More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0988 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1691  transcription-repair coupling factor  53.32 
 
 		 1153 aa  1201    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.427142  normal  0.0220248 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0058  transcription-repair coupling factor  37.18 
 
 		 1176 aa  652    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0051  transcription-repair coupling factor  37.52 
 
 		 1176 aa  658    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2072  transcription-repair coupling factor  39.98 
 
 		 1123 aa  645    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0525  transcription-repair coupling factor  37.3 
 
 		 1168 aa  648    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0910  transcription-repair coupling factor  50.18 
 
 		 1179 aa  1044    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0052  transcription-repair coupling factor  37.49 
 
 		 1176 aa  659    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0048  transcription-repair coupling factor  37.43 
 
 		 1178 aa  657    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0048  transcription-repair coupling factor  37.43 
 
 		 1176 aa  658    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0140  transcription-repair coupling factor  41.22 
 
 		 1159 aa  708    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00133746  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0111  transcription-repair coupling factor  36.11 
 
 		 1169 aa  651    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00148726  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21200  transcription-repair coupling factor  35.48 
 
 		 1170 aa  651    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.010694  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2632  transcription-repair coupling factor  36.36 
 
 		 1178 aa  658    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0197  transcription-repair coupling factor  39.39 
 
 		 1157 aa  707    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5656599999999998e-21 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0700  transcription-repair coupling factor  39.07 
 
 		 1165 aa  721    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00154056  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0091  transcription-repair coupling factor  40.33 
 
 		 1161 aa  695    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0062  transcription-repair coupling factor  37.52 
 
 		 1176 aa  658    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0538  transcription-repair coupling factor  37.3 
 
 		 1168 aa  648    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0048  transcription-repair coupling factor  38.05 
 
 		 1176 aa  656    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3547  transcription-repair coupling factor  38.4 
 
 		 1158 aa  694    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0162042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2039  transcription-repair coupling factor  53.76 
 
 		 1152 aa  1208    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.583772  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0052  transcription-repair coupling factor  37.49 
 
 		 1176 aa  659    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0593  transcription-repair coupling factor  35.34 
 
 		 1165 aa  663    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0081  transcription-repair coupling factor  38.27 
 
 		 1183 aa  665    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000883466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0048  transcription-repair coupling factor  37.2 
 
 		 1177 aa  636    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0638  transcription-repair coupling factor  36.95 
 
 		 1141 aa  640    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.138681  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1260  transcription-repair coupling factor  52.41 
 
 		 1159 aa  1139    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.843901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0285  transcription-repair coupling factor  52.09 
 
 		 1197 aa  1120    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.493084 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0050  transcription-repair coupling factor  37.83 
 
 		 1177 aa  643    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0214  transcription-repair coupling factor  39.06 
 
 		 1157 aa  707    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0683043  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0988  transcription-repair coupling factor  100 
 
 		 1146 aa  2331    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.162068  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5258  transcription-repair coupling factor  37.59 
 
 		 1176 aa  654    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1355  transcription-repair coupling factor  41.01 
 
 		 1150 aa  652    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0059  transcription-repair coupling factor  37.52 
 
 		 1176 aa  658    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3479  transcription-repair coupling factor  37.96 
 
 		 1189 aa  730    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.706369  normal  0.219385 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1651  transcription-repair coupling factor  36.8 
 
 		 1198 aa  646    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0949353  normal  0.53283 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0048  transcription-repair coupling factor  36.9 
 
 		 1176 aa  649    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0499  transcription-repair coupling factor  40.4 
 
 		 1177 aa  726    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.245405  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1299  transcription-repair coupling factor  36.08 
 
 		 1157 aa  634  1e-180  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2833  transcription-repair coupling factor  34.72 
 
 		 1157 aa  632  1e-179  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000601821  hitchhiker  0.00381117 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2493  transcription-repair coupling factor  36.17 
 
 		 1162 aa  631  1e-179  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1287  transcription-repair coupling factor  35.31 
 
 		 1155 aa  628  1e-178  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0502901  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02437  transcription-repair coupling factor  35.26 
 
 		 1165 aa  627  1e-178  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.272439  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1246  transcription-repair coupling factor  35.8 
 
 		 1157 aa  624  1e-177  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.545868  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0112  transcription-repair coupling factor  37.27 
 
 		 1179 aa  625  1e-177  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2754  transcription-repair coupling factor  37.3 
 
 		 1112 aa  624  1e-177  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.502691  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0011  transcription-repair coupling factor  35.69 
 
 		 1162 aa  625  1e-177  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1630  transcription-repair coupling factor  35.92 
 
 		 1160 aa  624  1e-177  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00676636  normal  0.517783 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1092  transcription-repair coupling factor  37.82 
 
 		 1148 aa  621  1e-176  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0067  transcription-repair coupling factor  35.57 
 
 		 1196 aa  619  1e-176  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2478  transcription-repair coupling factor  35.25 
 
 		 1150 aa  621  1e-176  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.349906  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2807  transcription-repair coupling factor  35.88 
 
 		 1162 aa  622  1e-176  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2399  transcription-repair coupling factor  33.93 
 
