28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_4470 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_5833  putative lipoprotein  100 
 
 
291 aa  601  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.077855  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4470  putative lipoprotein  100 
 
 
291 aa  601  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.259043  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3898  putative lipoprotein  100 
 
 
291 aa  601  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.732768  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0314  putative lipoprotein  60.68 
 
 
295 aa  348  4e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000419793  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0123  hypothetical protein  65.57 
 
 
244 aa  332  5e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0107  hypothetical protein  65.16 
 
 
244 aa  330  2e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0179409  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3785  hypothetical protein  57.14 
 
 
570 aa  112  6e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.477688 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4308  hypothetical protein  52.43 
 
 
413 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2133  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  50 
 
 
436 aa  99  8e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0279976 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4726  hypothetical protein  41.28 
 
 
339 aa  80.1  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.62609  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3702  hypothetical protein  43.06 
 
 
206 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2634  hypothetical protein  40.28 
 
 
192 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.579802  normal  0.658487 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3268  hypothetical protein  48.53 
 
 
125 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1492  hypothetical protein  37.35 
 
 
222 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.176688  normal  0.453019 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4591  hypothetical protein  38.57 
 
 
166 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11574  lipoprotein lprI  32.74 
 
 
197 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3927  hypothetical protein  46.3 
 
 
214 aa  48.5  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1249  hypothetical protein  36.36 
 
 
315 aa  47.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7075  lipoprotein-like protein  36.05 
 
 
245 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.446576 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6415  hypothetical protein  36.05 
 
 
245 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.754601 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1414  hypothetical protein  36.05 
 
 
245 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5702  hypothetical protein  35.29 
 
 
100 aa  46.6  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.667293  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5200  hypothetical protein  38.96 
 
 
306 aa  46.6  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.782608  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5126  hypothetical protein  38.96 
 
 
307 aa  45.8  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0822  hypothetical protein  28.89 
 
 
262 aa  43.1  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.38987  normal  0.157917 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6360  lipoprotein  34.15 
 
 
296 aa  42.7  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.419648 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2266  hypothetical protein  30.68 
 
 
497 aa  42.4  0.009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0626  hypothetical protein  31.58 
 
 
405 aa  42.4  0.01  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>