More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_1072 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013522  Taci_1072  DEAD/DEAH box helicase domain protein  100 
 
 		 994 aa  1975    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2754  transcription-repair coupling factor  38.53 
 
 		 1112 aa  549  1e-154  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.502691  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1511  transcription-repair coupling factor  34.8 
 
 		 1059 aa  547  1e-154  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1355  transcription-repair coupling factor  37.72 
 
 		 1150 aa  541  9.999999999999999e-153  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5241  transcription-repair coupling factor  38.34 
 
 		 1112 aa  536  1e-151  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0073  transcription-repair coupling factor  36.41 
 
 		 1073 aa  533  1e-150  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0182  transcription-repair coupling factor  43.87 
 
 		 1183 aa  529  1e-148  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2632  transcription-repair coupling factor  42.34 
 
 		 1178 aa  527  1e-148  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0593  transcription-repair coupling factor  43.46 
 
 		 1165 aa  523  1e-147  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0638  transcription-repair coupling factor  42.12 
 
 		 1141 aa  521  1e-146  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.138681  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5258  transcription-repair coupling factor  41.19 
 
 		 1176 aa  513  1e-144  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0048  transcription-repair coupling factor  41.96 
 
 		 1176 aa  513  1e-144  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0058  transcription-repair coupling factor  41.5 
 
 		 1176 aa  513  1e-144  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0766  transcription-repair coupling factor  35.1 
 
 		 1120 aa  513  1e-144  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21200  transcription-repair coupling factor  41.63 
 
 		 1170 aa  509  1e-143  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.010694  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0062  transcription-repair coupling factor  41.27 
 
 		 1176 aa  512  1e-143  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0051  transcription-repair coupling factor  41.27 
 
 		 1176 aa  512  1e-143  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0052  transcription-repair coupling factor  41.27 
 
 		 1176 aa  511  1e-143  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0048  transcription-repair coupling factor  41.27 
 
 		 1178 aa  511  1e-143  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0048  transcription-repair coupling factor  41.27 
 
 		 1176 aa  512  1e-143  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0052  transcription-repair coupling factor  41.27 
 
 		 1176 aa  511  1e-143  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0048  transcription-repair coupling factor  41.34 
 
 		 1176 aa  509  1e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0059  transcription-repair coupling factor  41.27 
 
 		 1176 aa  512  1e-143  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0271  transcription-repair coupling factor  39.88 
 
 		 1165 aa  512  1e-143  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0214  transcription-repair coupling factor  42.41 
 
 		 1157 aa  510  1e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0683043  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3741  transcription-repair coupling factor  44.79 
 
 		 1182 aa  513  1e-143  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.34254 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0214  transcription-repair coupling factor  42.2 
 
 		 1197 aa  510  1e-143  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0330142  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1287  transcription-repair coupling factor  41.02 
 
 		 1155 aa  508  9.999999999999999e-143  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0502901  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1064  transcription-repair coupling factor (superfamily II helicase)  41.57 
 
 		 1154 aa  507  9.999999999999999e-143  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.566316  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0988  transcription-repair coupling factor  44.25 
 
 		 1146 aa  508  9.999999999999999e-143  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.162068  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0197  transcription-repair coupling factor  42.41 
 
 		 1157 aa  509  9.999999999999999e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5656599999999998e-21 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1260  transcription-repair coupling factor  47.35 
 
 		 1159 aa  507  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.843901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1358  transcription-repair coupling factor  40.32 
 
 		 1157 aa  505  1e-141  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.450147  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0131  transcription-repair coupling factor  40.57 
 
 		 1197 aa  505  1e-141  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.10317  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0657  transcription-repair coupling factor  39.97 
 
 		 1202 aa  505  1e-141  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1092  transcription-repair coupling factor  43.2 
 
 		 1148 aa  505  1e-141  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3090  transcription-repair coupling factor  42.28 
 
 		 1174 aa  503  1e-141  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.192538  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1705  transcription-repair coupling factor  40.15 
 
 		 1174 aa  503  1e-141  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0111  transcription-repair coupling factor  42.36 
 
 		 1169 aa  505  1e-141  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00148726  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1864  transcription-repair coupling factor  43.59 
 
 		 1147 aa  501  1e-140  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0555269  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0048  transcription-repair coupling factor  43.7 
 
 		 1177 aa  500  1e-140  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0050  transcription-repair coupling factor  43.21 
 
 		 1177 aa  501  1e-140  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1642  transcription-repair coupling factor  43.8 
 
 		 1158 aa  499  1e-140  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0696  transcription-repair coupling factor  42 
 
 		 1151 aa  500  1e-140  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.221423  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2833  transcription-repair coupling factor  43.37 
 
 		 1157 aa  500  1e-140  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000601821  hitchhiker  0.00381117 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0011  transcription-repair coupling factor  41.05 
 
 		 1162 aa  500  1e-140  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1774  transcription-repair coupling factor  36.3 
 
 		 1122 aa  499  1e-139  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0803  transcription-repair coupling factor  42.77 
 
 		 1188 aa  497  1e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0214899 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2039  transcription-repair coupling factor  44.46 
 
 		 1152 aa  499  1e-139  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.583772  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1408  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.93 
 
 		 974 aa  497  1e-139  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0909  transcription-repair coupling factor  47.55 
 
 		 1054 aa  498  1e-139  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2807  transcription-repair coupling factor  41.34 
 