 		 1178 aa  619  1e-176  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00178528  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1330  transcription-repair coupling factor  35.63 
 
 		 1155 aa  622  1e-176  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.643209  normal  0.63963 
 
 
-
 
NC_002936  DET1281  transcription-repair coupling factor  38.63 
 
 		 1148 aa  616  1e-175  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1998  transcription-repair coupling factor  35.06 
 
 		 1176 aa  618  1e-175  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0120843 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0696  transcription-repair coupling factor  35.71 
 
 		 1151 aa  619  1e-175  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.221423  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0017  transcription-repair coupling factor  44.59 
 
 		 1157 aa  615  9.999999999999999e-175  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0270668  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0262  transcription-repair coupling factor  36.32 
 
 		 1179 aa  613  9.999999999999999e-175  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2786  transcription-repair coupling factor  35.02 
 
 		 1150 aa  615  9.999999999999999e-175  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.974454  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1674  transcription-repair coupling factor  33.25 
 
 		 1179 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000415877  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1647  transcription-repair coupling factor  34.25 
 
 		 1150 aa  615  9.999999999999999e-175  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3090  transcription-repair coupling factor  33.96 
 
 		 1174 aa  614  9.999999999999999e-175  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.192538  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2864  transcription-repair coupling factor  34.71 
 
 		 1148 aa  612  1e-173  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0829666  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0141  transcription-repair coupling factor  45.26 
 
 		 1169 aa  610  1e-173  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1598  transcription-repair coupling factor  34.63 
 
 		 1148 aa  611  1e-173  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000129728  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1978  transcription-repair coupling factor  36.24 
 
 		 1159 aa  609  1e-173  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4331  transcription-repair coupling factor  37.76 
 
 		 1211 aa  612  1e-173  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.376638 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1705  transcription-repair coupling factor  44.08 
 
 		 1174 aa  610  1e-173  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4245  transcription-repair coupling factor  37.76 
 
 		 1211 aa  612  1e-173  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4624  transcription-repair coupling factor  37.76 
 
 		 1211 aa  612  1e-173  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1706  transcription-repair coupling factor  34.54 
 
 		 1148 aa  609  1e-173  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.43136  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0182  transcription-repair coupling factor  42.72 
 
 		 1183 aa  608  9.999999999999999e-173  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3738  transcription-repair coupling factor  34.94 
 
 		 1168 aa  608  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1476  transcription-repair coupling factor  35.44 
 
 		 1155 aa  609  9.999999999999999e-173  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0179996  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1796  transcription-repair coupling protein Mfd  34.21 
 
 		 1153 aa  608  9.999999999999999e-173  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.46752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2395  transcription-repair coupling factor  35.64 
 
 		 1162 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000829473  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0214  transcription-repair coupling factor  45.68 
 
 		 1197 aa  608  9.999999999999999e-173  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0330142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0271  transcription-repair coupling factor  45.45 
 
 		 1165 aa  609  9.999999999999999e-173  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4312  transcription-repair coupling factor  35.55 
 
 		 1158 aa  603  1.0000000000000001e-171  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4777  transcription-repair coupling factor  36.23 
 
 		 1212 aa  605  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.549284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1168  transcription-repair coupling factor  34.51 
 
 		 1159 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.507558  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1933  transcription-repair coupling factor  36.58 
 
 		 1173 aa  605  1.0000000000000001e-171  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.436616  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0803  transcription-repair coupling factor  38.7 
 
 		 1188 aa  603  1.0000000000000001e-171  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0214899 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1725  transcription-repair coupling factor  34.12 
 
 		 1160 aa  605  1.0000000000000001e-171  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1629  transcription-repair coupling factor  33.81 
 
 		 1148 aa  602  1e-170  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.027535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1326  transcription-repair coupling factor  36.26 
 
 		 1153 aa  602  1e-170  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2157  transcription-repair coupling factor  36.57 
 
 		 1148 aa  602  1e-170  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1161  transcription-repair coupling factor  35.52 
 
 		 1143 aa  600  1e-170  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1948  transcription-repair coupling factor  36.98 
 
 		 1198 aa  601  1e-170  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25230  transcription-repair coupling factor  36.21 
 
 		 1148 aa  601  1e-170  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0399  transcription-repair coupling factor  36.2 
 
 		 1179 aa  602  1e-170  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4373  transcription-repair coupling factor  35.55 
 
 		 1158 aa  602  1e-170  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.456695  hitchhiker  0.00000184147 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2313  transcription-repair coupling factor  36.73 
 
 		 1160 aa  597  1e-169  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.141111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1292  transcription-repair coupling factor  37.62 
 
 		 1161 aa  598  1e-169  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3728  transcription-repair coupling factor  36.28 
 
 		 1103 aa  598  1e-169  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1016  transcription-repair coupling factor  34.19 
 
 		 1153 aa  593  1e-168  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1195  transcription-repair coupling factor  35.97 
 
 		 1157 aa  595  1e-168  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.865219  normal  0.466133 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3189  transcription-repair coupling factor  36.08 
 
 		 1218 aa  593  1e-168  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.905154  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2406  transcription-repair coupling factor  35.5 
 
 		 1162 aa  594  1e-168  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00482386  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>