47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0847 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_1135  outer membrane autotransporter barrel domain protein  48.35 
 
 		 960 aa  790    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0847  outer membrane autotransporter barrel domain protein  100 
 
 		 1004 aa  2026    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3734  Outer membrane autotransporter barrel  24.57 
 
 		 1001 aa  67.8  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29394 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2865  outer membrane autotransporter  27.92 
 
 		 994 aa  65.5  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2683  Outer membrane autotransporter barrel  24.91 
 
 		 983 aa  65.1  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.525643  hitchhiker  0.000404465 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3082  outer membrane autotransporter  24.52 
 
 		 1164 aa  63.9  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.184876  normal  0.275156 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3532  outer membrane autotransporter  25.54 
 
 		 1152 aa  62  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3385  outer membrane autotransporter  27.94 
 
 		 972 aa  61.6  0.00000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.308218 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3587  outer membrane autotransporter  24.51 
 
 		 1011 aa  61.2  0.00000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.334084  normal  0.0742158 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1649  autotransporter, putative  23.89 
 
 		 1001 aa  60.5  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2277  outer membrane autotransporter  24.03 
 
 		 980 aa  60.8  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356388 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5637  Outer membrane autotransporter barrel  26.38 
 
 		 985 aa  56.6  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.217038  normal  0.176654 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1123  outer membrane autotransporter  24.58 
 
 		 1062 aa  55.8  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.948475  normal  0.876639 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1611  putative serine protease  23.73 
 
 		 991 aa  55.8  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18630  putative serine protease  22.7 
 
 		 995 aa  55.1  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.169589 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2684  Outer membrane autotransporter barrel  24.83 
 
 		 1028 aa  54.7  0.000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.335444  unclonable  0.0000368637 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1203  outer membrane autotransporter  26.92 
 
 		 1769 aa  53.9  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3216  hypothetical protein  37.93 
 
 		 290 aa  53.9  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.383094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2194  hypothetical protein  39.08 
 
 		 273 aa  54.3  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.988772  normal  0.764817 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3061  outer membrane autotransporter  23.38 
 
 		 677 aa  53.5  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.26513 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3064  outer membrane autotransporter  25.14 
 
 		 638 aa  51.6  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3275  hypothetical protein  32.79 
 
 		 273 aa  51.6  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.523463 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2985  putative autotransporter protein  25.14 
 
 		 638 aa  51.6  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3162  putative hemagglutinin-related protein  25.33 
 
 		 1012 aa  51.2  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0714  autotransporter, putative  21.62 
 
 		 763 aa  50.8  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4267  outer membrane autotransporter  23.91 
 
 		 939 aa  50.8  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1104  hypothetical protein  31.58 
 
 		 268 aa  51.2  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.720924  normal  0.156334 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2425  hypothetical protein  37.5 
 
 		 263 aa  49.3  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.524808  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0132  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.07 
 
 		 972 aa  49.7  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0892  autotransporter, putative  24.03 
 
 		 1016 aa  49.3  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2875  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.17 
 
 		 1848 aa  49.3  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.189813 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1888  putative autotransporter protein  24.57 
 
 		 638 aa  48.9  0.0005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0815512  hitchhiker  0.00028295 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0620  Outer membrane autotransporter barrel  20.37 
 
 		 759 aa  48.1  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.553237 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4066  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.73 
 
 		 1081 aa  48.5  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.392825  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5638  Outer membrane autotransporter barrel  25.9 
 
 		 488 aa  47.4  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.190969  normal  0.144242 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5838  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25 
 
 		 1227 aa  47.8  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3251  hypothetical protein  32.32 
 
 		 278 aa  47.4  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5186  outer membrane autotransporter  26.13 
 
 		 1056 aa  46.2  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3729  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.48 
 
 		 913 aa  46.2  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0194  hypothetical protein  42.55 
 
 		 224 aa  45.8  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.598443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4737  outer membrane autotransporter  26.82 
 
 		 1033 aa  45.8  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4738  outer membrane autotransporter  26.82 
 
 		 1004 aa  45.4  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3411  periplasmic protein-like  27.45 
 
 		 258 aa  45.1  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.456273  normal  0.679918 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3386  hypothetical protein  37.68 
 
 		 446 aa  44.7  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.742104 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3695  hypothetical protein  37.68 
 
 		 445 aa  44.7  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.555947 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24360  hypothetical protein  32.43 
 
 		 974 aa  44.3  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.861832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1082  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.92 
 
 		 915 aa  44.7  0.01  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>