21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1220 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_1220  putative secreted protein  100 
 
 		 387 aa  791    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.789164  normal  0.0187345 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04779  hypothetical protein  69.76 
 
 		 259 aa  349  4e-95  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0974  hypothetical protein  27.37 
 
 		 189 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10680  hypothetical protein  28.49 
 
 		 189 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1526  periplasmic protein-like protein  30.38 
 
 		 185 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0352336  normal  0.908264 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3251  hypothetical protein  27.75 
 
 		 278 aa  60.8  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2425  hypothetical protein  27.85 
 
 		 263 aa  59.3  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.524808  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04778  hypothetical protein  83.33 
 
 		 93 aa  58.5  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3898  hypothetical protein  29.49 
 
 		 245 aa  57.8  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.354376 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3411  periplasmic protein-like  29.68 
 
 		 258 aa  56.6  0.0000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.456273  normal  0.679918 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3216  hypothetical protein  27.27 
 
 		 290 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.383094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2194  hypothetical protein  24.73 
 
 		 273 aa  54.7  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.988772  normal  0.764817 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1755  periplasmic protein-like protein  30.6 
 
 		 233 aa  54.3  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3068  hypothetical protein  27.33 
 
 		 240 aa  52.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.542381  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3795  hypothetical protein  34.41 
 
 		 240 aa  51.2  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.085145  normal  0.591009 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1730  hypothetical protein  28.92 
 
 		 251 aa  51.2  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.506281 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1104  hypothetical protein  26.54 
 
 		 268 aa  50.1  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.720924  normal  0.156334 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1411  periplasmic protein-like protein  26.22 
 
 		 302 aa  47.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.202803  normal  0.391906 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5203  hypothetical protein  24.11 
 
 		 407 aa  43.9  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.297257 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0811  hypothetical protein  28.49 
 
 		 275 aa  43.5  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.407181  normal  0.406558 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6360  lipoprotein  30.77 
 
 		 296 aa  43.5  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.419648 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>