44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1135 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_1135  outer membrane autotransporter barrel domain protein  100 
 
 		 960 aa  1918    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0847  outer membrane autotransporter barrel domain protein  49.95 
 
 		 1004 aa  807    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2865  outer membrane autotransporter  27.17 
 
 		 994 aa  65.5  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2277  outer membrane autotransporter  27.46 
 
 		 980 aa  65.5  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356388 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3162  putative hemagglutinin-related protein  27.16 
 
 		 1012 aa  63.9  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3082  outer membrane autotransporter  24.52 
 
 		 1164 aa  60.5  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.184876  normal  0.275156 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3734  Outer membrane autotransporter barrel  24.92 
 
 		 1001 aa  59.3  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29394 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0714  autotransporter, putative  23.08 
 
 		 763 aa  58.5  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3061  outer membrane autotransporter  24.23 
 
 		 677 aa  57.4  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.26513 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3385  outer membrane autotransporter  29.27 
 
 		 972 aa  57.4  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.308218 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4267  outer membrane autotransporter  24.74 
 
 		 939 aa  57.4  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1649  autotransporter, putative  25 
 
 		 1001 aa  56.6  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0132  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.11 
 
 		 972 aa  57  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2512  Outer membrane autotransporter barrel  26.62 
 
 		 1019 aa  55.5  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.150059 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2683  Outer membrane autotransporter barrel  23.32 
 
 		 983 aa  55.8  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.525643  hitchhiker  0.000404465 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5637  Outer membrane autotransporter barrel  24.88 
 
 		 985 aa  55.1  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.217038  normal  0.176654 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1123  outer membrane autotransporter  24.58 
 
 		 1062 aa  54.7  0.000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.948475  normal  0.876639 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3064  outer membrane autotransporter  23 
 
 		 638 aa  54.3  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3532  outer membrane autotransporter  23.74 
 
 		 1152 aa  54.3  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2985  putative autotransporter protein  23 
 
 		 638 aa  54.3  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18630  putative serine protease  23.05 
 
 		 995 aa  53.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.169589 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0449  Outer membrane autotransporter barrel  25.95 
 
 		 816 aa  52.4  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.761733 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1611  putative serine protease  24.78 
 
 		 991 aa  52  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3587  outer membrane autotransporter  22.88 
 
 		 1011 aa  51.6  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.334084  normal  0.0742158 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1888  putative autotransporter protein  22.65 
 
 		 638 aa  52  0.00006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0815512  hitchhiker  0.00028295 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5638  Outer membrane autotransporter barrel  24.15 
 
 		 488 aa  51.6  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.190969  normal  0.144242 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2875  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.29 
 
 		 1848 aa  50.4  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.189813 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1203  outer membrane autotransporter  25.75 
 
 		 1769 aa  49.7  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1650  autotransporter, putative  24.01 
 
 		 1055 aa  50.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4066  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.71 
 
 		 1081 aa  50.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.392825  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2684  Outer membrane autotransporter barrel  22.89 
 
 		 1028 aa  50.1  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.335444  unclonable  0.0000368637 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0620  Outer membrane autotransporter barrel  20.81 
 
 		 759 aa  48.5  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.553237 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5186  outer membrane autotransporter  26.35 
 
 		 1056 aa  47.4  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3733  Outer membrane autotransporter barrel  22.31 
 
 		 1038 aa  47.8  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418268  normal  0.311183 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5838  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.64 
 
 		 1227 aa  45.8  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0488  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.91 
 
 		 774 aa  45.4  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.510592  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0480  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.01 
 
 		 1029 aa  45.4  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.876293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1975  Outer membrane autotransporter  26.09 
 
 		 1111 aa  45.4  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0892  autotransporter, putative  22.64 
 
 		 1016 aa  45.1  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3958  putative outer membrane autotransporter barrel precursor  30.49 
 
 		 907 aa  45.1  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2694  periplasmic protein-like protein  31.86 
 
 		 576 aa  44.7  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.361508  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3844  outer membrane autotransporter barrel domain protein  20.99 
 
 		 926 aa  44.7  0.009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7237  putative outer membrane autotransporter barrel precursor  28.21 
 
 		 882 aa  44.7  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2458  outer membrane autotransporter  23.29 
 
 		 1369 aa  44.3  0.01  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00908706  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>