More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1758 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_1758  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  100 
 
 		 923 aa  1862    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0298982  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1408  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.45 
 
 		 974 aa  687    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1344  transcription-repair coupling factor  47.86 
 
 		 893 aa  782    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000252576  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1342  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.64 
 
 		 893 aa  779    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0160807  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1855  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  56.09 
 
 		 901 aa  1039    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0182  transcription-repair coupling factor  45.6 
 
 		 1183 aa  550  1e-155  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1827  transcription-repair coupling factor  42.52 
 
 		 1169 aa  546  1e-154  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1176  transcription-repair coupling factor  42.59 
 
 		 1192 aa  547  1e-154  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.141232  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1355  transcription-repair coupling factor  45.66 
 
 		 1150 aa  549  1e-154  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2767  transcription-repair coupling factor  44.05 
 
 		 1188 aa  538  1e-151  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09271  transcriptional-repair coupling factor  40.5 
 
 		 1169 aa  533  1e-150  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.254503  hitchhiker  0.0000230767 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1326  transcription-repair coupling factor  43.22 
 
 		 1153 aa  533  1e-150  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0638  transcription-repair coupling factor  45.92 
 
 		 1141 aa  535  1e-150  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.138681  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10511  transcriptional-repair coupling factor  43.13 
 
 		 1167 aa  529  1e-149  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605187 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0593  transcription-repair coupling factor  44.79 
 
 		 1165 aa  529  1e-148  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0369  transcriptional-repair coupling factor  42.97 
 
 		 1167 aa  529  1e-148  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4404  transcription-repair coupling factor  43.72 
 
 		 1166 aa  529  1e-148  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.353859  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3738  transcription-repair coupling factor  43.41 
 
 		 1168 aa  526  1e-148  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2493  transcription-repair coupling factor  45.18 
 
 		 1162 aa  526  1e-148  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1300  transcription-repair coupling factor  43.85 
 
 		 1192 aa  525  1e-147  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2632  transcription-repair coupling factor  42.64 
 
 		 1178 aa  526  1e-147  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2807  transcription-repair coupling factor  44.84 
 
 		 1162 aa  523  1e-147  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1287  transcription-repair coupling factor  43.68 
 
 		 1155 aa  522  1e-146  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0502901  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21200  transcription-repair coupling factor  44.69 
 
 		 1170 aa  520  1e-146  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.010694  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14371  transcriptional-repair coupling factor  41.48 
 
 		 1193 aa  516  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3660  transcription-repair coupling factor  41.19 
 
 		 1265 aa  517  1.0000000000000001e-145  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.593932 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1478  transcription-repair coupling factor  41.35 
 
 		 1246 aa  517  1.0000000000000001e-145  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.313815 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0050  transcription-repair coupling factor  40.4 
 
 		 1177 aa  513  1e-144  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1064  transcription-repair coupling factor (superfamily II helicase)  43.09 
 
 		 1154 aa  513  1e-144  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.566316  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10301  transcriptional-repair coupling factor  39.56 
 
 		 1170 aa  514  1e-144  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0909  transcription-repair coupling factor  44.56 
 
 		 1054 aa  514  1e-144  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1671  transcription-repair coupling factor  41.4 
 
 		 1180 aa  515  1e-144  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0059  transcription-repair coupling factor  43.67 
 
 		 1176 aa  510  1e-143  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0051  transcription-repair coupling factor  43.67 
 
 		 1176 aa  511  1e-143  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0052  transcription-repair coupling factor  43.67 
 
 		 1176 aa  510  1e-143  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0048  transcription-repair coupling factor  43.67 
 
 		 1178 aa  510  1e-143  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0048  transcription-repair coupling factor  43.67 
 
 		 1176 aa  511  1e-143  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0058  transcription-repair coupling factor  44.02 
 
 		 1176 aa  511  1e-143  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0062  transcription-repair coupling factor  43.67 
 
 		 1176 aa  511  1e-143  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0052  transcription-repair coupling factor  43.67 
 
 		 1176 aa  510  1e-143  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0048  transcription-repair coupling factor  42.44 
 
 		 1177 aa  511  1e-143  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1092  transcription-repair coupling factor  43.41 
 
 		 1148 aa  511  1e-143  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5258  transcription-repair coupling factor  43.85 
 
 		 1176 aa  509  1e-143  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1705  transcription-repair coupling factor  42.21 
 
 		 1174 aa  512  1e-143  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0111  transcription-repair coupling factor  42.51 
 
 		 1169 aa  510  1e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00148726  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0140  transcription-repair coupling factor  43.37 
 
 		 1159 aa  510  1e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00133746  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0048  transcription-repair coupling factor  43.33 
 
 		 1176 aa  511  1e-143  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4549  transcription-repair coupling factor  43.22 
 
 		 1182 aa  512  1e-143  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.191603 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1161  transcription-repair coupling factor  38.39 
 
 		 1143 aa  510  1e-143  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0073  transcription-repair coupling factor  45.13 
 
 		 1073 aa  510  1e-143  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2656  transcription-repair coupling factor  40.21 
 
 		 1207 aa  506  9.999999999999999e-143  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0357057  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1511  transcription-repair coupling factor  42.76 
 
 		 1059 aa  506  9.999999999999999e-143  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10301  transcriptional-repair coupling factor  39.25 
 
