28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3577 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_3577  hypothetical protein  100 
 
 		 444 aa  842    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.147247  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3695  hypothetical protein  76.85 
 
 		 445 aa  628  1e-179  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.555947 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3386  hypothetical protein  76.18 
 
 		 446 aa  598  1e-170  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.742104 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4663  hypothetical protein  51.91 
 
 		 481 aa  278  9e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.320364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1432  hypothetical protein  57.2 
 
 		 416 aa  241  2e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000441497 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2694  periplasmic protein-like protein  39.51 
 
 		 576 aa  94  5e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.361508  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03125  hypothetical protein  29.57 
 
 		 537 aa  79.7  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.516059 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1892  hypothetical protein  33.54 
 
 		 285 aa  73.2  0.000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.769847 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4146  hypothetical protein  31.34 
 
 		 537 aa  70.1  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.136776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4034  putative transmembrane protein  31.34 
 
 		 537 aa  70.1  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2425  hypothetical protein  33.53 
 
 		 263 aa  62.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.524808  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3216  hypothetical protein  37.86 
 
 		 290 aa  55.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.383094  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1514  periplasmic protein-like protein  37.78 
 
 		 302 aa  53.9  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0326247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0194  hypothetical protein  27.78 
 
 		 224 aa  53.1  0.000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.598443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1411  periplasmic protein-like protein  38.89 
 
 		 302 aa  50.1  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.202803  normal  0.391906 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2194  hypothetical protein  35.79 
 
 		 273 aa  50.1  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.988772  normal  0.764817 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3251  hypothetical protein  35.92 
 
 		 278 aa  49.7  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3275  hypothetical protein  35.79 
 
 		 273 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.523463 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0811  hypothetical protein  30.83 
 
 		 275 aa  48.5  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.407181  normal  0.406558 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4155  hypothetical protein  34.65 
 
 		 240 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.126669 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2399  hypothetical protein  31.03 
 
 		 226 aa  47.4  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00252121  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1472  hypothetical protein  30.12 
 
 		 233 aa  47.4  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00176011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01542  hypothetical protein  38.6 
 
 		 236 aa  47  0.0007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3411  periplasmic protein-like  28.83 
 
 		 258 aa  47  0.0007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.456273  normal  0.679918 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1329  hypothetical protein  31.97 
 
 		 234 aa  45.4  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.000146191  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3068  hypothetical protein  35.78 
 
 		 240 aa  45.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.542381  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3760  hypothetical protein  35.58 
 
 		 262 aa  44.3  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.019501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3795  hypothetical protein  35.78 
 
 		 240 aa  44.7  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.085145  normal  0.591009 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>