More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1408 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_1408  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  100 
 
 		 974 aa  1957    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1342  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.2 
 
 		 893 aa  708    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0160807  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1758  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.45 
 
 		 923 aa  687    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0298982  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1855  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.86 
 
 		 901 aa  704    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1344  transcription-repair coupling factor  40.98 
 
 		 893 aa  706    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000252576  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1511  transcription-repair coupling factor  37.69 
 
 		 1059 aa  607  9.999999999999999e-173  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2493  transcription-repair coupling factor  44.82 
 
 		 1162 aa  546  1e-154  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0112  transcription-repair coupling factor  43.35 
 
 		 1179 aa  547  1e-154  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0638  transcription-repair coupling factor  45.95 
 
 		 1141 aa  548  1e-154  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.138681  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2807  transcription-repair coupling factor  44.5 
 
 		 1162 aa  543  1e-153  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1355  transcription-repair coupling factor  43.74 
 
 		 1150 aa  541  9.999999999999999e-153  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0182  transcription-repair coupling factor  43.3 
 
 		 1183 aa  542  9.999999999999999e-153  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0067  transcription-repair coupling factor  41.7 
 
 		 1196 aa  538  1e-151  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21200  transcription-repair coupling factor  42.13 
 
 		 1170 aa  533  1e-150  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.010694  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1246  transcription-repair coupling factor  42.79 
 
 		 1157 aa  530  1e-149  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.545868  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4549  transcription-repair coupling factor  42.19 
 
 		 1182 aa  530  1e-149  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.191603 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2632  transcription-repair coupling factor  41.74 
 
 		 1178 aa  531  1e-149  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0050  transcription-repair coupling factor  43.13 
 
 		 1177 aa  531  1e-149  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1299  transcription-repair coupling factor  43.29 
 
 		 1157 aa  530  1e-149  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1478  transcription-repair coupling factor  38.93 
 
 		 1246 aa  529  1e-148  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.313815 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2656  transcription-repair coupling factor  38.51 
 
 		 1207 aa  528  1e-148  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0357057  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0073  transcription-repair coupling factor  44.79 
 
 		 1073 aa  526  1e-148  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3660  transcription-repair coupling factor  40 
 
 		 1265 aa  526  1e-148  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.593932 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0048  transcription-repair coupling factor  42.81 
 
 		 1177 aa  525  1e-147  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3090  transcription-repair coupling factor  41.94 
 
 		 1174 aa  524  1e-147  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.192538  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3728  transcription-repair coupling factor  31.99 
 
 		 1103 aa  524  1e-147  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0214  transcription-repair coupling factor  40.9 
 
 		 1157 aa  523  1e-147  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0683043  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0048  transcription-repair coupling factor  40.66 
 
 		 1176 aa  523  1e-147  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0197  transcription-repair coupling factor  40.9 
 
 		 1157 aa  522  1e-146  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5656599999999998e-21 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0593  transcription-repair coupling factor  42.18 
 
 		 1165 aa  520  1e-146  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0111  transcription-repair coupling factor  42.41 
 
 		 1169 aa  521  1e-146  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00148726  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0081  transcription-repair coupling factor  41.45 
 
 		 1183 aa  522  1e-146  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000883466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0011  transcription-repair coupling factor  40.2 
 
 		 1162 aa  521  1e-146  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0657  transcription-repair coupling factor  40.36 
 
 		 1202 aa  519  1.0000000000000001e-145  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0162  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.99 
 
 		 1044 aa  519  1.0000000000000001e-145  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1874  transcription-repair coupling factor  42.46 
 
 		 1160 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.157118  normal  0.0187303 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0058  transcription-repair coupling factor  40.66 
 
 		 1176 aa  518  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2313  transcription-repair coupling factor  42.46 
 
 		 1160 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.141111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0140  transcription-repair coupling factor  41.27 
 
 		 1159 aa  519  1.0000000000000001e-145  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00133746  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0262  transcription-repair coupling factor  42.01 
 
 		 1179 aa  516  1.0000000000000001e-145  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1327  transcription-repair coupling factor  41.85 
 
 		 1156 aa  513  1e-144  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.241535  hitchhiker  0.000253034 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1968  transcription-repair coupling factor  42.01 
 
 		 1156 aa  513  1e-144  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.095546 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1864  transcription-repair coupling factor  42.04 
 
 		 1147 aa  513  1e-144  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0555269  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0051  transcription-repair coupling factor  42.08 
 
 		 1176 aa  513  1e-144  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0052  transcription-repair coupling factor  42.08 
 
 		 1176 aa  514  1e-144  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0048  transcription-repair coupling factor  42.08 
 
 		 1178 aa  514  1e-144  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0048  transcription-repair coupling factor  42.08 
 
 		 1176 aa  514  1e-144  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1360  transcription-repair coupling factor  42.01 
 
 		 1150 aa  514  1e-144  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5255  transcription-repair coupling factor  42.01 
 
 		 1156 aa  514  1e-144  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0305001  normal  0.983896 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0052  transcription-repair coupling factor  42.08 
 
 		 1176 aa  514  1e-144  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5258  transcription-repair coupling factor  40.21 
 