 		 1162 aa  497  1e-139  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2493  transcription-repair coupling factor  41.51 
 
 		 1162 aa  498  1e-139  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1281  transcription-repair coupling factor  42.52 
 
 		 1148 aa  495  9.999999999999999e-139  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2139  transcription-repair coupling factor  42.69 
 
 		 1207 aa  495  9.999999999999999e-139  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.84833  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1636  transcription-repair coupling factor  44.07 
 
 		 1271 aa  495  9.999999999999999e-139  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000538763  hitchhiker  0.00597332 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3660  transcription-repair coupling factor  40.96 
 
 		 1265 aa  493  9.999999999999999e-139  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.593932 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0081  transcription-repair coupling factor  43.41 
 
 		 1183 aa  494  9.999999999999999e-139  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000883466  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3728  transcription-repair coupling factor  36.55 
 
 		 1103 aa  494  9.999999999999999e-139  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0072  transcription-repair coupling factor  45.17 
 
 		 1176 aa  495  9.999999999999999e-139  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0902915  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2656  transcription-repair coupling factor  39.49 
 
 		 1207 aa  493  9.999999999999999e-139  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0357057  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3479  transcription-repair coupling factor  40.67 
 
 		 1189 aa  495  9.999999999999999e-139  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.706369  normal  0.219385 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0924  transcription-repair coupling factor  42.57 
 
 		 1224 aa  494  9.999999999999999e-139  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.410165  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0894  transcription-repair coupling factor  44.14 
 
 		 1173 aa  493  1e-137  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.180496  normal  0.440454 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1476  transcription-repair coupling factor  41.18 
 
 		 1155 aa  492  1e-137  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0179996  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0630  transcription-repair coupling factor  36.27 
 
 		 1109 aa  492  1e-137  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1882  transcription-repair coupling factor  34.23 
 
 		 1099 aa  492  1e-137  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1758  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.16 
 
 		 923 aa  492  1e-137  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0298982  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0910  transcription-repair coupling factor  42.6 
 
 		 1179 aa  492  1e-137  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2147  transcription-repair coupling factor  34.87 
 
 		 1103 aa  492  1e-137  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1478  transcription-repair coupling factor  42.7 
 
 		 1246 aa  492  1e-137  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.313815 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1810  transcription-repair coupling factor  41.12 
 
 		 1160 aa  489  1e-137  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.540051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1811  transcription-repair coupling factor  43.03 
 
 		 1157 aa  489  1e-137  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000258386  normal  0.0877788 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0285  transcription-repair coupling factor  45.41 
 
 		 1197 aa  491  1e-137  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.493084 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1651  transcription-repair coupling factor  40.97 
 
 		 1198 aa  492  1e-137  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0949353  normal  0.53283 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0499  transcription-repair coupling factor  41.81 
 
 		 1177 aa  490  1e-137  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.245405  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5514  transcription-repair coupling factor  32.34 
 
 		 1126 aa  488  1e-136  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1647  transcription-repair coupling factor  38.56 
 
 		 1150 aa  487  1e-136  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1543  transcription-repair coupling factor  43.54 
 
 		 1157 aa  488  1e-136  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00144396  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1330  transcription-repair coupling factor  41.59 
 
 		 1148 aa  486  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00266348 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1299  transcription-repair coupling factor  40.68 
 
 		 1157 aa  488  1e-136  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0140  transcription-repair coupling factor  41.38 
 
 		 1159 aa  486  1e-136  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00133746  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0112  transcription-repair coupling factor  40.52 
 
 		 1179 aa  487  1e-136  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0091  transcription-repair coupling factor  44.03 
 
 		 1161 aa  487  1e-136  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2072  transcription-repair coupling factor  43.51 
 
 		 1123 aa  488  1e-136  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1998  transcription-repair coupling factor  38.28 
 
 		 1176 aa  487  1e-136  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0120843 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2786  transcription-repair coupling factor  39.37 
 
 		 1150 aa  489  1e-136  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.974454  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1246  transcription-repair coupling factor  40.68 
 
 		 1157 aa  488  1e-136  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.545868  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1161  transcription-repair coupling factor  41.25 
 
 		 1143 aa  488  1e-136  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1730  transcription-repair coupling factor  41.12 
 
 		 1160 aa  487  1e-136  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00119053  normal  0.38574 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1195  transcription-repair coupling factor  43.5 
 
 		 1157 aa  488  1e-136  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.865219  normal  0.466133 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0183  transcription-repair coupling factor  40.47 
 
 		 1188 aa  487  1e-136  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0399  transcription-repair coupling factor  40.74 
 
 		 1179 aa  486  1e-136  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0007  transcription-repair coupling factor  39.52 
 
 		 1168 aa  488  1e-136  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2289  transcription-repair coupling factor  41.28 
 
 		 1160 aa  487  1e-136  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00423432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1315  transcription-repair coupling factor  41.59 
 
 		 1148 aa  486  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000147681 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1969  transcription-repair coupling factor  41.59 
 
 		 1148 aa  486  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.201191  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02437  transcription-repair coupling factor  41.68 
 
 		 1165 aa  487  1e-136  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.272439  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2153  transcription-repair coupling factor  41.78 
 
 		 1148 aa  486  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.164525  hitchhiker  0.0000432293 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1598  transcription-repair coupling factor  38.1 
 
 		 1148 aa  484  1e-135  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000129728  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>