 		 1169 aa  508  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0011  transcription-repair coupling factor  44.65 
 
 		 1162 aa  508  9.999999999999999e-143  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0197  transcription-repair coupling factor  42.06 
 
 		 1157 aa  504  1e-141  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5656599999999998e-21 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0214  transcription-repair coupling factor  42.06 
 
 		 1157 aa  505  1e-141  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0683043  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0961  transcriptional-repair coupling factor  39.5 
 
 		 1174 aa  503  1e-141  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.489301  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0081  transcription-repair coupling factor  42.76 
 
 		 1183 aa  503  1e-141  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000883466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1292  transcription-repair coupling factor  40.62 
 
 		 1161 aa  503  1e-141  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0048  transcription-repair coupling factor  43.33 
 
 		 1176 aa  504  1e-141  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0271  transcription-repair coupling factor  43.22 
 
 		 1165 aa  504  1e-141  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4312  transcription-repair coupling factor  40.69 
 
 		 1158 aa  505  1e-141  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4373  transcription-repair coupling factor  40.69 
 
 		 1158 aa  504  1e-141  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.456695  hitchhiker  0.00000184147 
 
 
-
 
NC_002936  DET1281  transcription-repair coupling factor  42.6 
 
 		 1148 aa  499  1e-140  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2012  transcription-repair coupling factor  43.18 
 
 		 1148 aa  500  1e-140  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00267728 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0091  transcription-repair coupling factor  43.23 
 
 		 1161 aa  502  1e-140  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3741  transcription-repair coupling factor  42.31 
 
 		 1182 aa  501  1e-140  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.34254 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0214  transcription-repair coupling factor  43.46 
 
 		 1197 aa  502  1e-140  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0330142  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01110  transcription-repair coupling factor  42.86 
 
 		 1148 aa  496  1e-139  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.358379  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2533  transcription-repair coupling factor  42.86 
 
 		 1164 aa  498  1e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00875995  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2139  transcription-repair coupling factor  42.23 
 
 		 1207 aa  496  1e-139  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.84833  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1494  transcription-repair coupling factor  43.02 
 
 		 1148 aa  498  1e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.44461  normal  0.168665 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1513  transcription-repair coupling factor  40.95 
 
 		 1174 aa  496  1e-139  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.696907  normal  0.0197286 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3547  transcription-repair coupling factor  41.57 
 
 		 1158 aa  497  1e-139  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0162042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2487  transcription-repair coupling factor  42.86 
 
 		 1164 aa  498  1e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0203456  hitchhiker  0.00300257 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0620  transcription-repair coupling factor  41.68 
 
 		 1244 aa  496  1e-139  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1691  transcription-repair coupling factor  40.09 
 
 		 1153 aa  498  1e-139  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.427142  normal  0.0220248 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1237  transcription-repair coupling factor  42.86 
 
 		 1148 aa  497  1e-139  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.792337  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0262  transcription-repair coupling factor  43.29 
 
 		 1179 aa  496  1e-139  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01118  hypothetical protein  42.86 
 
 		 1148 aa  496  1e-139  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.451631  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0499  transcription-repair coupling factor  42.06 
 
 		 1177 aa  498  1e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.245405  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0657  transcription-repair coupling factor  40.12 
 
 		 1202 aa  498  1e-139  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2209  transcription-repair coupling factor  42.86 
 
 		 1148 aa  497  1e-139  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.872306  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1864  transcription-repair coupling factor  42.39 
 
 		 1147 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0555269  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0124  transcription-repair coupling factor  41.13 
 
 		 1147 aa  493  9.999999999999999e-139  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00760781  normal  0.18165 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1236  transcription-repair coupling factor  42.86 
 
 		 1148 aa  495  9.999999999999999e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00316475  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0399  transcription-repair coupling factor  42.14 
 
 		 1179 aa  495  9.999999999999999e-139  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1072  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.16 
 
 		 994 aa  492  1e-137  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1330  transcription-repair coupling factor  42.53 
 
 		 1148 aa  491  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00266348 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0131  transcription-repair coupling factor  43.81 
 
 		 1197 aa  491  1e-137  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.10317  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3090  transcription-repair coupling factor  39.26 
 
 		 1174 aa  489  1e-137  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.192538  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1292  transcription-repair coupling factor  42.53 
 
 		 1148 aa  491  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.208562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0700  transcription-repair coupling factor  40.98 
 
 		 1165 aa  492  1e-137  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00154056  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1315  transcription-repair coupling factor  42.53 
 
 		 1148 aa  491  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000147681 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1969  transcription-repair coupling factor  42.53 
 
 		 1148 aa  491  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.201191  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2153  transcription-repair coupling factor  42.53 
 
 		 1148 aa  491  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.164525  hitchhiker  0.0000432293 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1298  transcription-repair coupling factor  41.2 
 
 		 1220 aa  491  1e-137  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000122104 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1245  transcription-repair coupling factor  40.75 
 
 		 1222 aa  490  1e-137  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.877482  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3479  transcription-repair coupling factor  42.1 
 
 		 1189 aa  490  1e-137  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.706369  normal  0.219385 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2072  transcription-repair coupling factor  43.24 
 
 		 1123 aa  490  1e-137  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>