More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0162 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010644  Emin_0162  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  100 
 
 		 1044 aa  2149    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21200  transcription-repair coupling factor  44.86 
 
 		 1170 aa  602  1e-170  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.010694  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2632  transcription-repair coupling factor  42.66 
 
 		 1178 aa  597  1e-169  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0182  transcription-repair coupling factor  44 
 
 		 1183 aa  587  1e-166  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0073  transcription-repair coupling factor  35.26 
 
 		 1073 aa  586  1e-166  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3728  transcription-repair coupling factor  35.31 
 
 		 1103 aa  583  1.0000000000000001e-165  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1511  transcription-repair coupling factor  35.17 
 
 		 1059 aa  579  1e-164  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0048  transcription-repair coupling factor  39.89 
 
 		 1176 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0111  transcription-repair coupling factor  43.42 
 
 		 1169 aa  578  1.0000000000000001e-163  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00148726  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0214  transcription-repair coupling factor  43.55 
 
 		 1197 aa  570  1e-161  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0330142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0081  transcription-repair coupling factor  40.92 
 
 		 1183 aa  570  1e-161  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000883466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0131  transcription-repair coupling factor  40.83 
 
 		 1197 aa  570  1e-161  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.10317  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0051  transcription-repair coupling factor  39.49 
 
 		 1176 aa  565  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0059  transcription-repair coupling factor  39.49 
 
 		 1176 aa  565  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0052  transcription-repair coupling factor  39.49 
 
 		 1176 aa  565  1.0000000000000001e-159  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0048  transcription-repair coupling factor  39.49 
 
 		 1178 aa  565  1.0000000000000001e-159  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0048  transcription-repair coupling factor  39.49 
 
 		 1176 aa  564  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0593  transcription-repair coupling factor  39.77 
 
 		 1165 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0052  transcription-repair coupling factor  39.49 
 
 		 1176 aa  565  1.0000000000000001e-159  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0112  transcription-repair coupling factor  38.29 
 
 		 1179 aa  565  1.0000000000000001e-159  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0062  transcription-repair coupling factor  39.49 
 
 		 1176 aa  565  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0058  transcription-repair coupling factor  39.49 
 
 		 1176 aa  565  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2072  transcription-repair coupling factor  40.62 
 
 		 1123 aa  564  1.0000000000000001e-159  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5258  transcription-repair coupling factor  39.23 
 
 		 1176 aa  565  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0048  transcription-repair coupling factor  39.1 
 
 		 1176 aa  560  1e-158  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2807  transcription-repair coupling factor  43.88 
 
 		 1162 aa  560  1e-158  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2493  transcription-repair coupling factor  43.88 
 
 		 1162 aa  561  1e-158  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0271  transcription-repair coupling factor  41.88 
 
 		 1165 aa  559  1e-158  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3090  transcription-repair coupling factor  39.33 
 
 		 1174 aa  556  1e-157  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.192538  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4549  transcription-repair coupling factor  38.73 
 
 		 1182 aa  558  1e-157  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.191603 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0050  transcription-repair coupling factor  39.69 
 
 		 1177 aa  555  1e-156  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2754  transcription-repair coupling factor  35.66 
 
 		 1112 aa  553  1e-156  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.502691  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0878  transcription-repair coupling factor  35.87 
 
 		 1127 aa  555  1e-156  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0141  transcription-repair coupling factor  40.67 
 
 		 1169 aa  552  1e-155  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3547  transcription-repair coupling factor  39.21 
 
 		 1158 aa  551  1e-155  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0162042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0525  transcription-repair coupling factor  42.63 
 
 		 1168 aa  550  1e-155  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0538  transcription-repair coupling factor  42.63 
 
 		 1168 aa  550  1e-155  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5514  transcription-repair coupling factor  34.84 
 
 		 1126 aa  551  1e-155  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0638  transcription-repair coupling factor  43.71 
 
 		 1141 aa  549  1e-154  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.138681  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0048  transcription-repair coupling factor  39.3 
 
 		 1177 aa  548  1e-154  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1202  transcription-repair coupling factor  34.61 
 
 		 1121 aa  544  1e-153  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.851406  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0072  transcription-repair coupling factor  40.16 
 
 		 1176 aa  543  1e-153  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0902915  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0140  transcription-repair coupling factor  37.91 
 
 		 1159 aa  544  1e-153  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00133746  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0700  transcription-repair coupling factor  39.42 
 
 		 1165 aa  545  1e-153  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00154056  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0399  transcription-repair coupling factor  41.4 
 
 		 1179 aa  544  1e-153  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0766  transcription-repair coupling factor  36.26 
 
 		 1120 aa  545  1e-153  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3479  transcription-repair coupling factor  39.78 
 
 		 1189 aa  545  1e-153  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.706369  normal  0.219385 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0499  transcription-repair coupling factor  38.29 
 
 		 1177 aa  544  1e-153  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.245405  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0262  transcription-repair coupling factor  41.39 
 
 		 1179 aa  541  9.999999999999999e-153  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0770  transcription-repair coupling factor  34.51 
 
 		 1116 aa  540  9.999999999999999e-153  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1355  transcription-repair coupling factor  43.71 
 
