23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0974 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0974  hypothetical protein  100 
 
 		 189 aa  384  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10680  hypothetical protein  93.65 
 
 		 189 aa  366  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1526  periplasmic protein-like protein  52.97 
 
 		 185 aa  184  9e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0352336  normal  0.908264 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1220  putative secreted protein  27.37 
 
 		 387 aa  67.4  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.789164  normal  0.0187345 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1755  periplasmic protein-like protein  26.71 
 
 		 233 aa  62  0.000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0958  periplasmic protein-like protein  28.57 
 
 		 439 aa  59.3  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.347845  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3251  hypothetical protein  28.92 
 
 		 278 aa  59.3  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3411  periplasmic protein-like  30 
 
 		 258 aa  58.2  0.00000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.456273  normal  0.679918 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3068  hypothetical protein  30.67 
 
 		 240 aa  57  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.542381  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3795  hypothetical protein  30.67 
 
 		 240 aa  56.6  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.085145  normal  0.591009 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3898  hypothetical protein  28.93 
 
 		 245 aa  54.7  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.354376 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3760  hypothetical protein  27.34 
 
 		 262 aa  54.7  0.0000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.019501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2425  hypothetical protein  27.71 
 
 		 263 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.524808  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04779  hypothetical protein  27.2 
 
 		 259 aa  50.1  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1514  periplasmic protein-like protein  25 
 
 		 302 aa  48.9  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0326247  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1411  periplasmic protein-like protein  24.29 
 
 		 302 aa  46.6  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.202803  normal  0.391906 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5126  hypothetical protein  27.07 
 
 		 307 aa  45.4  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1104  hypothetical protein  30.59 
 
 		 268 aa  43.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.720924  normal  0.156334 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2194  hypothetical protein  30.34 
 
 		 273 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.988772  normal  0.764817 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3205  hypothetical protein  28.3 
 
 		 351 aa  42.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.87511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3216  hypothetical protein  32.31 
 
 		 290 aa  42  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.383094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3275  hypothetical protein  27.96 
 
 		 273 aa  42  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.523463 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6360  lipoprotein  27.69 
 
 		 296 aa  41.2  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.419648 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>