More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0878 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_0766  transcription-repair coupling factor  61.33 
 
 		 1120 aa  1386    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1696  transcription-repair coupling factor  61.49 
 
 		 1107 aa  1341    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000188307 
 
 
-
 
NC_002950  PG1774  transcription-repair coupling factor  39.87 
 
 		 1122 aa  725    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2147  transcription-repair coupling factor  70.09 
 
 		 1103 aa  1558    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0630  transcription-repair coupling factor  63.73 
 
 		 1109 aa  1408    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02560  transcription-repair coupling factor  39.54 
 
 		 1126 aa  746    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1882  transcription-repair coupling factor  64.95 
 
 		 1099 aa  1441    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2754  transcription-repair coupling factor  41.96 
 
 		 1112 aa  793    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.502691  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5514  transcription-repair coupling factor  39.55 
 
 		 1126 aa  722    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1202  transcription-repair coupling factor  39.34 
 
 		 1121 aa  744    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.851406  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0409  transcription-repair coupling factor  40.68 
 
 		 1126 aa  725    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21200  transcription-repair coupling factor  40.35 
 
 		 1170 aa  649    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.010694  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0182  transcription-repair coupling factor  43.73 
 
 		 1183 aa  639    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3453  transcription-repair coupling factor  40 
 
 		 1122 aa  741    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0209077 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1511  transcription-repair coupling factor  38.74 
 
 		 1059 aa  653    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3695  transcription-repair coupling factor  40.48 
 
 		 1115 aa  738    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0073  transcription-repair coupling factor  39.55 
 
 		 1073 aa  640    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0022  transcription-repair coupling factor  42.81 
 
 		 1113 aa  723    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0011  transcription-repair coupling factor  37.18 
 
 		 1162 aa  676    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0272  hypothetical protein  43.06 
 
 		 1123 aa  744    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.580517 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0770  transcription-repair coupling factor  68.7 
 
 		 1116 aa  1552    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1894  transcription-repair coupling factor  39.83 
 
 		 1109 aa  746    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.377763  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0878  transcription-repair coupling factor  100 
 
 		 1127 aa  2307    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0048  transcription-repair coupling factor  43.64 
 
 		 1176 aa  635  1e-180  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0051  transcription-repair coupling factor  43.51 
 
 		 1176 aa  630  1e-179  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0052  transcription-repair coupling factor  46.76 
 
 		 1176 aa  629  1e-179  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0048  transcription-repair coupling factor  46.76 
 
 		 1176 aa  629  1e-179  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0052  transcription-repair coupling factor  46.76 
 
 		 1176 aa  629  1e-179  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0062  transcription-repair coupling factor  43.51 
 
 		 1176 aa  630  1e-179  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0059  transcription-repair coupling factor  46.76 
 
 		 1176 aa  629  1e-179  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0058  transcription-repair coupling factor  43.32 
 
 		 1176 aa  628  1e-178  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0048  transcription-repair coupling factor  46.76 
 
 		 1178 aa  629  1e-178  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5258  transcription-repair coupling factor  40.87 
 
 		 1176 aa  628  1e-178  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3728  transcription-repair coupling factor  36.09 
 
 		 1103 aa  628  1e-178  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0399  transcription-repair coupling factor  35.09 
 
 		 1179 aa  626  1e-178  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4549  transcription-repair coupling factor  42.31 
 
 		 1182 aa  625  1e-177  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.191603 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0048  transcription-repair coupling factor  46.77 
 
 		 1176 aa  622  1e-176  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1287  transcription-repair coupling factor  42.07 
 
 		 1155 aa  619  1e-176  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0502901  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1092  transcription-repair coupling factor  35.33 
 
 		 1148 aa  622  1e-176  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0050  transcription-repair coupling factor  44.05 
 
 		 1177 aa  619  1e-176  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0271  transcription-repair coupling factor  42.51 
 
 		 1165 aa  619  1e-176  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3135  transcription-repair coupling factor  37.62 
 
 		 1164 aa  617  1e-175  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.223116  normal  0.109749 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0081  transcription-repair coupling factor  43.17 
 
 		 1183 aa  613  9.999999999999999e-175  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000883466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0214  transcription-repair coupling factor  46.2 
 
 		 1197 aa  615  9.999999999999999e-175  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0330142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3479  transcription-repair coupling factor  35.5 
 
 		 1189 aa  613  9.999999999999999e-175  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.706369  normal  0.219385 
 
 
-
 
NC_002936  DET1281  transcription-repair coupling factor  35.34 
 
 		 1148 aa  611  1e-173  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0112  transcription-repair coupling factor  44.21 
 
 		 1179 aa  610  1e-173  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1064  transcription-repair coupling factor (superfamily II helicase)  34.97 
 
 		 1154 aa  609  1e-173  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.566316  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0007  transcription-repair coupling factor  36.01 
 
 		 1168 aa  612  1e-173  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0067  transcription-repair coupling factor  42.82 
 
 		 1196 aa  609  1e-173  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0141  transcription-repair coupling factor  41.77 
 
 		 1169 aa  608  9.999999999999999e-173  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1478  transcription-repair coupling factor  42.48 
 
 		 1246 aa  606  9.999999999999999e-173  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.313815 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0048  transcription-repair coupling factor  42.31 
 
 		 1177 aa  608  9.999999999999999e-173  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0008  transcription-repair coupling factor  35.52 
 