 		 1150 aa  542  9.999999999999999e-153  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3695  transcription-repair coupling factor  34.58 
 
 		 1115 aa  542  9.999999999999999e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0183  transcription-repair coupling factor  40.92 
 
 		 1188 aa  541  9.999999999999999e-153  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0620  transcription-repair coupling factor  43.38 
 
 		 1244 aa  542  9.999999999999999e-153  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0017  transcription-repair coupling factor  42.01 
 
 		 1157 aa  538  1e-151  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0270668  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1642  transcription-repair coupling factor  39.97 
 
 		 1158 aa  538  1e-151  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0067  transcription-repair coupling factor  36.59 
 
 		 1196 aa  537  1e-151  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1201  transcription-repair coupling factor  42.28 
 
 		 1154 aa  533  1e-150  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.656597  normal  0.0999319 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3741  transcription-repair coupling factor  41.76 
 
 		 1182 aa  534  1e-150  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.34254 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1408  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.99 
 
 		 974 aa  533  1e-150  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0630  transcription-repair coupling factor  34.46 
 
 		 1109 aa  533  1e-150  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0011  transcription-repair coupling factor  41.1 
 
 		 1162 aa  535  1e-150  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2147  transcription-repair coupling factor  35.82 
 
 		 1103 aa  530  1e-149  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0022  transcription-repair coupling factor  34.73 
 
 		 1113 aa  530  1e-149  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0272  hypothetical protein  33.6 
 
 		 1123 aa  531  1e-149  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.580517 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0007  transcription-repair coupling factor  41.48 
 
 		 1168 aa  531  1e-149  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5241  transcription-repair coupling factor  34.69 
 
 		 1112 aa  531  1e-149  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0214  transcription-repair coupling factor  38.82 
 
 		 1157 aa  528  1e-148  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0683043  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0197  transcription-repair coupling factor  38.71 
 
 		 1157 aa  526  1e-148  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5656599999999998e-21 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3453  transcription-repair coupling factor  33.33 
 
 		 1122 aa  527  1e-148  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0209077 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1894  transcription-repair coupling factor  31.71 
 
 		 1109 aa  529  1e-148  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.377763  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02437  transcription-repair coupling factor  42.76 
 
 		 1165 aa  526  1e-148  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.272439  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3660  transcription-repair coupling factor  41.07 
 
 		 1265 aa  523  1e-147  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.593932 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0031  transcription-repair coupling factor  41.42 
 
 		 1195 aa  524  1e-147  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02560  transcription-repair coupling factor  33.81 
 
 		 1126 aa  524  1e-147  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0039  transcription-repair coupling factor  41.42 
 
 		 1193 aa  523  1e-147  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2656  transcription-repair coupling factor  38.48 
 
 		 1207 aa  525  1e-147  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0357057  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1478  transcription-repair coupling factor  40.58 
 
 		 1246 aa  525  1e-147  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.313815 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1696  transcription-repair coupling factor  34.72 
 
 		 1107 aa  520  1e-146  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000188307 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04745  transcription-repair coupling factor  41.29 
 
 		 1154 aa  520  1e-146  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.982613  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1882  transcription-repair coupling factor  34.92 
 
 		 1099 aa  521  1e-146  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4478  transcription-repair coupling factor  39.97 
 
 		 1229 aa  520  1e-146  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.419935 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1691  transcription-repair coupling factor  40.17 
 
 		 1153 aa  518  1.0000000000000001e-145  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.427142  normal  0.0220248 
 
 
-
 
NC_002950  PG1774  transcription-repair coupling factor  33.5 
 
 		 1122 aa  517  1.0000000000000001e-145  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1358  transcription-repair coupling factor  41.86 
 
 		 1157 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.450147  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0091  transcription-repair coupling factor  38.18 
 
 		 1161 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2039  transcription-repair coupling factor  39.3 
 
 		 1152 aa  516  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.583772  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1246  transcription-repair coupling factor  40.54 
 
 		 1157 aa  513  1e-144  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.545868  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1864  transcription-repair coupling factor  43.03 
 
 		 1147 aa  516  1e-144  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0555269  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2478  transcription-repair coupling factor  40.67 
 
 		 1150 aa  513  1e-144  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.349906  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1647  transcription-repair coupling factor  40.75 
 
 		 1150 aa  513  1e-144  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1342  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.59 
 
 		 893 aa  515  1e-144  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0160807  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1168  transcription-repair coupling factor  42.5 
 
 		 1159 aa  513  1e-144  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.507558  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1705  transcription-repair coupling factor  36.59 
 
 		 1174 aa  516  1e-144  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0910  transcription-repair coupling factor  41.85 
 
 		 1179 aa  515  1e-144  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1344  transcription-repair coupling factor  35.95 
 
 		 893 aa  514  1e-144  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000252576  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2533  transcription-repair coupling factor  38.45 
 
 		 1164 aa  511  1e-143  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00875995  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1709  transcription-repair coupling factor  42.15 
 
 		 1137 aa  509  1e-143  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.517079  normal  0.0571023 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1567  transcription-repair coupling factor  42.45 
 
 		 1150 aa  511  1e-143  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09151  transcriptional-repair coupling factor  32.99 
 
 		 1175 aa  510  1e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>