0011  transcription-repair coupling factor  36.73 
 
 		 1162 aa  672    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1237  transcription-repair coupling factor  37.07 
 
 		 1148 aa  643    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.792337  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0271  transcription-repair coupling factor  38.95 
 
 		 1165 aa  746    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0399  transcription-repair coupling factor  37.23 
 
 		 1179 aa  649    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0007  transcription-repair coupling factor  37.83 
 
 		 1168 aa  644    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1245  transcription-repair coupling factor  59.3 
 
 		 1222 aa  1312    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.877482  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3479  transcription-repair coupling factor  37.09 
 
 		 1189 aa  648    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.706369  normal  0.219385 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1651  transcription-repair coupling factor  37.53 
 
 		 1198 aa  684    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0949353  normal  0.53283 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05560  transcription-repair coupling factor Mfd  56.83 
 
 		 1218 aa  1207    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1913  transcription-repair coupling factor  54.44 
 
 		 1192 aa  1147    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0499  transcription-repair coupling factor  39.82 
 
 		 1177 aa  706    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.245405  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0111  transcription-repair coupling factor  40.81 
 
 		 1169 aa  782    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00148726  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0924  transcription-repair coupling factor  58.39 
 
 		 1224 aa  1300    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.410165  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1511  transcription-repair coupling factor  33.63 
 
 		 1059 aa  638    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4331  transcription-repair coupling factor  56.4 
 
 		 1211 aa  1189    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.376638 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2550  transcription-repair coupling factor  36.76 
 
 		 1161 aa  637    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.277957  normal  0.0823791 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4777  transcription-repair coupling factor  56.87 
 
 		 1212 aa  1188    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.549284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1933  transcription-repair coupling factor  37.82 
 
 		 1173 aa  642    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.436616  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>