 		 1165 aa  603  1.0000000000000001e-171  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0131  transcription-repair coupling factor  49.51 
 
 		 1197 aa  604  1.0000000000000001e-171  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.10317  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0593  transcription-repair coupling factor  43.99 
 
 		 1165 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2807  transcription-repair coupling factor  42.13 
 
 		 1162 aa  603  1.0000000000000001e-171  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2493  transcription-repair coupling factor  43.09 
 
 		 1162 aa  603  1.0000000000000001e-171  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0499  transcription-repair coupling factor  44.41 
 
 		 1177 aa  604  1.0000000000000001e-171  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.245405  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3660  transcription-repair coupling factor  45.01 
 
 		 1265 aa  601  1e-170  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.593932 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0262  transcription-repair coupling factor  43.13 
 
 		 1179 aa  599  1e-170  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0111  transcription-repair coupling factor  41.28 
 
 		 1169 aa  600  1e-170  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00148726  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2767  transcription-repair coupling factor  37.42 
 
 		 1188 aa  601  1e-170  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5241  transcription-repair coupling factor  37.75 
 
 		 1112 aa  601  1e-170  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0140  transcription-repair coupling factor  43.13 
 
 		 1159 aa  600  1e-170  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00133746  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1326  transcription-repair coupling factor  36.78 
 
 		 1153 aa  601  1e-170  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0538  transcription-repair coupling factor  41.88 
 
 		 1168 aa  598  1e-169  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0525  transcription-repair coupling factor  41.88 
 
 		 1168 aa  598  1e-169  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3547  transcription-repair coupling factor  42.28 
 
 		 1158 aa  597  1e-169  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0162042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3741  transcription-repair coupling factor  45.27 
 
 		 1182 aa  597  1e-169  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.34254 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1748  transcription-repair coupling factor  36.91 
 
 		 1134 aa  594  1e-168  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.921754  normal  0.10168 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2632  transcription-repair coupling factor  40 
 
 		 1178 aa  591  1e-167  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1016  transcription-repair coupling factor  36.37 
 
 		 1153 aa  590  1e-167  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0983  transcription-repair coupling factor  36.47 
 
 		 1153 aa  589  1e-167  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0700  transcription-repair coupling factor  42.86 
 
 		 1165 aa  592  1e-167  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00154056  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2656  transcription-repair coupling factor  43.46 
 
 		 1207 aa  587  1e-166  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0357057  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0214  transcription-repair coupling factor  44.96 
 
 		 1157 aa  588  1e-166  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0683043  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0638  transcription-repair coupling factor  44.58 
 
 		 1141 aa  587  1e-166  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.138681  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0197  transcription-repair coupling factor  44.96 
 
 		 1157 aa  588  1e-166  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5656599999999998e-21 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0109  transcription-repair coupling factor  34.28 
 
 		 1156 aa  583  1.0000000000000001e-165  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.174112 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3090  transcription-repair coupling factor  45.92 
 
 		 1174 aa  585  1.0000000000000001e-165  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.192538  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2072  transcription-repair coupling factor  45.75 
 
 		 1123 aa  584  1.0000000000000001e-165  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1671  transcription-repair coupling factor  37.15 
 
 		 1180 aa  585  1.0000000000000001e-165  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0072  transcription-repair coupling factor  45.56 
 
 		 1176 aa  585  1.0000000000000001e-165  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0902915  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4404  transcription-repair coupling factor  36.61 
 
 		 1166 aa  586  1.0000000000000001e-165  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.353859  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1355  transcription-repair coupling factor  44.16 
 
 		 1150 aa  580  1e-164  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0091  transcription-repair coupling factor  41.78 
 
 		 1161 aa  580  1e-164  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1674  transcription-repair coupling factor  45.79 
 
 		 1179 aa  581  1e-164  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000415877  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2399  transcription-repair coupling factor  45.25 
 
 		 1178 aa  580  1e-164  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00178528  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0064  transcription-repair coupling factor  45.23 
 
 		 1201 aa  580  1e-164  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.862894  normal  0.0454923 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0017  transcription-repair coupling factor  43.38 
 
 		 1157 aa  576  1.0000000000000001e-163  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0270668  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1201  transcription-repair coupling factor  46.52 
 
 		 1154 aa  578  1.0000000000000001e-163  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.656597  normal  0.0999319 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5808  transcription-repair coupling factor  48.14 
 
 		 1351 aa  578  1.0000000000000001e-163  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.294236  normal  0.50078 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07780  transcription-repair coupling factor Mfd  45.59 
 
 		 1212 aa  579  1.0000000000000001e-163  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.784778  normal  0.111573 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1257  transcription-repair coupling factor  45.31 
 
 		 1147 aa  577  1.0000000000000001e-163  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.230651  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1443  transcription-repair coupling factor  36.3 
 
 		 1165 aa  578  1.0000000000000001e-163  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0802912 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1935  transcription-repair coupling factor  45.12 
 
 		 1216 aa  578  1.0000000000000001e-163  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.671489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0424  transcription-repair coupling factor  41.54 
 
 		 1210 aa  575  1.0000000000000001e-162  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3926  transcription-repair coupling factor  45.28 
 
 		 1208 aa  574  1.0000000000000001e-162  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.892466 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1023  transcription-repair coupling factor  42.18 
 
 		 1168 aa  574  1.0000000000000001e-162  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>