 		 1176 aa  514  1e-144  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0059  transcription-repair coupling factor  42.08 
 
 		 1176 aa  514  1e-144  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6135  transcription-repair coupling factor  42.01 
 
 		 1156 aa  514  1e-144  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.352842  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0399  transcription-repair coupling factor  41.68 
 
 		 1179 aa  513  1e-144  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1944  transcription-repair coupling factor  42.01 
 
 		 1156 aa  514  1e-144  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0062  transcription-repair coupling factor  42.08 
 
 		 1176 aa  513  1e-144  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0997  transcription-repair coupling factor  42.14 
 
 		 1164 aa  511  1e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02437  transcription-repair coupling factor  41.99 
 
 		 1165 aa  512  1e-143  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.272439  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0141  transcription-repair coupling factor  41.67 
 
 		 1169 aa  510  1e-143  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1016  transcription-repair coupling factor  43.73 
 
 		 1153 aa  511  1e-143  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0983  transcription-repair coupling factor  43.56 
 
 		 1153 aa  510  1e-143  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0538  transcription-repair coupling factor  42.49 
 
 		 1168 aa  510  1e-143  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1642  transcription-repair coupling factor  40.25 
 
 		 1158 aa  512  1e-143  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0525  transcription-repair coupling factor  42.49 
 
 		 1168 aa  510  1e-143  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0048  transcription-repair coupling factor  40.81 
 
 		 1176 aa  511  1e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2072  transcription-repair coupling factor  42.62 
 
 		 1123 aa  512  1e-143  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1201  transcription-repair coupling factor  40.72 
 
 		 1154 aa  510  1e-143  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.656597  normal  0.0999319 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1932  transcription-repair coupling factor  41.85 
 
 		 1185 aa  511  1e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1859  transcription-repair coupling factor  41.85 
 
 		 1156 aa  510  1e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0201793  hitchhiker  0.000194707 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2402  transcription-repair coupling factor  41.53 
 
 		 1189 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1642  transcription-repair coupling factor protein  41.17 
 
 		 1157 aa  509  9.999999999999999e-143  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.250538 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0072  transcription-repair coupling factor  41.68 
 
 		 1176 aa  506  9.999999999999999e-143  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0902915  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1491  transcription-repair coupling factor  41.69 
 
 		 1157 aa  509  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1292  transcription-repair coupling factor  40.53 
 
 		 1161 aa  508  9.999999999999999e-143  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0131  transcription-repair coupling factor  42.93 
 
 		 1197 aa  509  9.999999999999999e-143  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.10317  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2513  transcription-repair coupling factor  41.53 
 
 		 1189 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3318  transcription-repair coupling factor  41.69 
 
 		 1189 aa  509  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.101121  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1988  transcription-repair coupling factor  41.69 
 
 		 1157 aa  509  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.232338  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3547  transcription-repair coupling factor  42.69 
 
 		 1158 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0162042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2088  transcription-repair coupling factor  41.53 
 
 		 1217 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1955  transcription-repair coupling factor  41.53 
 
 		 1150 aa  508  9.999999999999999e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0130326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1260  transcription-repair coupling factor  41.69 
 
 		 1189 aa  509  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.148669  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0183  transcription-repair coupling factor  39.67 
 
 		 1188 aa  507  9.999999999999999e-143  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5241  transcription-repair coupling factor  41.15 
 
 		 1112 aa  506  9.999999999999999e-143  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0007  transcription-repair coupling factor  40.94 
 
 		 1168 aa  509  9.999999999999999e-143  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2359  transcription-repair coupling factor  41.53 
 
 		 1189 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.741078  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2139  transcription-repair coupling factor  40.96 
 
 		 1207 aa  503  1e-141  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.84833  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1476  transcription-repair coupling factor  41.05 
 
 		 1155 aa  504  1e-141  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0179996  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1575  transcription-repair coupling factor  41.33 
 
 		 1143 aa  503  1e-141  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.221185  normal  0.0233451 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1894  transcription-repair coupling factor  32.34 
 
 		 1109 aa  504  1e-141  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.377763  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1904  transcription-repair coupling factor  41.33 
 
 		 1143 aa  503  1e-141  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.288854 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1064  transcription-repair coupling factor (superfamily II helicase)  41.38 
 
 		 1154 aa  503  1e-141  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.566316  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3741  transcription-repair coupling factor  39.2 
 
 		 1182 aa  505  1e-141  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.34254 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0620  transcription-repair coupling factor  42.83 
 
 		 1244 aa  503  1e-141  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3479  transcription-repair coupling factor  39.73 
 
 		 1189 aa  503  1e-141  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.706369  normal  0.219385 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0499  transcription-repair coupling factor  40.19 
 
 		 1177 aa  505  1e-141  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.245405  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1287  transcription-repair coupling factor  42.02 
 
 		 1155 aa  500  1e-140  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0502901  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1636  transcription-repair coupling factor  41.38 
 
 		 1271 aa  502  1e-140  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000538763  hitchhiker  0.00597332 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2101  transcription-repair coupling factor  40.38 
 
 		 1150 aa  501  1e-140  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.325386  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1257  transcription-repair coupling factor  41.27 
 
 		 1147 aa  501  1e-140  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.230651  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>